The role of topology on protein thermal stability
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Especial, João N. C., Teixeira, Beatriz P., Nunes, Ana, Machuqueiro, Miguel, Faísca, Patrícia F. N. |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Topological Enhancement of Protein Kinetic Stability
di: Especial, João NC, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Especial, João NC, et al.
Pubblicazione: (2026)
Reinforcement-guided generative protein language models enable de novo design of highly diverse AAV capsids
di: Ferraz, Lucas, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Ferraz, Lucas, et al.
Pubblicazione: (2026)
Disordered But Rhythmic: the role of intrinsic protein disorder in eukaryotic circadian timing
di: Usher, Emery T., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Usher, Emery T., et al.
Pubblicazione: (2025)
TopoQA: a topological deep learning-based approach for protein complex structure interface quality assessment
di: Han, Bingqing, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Han, Bingqing, et al.
Pubblicazione: (2024)
Molecular glues stabilize water-mediated hydrogen bonds in ternary complexes
di: Mathur, Apoorva, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Mathur, Apoorva, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structural-dynamic behavior of histamine in solution: the role of water models
di: Gavryushenko, Dmytro A., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Gavryushenko, Dmytro A., et al.
Pubblicazione: (2026)
The standard coil or globule phases cannot describe the denatured state of structured proteins and intrinsically disordered proteins
di: Righini, F., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Righini, F., et al.
Pubblicazione: (2025)
The curious case of A31P, a topology-switching mutant of the Repressor of Primer protein : A molecular dynamics study of its folding and misfolding
di: Vouzina, Olympia-Dialekti, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Vouzina, Olympia-Dialekti, et al.
Pubblicazione: (2024)
Assessment of scoring functions for computational models of protein-protein interfaces
di: Sumner, Jacob, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Sumner, Jacob, et al.
Pubblicazione: (2024)
Selection originating from protein stability/foldability: Relationships between protein folding free energy, sequence ensemble, and fitness
di: Miyazawa, Sanzo
Pubblicazione: (2016)
di: Miyazawa, Sanzo
Pubblicazione: (2016)
edible polysaccharides as stabilizers and carriers for the delivery of phenolic compounds and pigments in food formulations
di: de Oliveira, Liliane Siqueira, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: de Oliveira, Liliane Siqueira, et al.
Pubblicazione: (2025)
A review of topological data analysis and topological deep learning in molecular sciences
di: Wee, JunJie, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wee, JunJie, et al.
Pubblicazione: (2025)
Agentic AI platforms for autonomous training and rule induction of human-human and virus-human protein-protein interactions
di: Do, Hung N., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Do, Hung N., et al.
Pubblicazione: (2026)
Learning to engineer protein flexibility
di: Kouba, Petr, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Kouba, Petr, et al.
Pubblicazione: (2024)
De novo design of protein binders targeting the human sweet taste receptor as potential sweet proteins
di: Ding, Saisai, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Ding, Saisai, et al.
Pubblicazione: (2026)
Computational design of intrinsically disordered proteins
di: Tesei, Giulio, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Tesei, Giulio, et al.
Pubblicazione: (2025)
Predicting protein folding dynamics using sequence information
di: Galpern, Ezequiel A., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Galpern, Ezequiel A., et al.
Pubblicazione: (2025)
Controlled protein synthesis and spatial organisation in microfluidic environments
di: Gaizauskaite, Aukse, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Gaizauskaite, Aukse, et al.
Pubblicazione: (2025)
Aptamer-protein interaction prediction model based on transformer
di: Yan, Zhichao, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yan, Zhichao, et al.
Pubblicazione: (2025)
Multiscale differential geometry learning for protein flexibility analysis
di: Feng, Hongsong, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Feng, Hongsong, et al.
Pubblicazione: (2024)
Integrative modelling of protein-glycan interactions with HADDOCK3
di: Reys, Victor, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Reys, Victor, et al.
