Multi-scale Graph Autoregressive Modeling: Molecular Property Prediction via Next Token Prediction
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Jiang, Zhuoyang, Min, Yaosen, Jin, Peiran, Chen, Lei |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2026
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| Schlagworte: | |
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