Explainable deep learning framework for cancer therapeutic target prioritization leveraging PPI centrality and node embeddings
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Alkhadrawi, Adham M., Kim, Kyungsu, Rahman, Arif M., Alotaibi, Fahad Mushabbab G. |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2025
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
Modeling therapy sequence for advanced cancer: A microsimulation approach leveraging Electronic Health Record data
von: Handorf, Elizabeth A., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Handorf, Elizabeth A., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Integrating protein sequence embeddings with structure via graph-based deep learning for single-residue property prediction
von: Michalewicz, Kevin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Michalewicz, Kevin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
An application of node and edge nonlinear hypergraph centrality to a protein complex hypernetwork
von: Lawson, Sarah, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lawson, Sarah, et al.
Veröffentlicht: (2024)
A practical identifiability criterion leveraging weak-form parameter estimation
von: Heitzman-Breen, Nora, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Heitzman-Breen, Nora, et al.
Veröffentlicht: (2025)
GPCR-Filter: a deep learning framework for efficient and precise GPCR modulator discovery
von: Ning, Jingjie, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Ning, Jingjie, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Geometric deep learning assists protein engineering. Opportunities and Challenges
von: García-Vinuesa, Julián, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: García-Vinuesa, Julián, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Analyzing animal movement using deep learning
von: Fronville, Thibault, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Fronville, Thibault, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Physics-informed deep learning for infectious disease forecasting
von: Qian, Ying, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Qian, Ying, et al.
Veröffentlicht: (2025)
PPI-Net connects molecular protein interactions to functional processes in disease
von: Higgins, Kyle, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Higgins, Kyle, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Practical and scalable simulations of non-Markovian stochastic processes and temporal networks with individual node properties
von: Pelissier, Aurelien, et al.
Veröffentlicht: (2022)
von: Pelissier, Aurelien, et al.
Veröffentlicht: (2022)
Label-free pathological subtyping of non-small cell lung cancer using deep classification and virtual immunohistochemical staining
von: Zang, Zhenya, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zang, Zhenya, et al.
Veröffentlicht: (2025)
ECKO: Explainable Clinical Knowledge for Oncology
von: Silva, Marta Contreiras, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Silva, Marta Contreiras, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Dual network structure of the AV node
von: Maltsev, Anna V., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Maltsev, Anna V., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Opportunities in deep learning methods development for computational biology
von: Lee, Alex Jihun, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lee, Alex Jihun, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Quantum machine learning framework for longitudinal biomedical studies
von: Demidik, Maria, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Demidik, Maria, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Non-Contact and Non-Destructive Detection of Structural Defects in Bioprinted Constructs Using Video-Based Vibration Analysis
von: Rahman, Md Anisur, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Rahman, Md Anisur, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Protein generation with embedding learning for motif diversification
von: Michalewicz, Kevin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Michalewicz, Kevin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Epidemic-guided deep learning for spatiotemporal forecasting of Tuberculosis outbreak
von: Barman, Madhab, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Barman, Madhab, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Predicting discrete-time bifurcations with deep learning
von: Bury, Thomas M., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Bury, Thomas M., et al.
Veröffentlicht: (2023)
deepNoC: A deep learning system to assign the number of contributors to a short tandem repeat DNA profile
von: Taylor, Duncan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Taylor, Duncan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
GraphAge: Unleashing the power of Graph Neural Network to Decode Epigenetic Aging
von: Ahmed, Saleh Sakib, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Ahmed, Saleh Sakib, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Evaluation of neuroCombat and deep learning harmonization for multi-site magnetic resonance neuroimaging in youth with prenatal alcohol exposure
von: Scholten, Chloe, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Scholten, Chloe, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Drug-target interaction prediction by integrating heterogeneous information with mutual attention network
von: Zhang, Yuanyuan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhang, Yuanyuan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
ProDock: From multi-target consensus docking into database-backed storage
von: Phan, Tieu-Long, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Phan, Tieu-Long, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Disentangling coincident cell events using deep transfer learning and compressive sensing
von: Leuthner, Moritz, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Leuthner, Moritz, et al.
Veröffentlicht: (2025)
DeepDR: an integrated deep-learning model web server for drug repositioning
von: Jin, Shuting, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Jin, Shuting, et al.
Veröffentlicht: (2025)
stEnTrans: Transformer-based deep learning for spatial transcriptomics enhancement
von: Xue, Shuailin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Xue, Shuailin, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Fast, accurate measurement of the worker populations of honey bee colonies using deep learning
von: Zhong, Junmin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zhong, Junmin, et al.
Veröffentlicht: (2025)
DeepLINK-T: deep learning inference for time series data using knockoffs and LSTM
von: Zuo, Wenxuan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zuo, Wenxuan, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Explainable Deep Learning Framework for SERS Bio-quantification
von: Zaki, Jihan K., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zaki, Jihan K., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Domain-Adversarial Neural Network and Explainable AI for Reducing Tissue-of-Origin Signal in Pan-cancer Mortality Classification
von: Padron-Manrique, Cristian, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Padron-Manrique, Cristian, et al.
Veröffentlicht: (2025)
An algorithmic framework for synthetic cost-aware decision making in molecular design
von: Fromer, Jenna C., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Fromer, Jenna C., et al.
Veröffentlicht: (2023)
GraPPI: A Retrieve-Divide-Solve GraphRAG Framework for Large-scale Protein-protein Interaction Exploration
von: Li, Ziwen, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Li, Ziwen, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Multilevel classification framework for breast cancer cell selection and its integration with advanced disease models
von: Jones, Catarina Franco, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Jones, Catarina Franco, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Data mining of public genomic repositories: harnessing off-target reads to expand microbial pathogen genomic resources
von: Richard, Damien, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Richard, Damien, et al.
Veröffentlicht: (2025)
HyperEvoGen: Exploring deep phylogeny using non-Euclidean variational inference
von: Lamanna, Jason, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Lamanna, Jason, et al.
Veröffentlicht: (2026)
LASSO-ODE: A framework for mechanistic model identifiability and selection in disease transmission modeling
von: Tan, Jiale, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Tan, Jiale, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Stochastic network epidemic model and particle filter: General framework and application to influenza in Japan
von: Haq, Ihtisham Ul, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Haq, Ihtisham Ul, et al.
Veröffentlicht: (2026)
A computational framework for optimal and Model Predictive Control of stochastic gene regulatory networks
von: Faquir, Hamza, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Faquir, Hamza, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Quantifying sex differences in brain network topology by aggregating nodal centrality rankings
von: Chen, Wenyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Chen, Wenyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Ähnliche Einträge
-
Modeling therapy sequence for advanced cancer: A microsimulation approach leveraging Electronic Health Record data
von: Handorf, Elizabeth A., et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Integrating protein sequence embeddings with structure via graph-based deep learning for single-residue property prediction
von: Michalewicz, Kevin, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
An application of node and edge nonlinear hypergraph centrality to a protein complex hypernetwork
von: Lawson, Sarah, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
A practical identifiability criterion leveraging weak-form parameter estimation
von: Heitzman-Breen, Nora, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
GPCR-Filter: a deep learning framework for efficient and precise GPCR modulator discovery
von: Ning, Jingjie, et al.
Veröffentlicht: (2026)