Buchumschlag

A Hybrid Computational Intelligence Framework for scRNA-seq Imputation: Integrating scRecover and Random Forests

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Anaissi, Ali, Liu, Deshao, Jia, Yuanzhe, Huang, Weidong, Alyassine, Widad, Akram, Junaid
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2025
Schlagworte:	Machine Learning Genomics
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

scX: A user-friendly tool for scRNA-seq exploration
von: Waichman, Tomás Vega, et al.
Veröffentlicht: (2023)

scReader: Prompting Large Language Models to Interpret scRNA-seq Data
von: Li, Cong, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scInterpreter: Training Large Language Models to Interpret scRNA-seq Data for Cell Type Annotation
von: Li, Cong, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Mix-Geneformer: Unified Representation Learning for Human and Mouse scRNA-seq Data
von: Nishio, Yuki, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Hypergraph Representations of scRNA-seq Data for Improved Clustering with Random Walks
von: He, Wan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Partial domain adaptation enables cross domain cell type annotation between scRNA-seq and snRNA-seq
von: Chen, Xiran, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Modeling Temporal scRNA-seq Data with Latent Gaussian Process and Optimal Transport
von: Balik, Mehmet Yigit, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Bipartite Graph Attention-based Clustering for Large-scale scRNA-seq Data
von: Liang, Zhuomin, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Meta-analysis of scRNA-seq data for choroidal endothelial cells in dry Age-related Macular Degeneration
von: Veksler, Kyle M., et al.
Veröffentlicht: (2026)

Simultaneously Infer Cell Pseudotime,Velocity Field and Gene Interaction from Multi-Branch scRNA-seq Data with scPN
von: Zhou, Zhen, et al.
Veröffentlicht: (2024)

SpaDiT: Diffusion Transformer for Spatial Gene Expression Prediction using scRNA-seq
von: Li, Xiaoyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Global Ground Metric Learning with Applications to scRNA data
von: Kühn, Damin, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Pan-cancer gene set discovery via scRNA-seq for optimal deep learning based downstream tasks
von: Kim, Jong Hyun, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Diversity by Design: Addressing Mode Collapse Improves scRNA-seq Perturbation Modeling on Well-Calibrated Metrics
von: Mejia, Gabriel M., et al.
Veröffentlicht: (2025)

Graph Structure Learning for Tumor Microenvironment with Cell Type Annotation from non-spatial scRNA-seq data
von: Huang, Yu-An, et al.
Veröffentlicht: (2025)

LapDDPM: A Conditional Graph Diffusion Model for scRNA-seq Generation with Spectral Adversarial Perturbations
von: Bini, Lorenzo, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scBench: Evaluating AI Agents on Single-Cell RNA-seq Analysis
von: Workman, Kenny, et al.
Veröffentlicht: (2026)

ltirloni/Ixsc-scRNA-seq: Ixsc-scRNA-seq
von: Lucas Tirloni
Veröffentlicht: (2026)

scRDiT: Generating single-cell RNA-seq data by diffusion transformers and accelerating sampling
von: Dong, Shengze, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scASDC: Attention Enhanced Structural Deep Clustering for Single-cell RNA-seq Data
von: Min, Wenwen, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scShapeBench: Discovering geometry from high dimensional scRNAseq data
von: Steindl, Andrew J, et al.
Veröffentlicht: (2026)

scCDCG: Efficient Deep Structural Clustering for single-cell RNA-seq via Deep Cut-informed Graph Embedding
von: Xu, Ping, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scRecover : Discriminating True and False Zeros in Single‐Cell RNA ‐Seq Data for Imputation
von: Zhun Miao, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scVGAE: A Novel Approach using ZINB-Based Variational Graph Autoencoder for Single-Cell RNA-Seq Imputation
von: Inoue, Yoshitaka
Veröffentlicht: (2024)

scRNA-seq and bulk RNA-seq of PBMC
von: Ludwig-Maximilians-Universität München
Veröffentlicht: (2025)

scUnified: An AI-Ready Standardized Resource for Single-Cell RNA Sequencing Analysis
von: Xu, Ping, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scCluBench: Comprehensive Benchmarking of Clustering Algorithms for Single-Cell RNA Sequencing
von: Xu, Ping, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scSiameseClu: A Siamese Clustering Framework for Interpreting single-cell RNA Sequencing Data
von: Xu, Ping, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scMamba: A Pre-Trained Model for Single-Nucleus RNA Sequencing Analysis in Neurodegenerative Disorders
von: Oh, Gyutaek, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scRNA-seq of preeclamptic trophoblasts identifies EBI3, COL17A1, miR-27a-5p, and miR-193b-5p as hypoxia markers: validation of neuradapt as a superior mimetic to cobalt chloride
von: Knyazev, Evgeny, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scGSDR: Harnessing Gene Semantics for Single-Cell Pharmacological Profiling
von: Huang, Yu-An, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scRNA-seq clustering datasets for PFDL-SC
von: Sun, Guicong
Veröffentlicht: (2026)

scRNA-seq Analysis of Microbiome BBB Effects
von: Zemmel, Zachary
Veröffentlicht: (2025)

KentaNitahara/Chd8_scRNA-seq: Chd8_scRNAseq
von: akwamura
Veröffentlicht: (2026)

HybridQC: Machine Learning-Augmented Quality Control for Single-Cell RNA-seq Data
von: Lai, Kaitao
Veröffentlicht: (2025)

scGHSOM: Hierarchical clustering and visualization of single-cell and CRISPR data using growing hierarchical SOM
von: Wen, Shang-Jung, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scPilot: Large Language Model Reasoning Toward Automated Single-Cell Analysis and Discovery
von: Gao, Yiming, et al.
Veröffentlicht: (2026)

scTree: Discovering Cellular Hierarchies in the Presence of Batch Effects in scRNA-seq Data
von: Vandenhirtz, Moritz, et al.
Veröffentlicht: (2024)

sc-OTGM: Single-Cell Perturbation Modeling by Solving Optimal Mass Transport on the Manifold of Gaussian Mixtures
von: Demir, Andac, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Donor-Aware scRNA-seq Benchmarks for IBD Classification
von: Muhire, Jonathan
Veröffentlicht: (2026)