Pubblicazione: (2026)
De novo design of high-affinity protein binders with AlphaProteo
di: Zambaldi, Vinicius, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zambaldi, Vinicius, et al.
Pubblicazione: (2024)
A universal phase-plane model for in vivo protein aggregation
di: Cotton, Matthew W., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Cotton, Matthew W., et al.
Pubblicazione: (2025)
From sequence to protein structure and conformational dynamics with AI/ML
di: Ille, Alexander M., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ille, Alexander M., et al.
Pubblicazione: (2025)
Inferring protein folding mechanisms from natural sequence diversity
di: Galpern, Ezequiel A., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Galpern, Ezequiel A., et al.
Pubblicazione: (2024)
Fold-switching proteins push the boundaries of conformational ensemble prediction
di: Lee, Myeongsang, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Lee, Myeongsang, et al.
Pubblicazione: (2026)
Physical principles of building protein megacomplexes in a crowded milieu
di: Wang, Jiayi, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wang, Jiayi, et al.
Pubblicazione: (2026)
Persistent local Laplacian prediction of protein-ligand binding affinities
di: Liu, Jian, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Liu, Jian, et al.
Pubblicazione: (2026)
Modal Geometry Governs Proteoform Dynamics
di: Cobley, James N.
Pubblicazione: (2025)
di: Cobley, James N.
Pubblicazione: (2025)
Local Electromagnetic Fields Enable Fast Redox Sensing by Physically Accelerating Cysteine Oxidation
di: Cobley, James N.
Pubblicazione: (2025)
di: Cobley, James N.
Pubblicazione: (2025)
Towards deep learning sequence-structure co-generation for protein design
di: Wang, Chentong, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Wang, Chentong, et al.
Pubblicazione: (2024)
Training a force field for proteins and small molecules from scratch
di: Blanco-González, Alexandre, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Blanco-González, Alexandre, et al.
Pubblicazione: (2026)
Computational modeling of RNA-protein binding interactions under an external force
di: Wampler, Danielle, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wampler, Danielle, et al.
Pubblicazione: (2026)
Solvation enhances folding cooperativity and the topology dependence of folding rates in a lattice protein model
di: Nguyen, Nhung T. T., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Nguyen, Nhung T. T., et al.
Pubblicazione: (2025)
ApexGen: Simultaneous design of peptide binder sequence and structure for target proteins
di: Xia, Xiaoqiong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Xia, Xiaoqiong, et al.
Pubblicazione: (2025)
Evaluating and Scoring Ebolavirus Protein-protein Docking Models Using PIsToN
di: Shirali, Azam, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Shirali, Azam, et al.
Pubblicazione: (2025)
Applying computational protein design to therapeutic antibody discovery -- current state and perspectives
di: Bielska, Weronika, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Bielska, Weronika, et al.
Pubblicazione: (2025)
Out-of-equilibrium selection pressure enhances inference from protein sequence data
di: Dietler, Nicola, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Dietler, Nicola, et al.
Pubblicazione: (2026)
AlphaFold2 for protein structure prediction: Best practices and critical analyses
di: Radjasandirane, Ragousandirane, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Radjasandirane, Ragousandirane, et al.
Pubblicazione: (2024)
Frontiers in integrative structural biology: modeling disordered proteins and utilizing in situ data
di: Majila, Kartik, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Majila, Kartik, et al.
Pubblicazione: (2024)
Documenti analoghi
-
Topological Enhancement of Protein Kinetic Stability
di: Especial, João NC, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Reinforcement-guided generative protein language models enable de novo design of highly diverse AAV capsids
di: Ferraz, Lucas, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Disordered But Rhythmic: the role of intrinsic protein disorder in eukaryotic circadian timing
di: Usher, Emery T., et al.
Pubblicazione: (2025) -
TopoQA: a topological deep learning-based approach for protein complex structure interface quality assessment
di: Han, Bingqing, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Molecular glues stabilize water-mediated hydrogen bonds in ternary complexes
di: Mathur, Apoorva, et al.
Pubblicazione: (2025)