Investigating Knowledge Distillation Through Neural Networks for Protein Binding Affinity Prediction
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Abbasi, Wajid Arshad, Abbas, Syed Ali, Bibi, Maryum, Andleeb, Saiqa, Akhtar, Muhammad Naveed |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2026
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
Single-Cell Proteomic Technologies: Tools in the quest for principles
von: Slavov, Nikolai
Veröffentlicht: (2025)
von: Slavov, Nikolai
Veröffentlicht: (2025)
Examining the Link Between Peroxiredoxin Proteins and Mutually Exclusive Transcription Factor Activation With a Mathematical Model
von: Schlamowitz, Zachary, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Schlamowitz, Zachary, et al.
Veröffentlicht: (2024)
On Machine Learning Approaches for Protein-Ligand Binding Affinity Prediction
von: Schapin, Nikolai, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Schapin, Nikolai, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Extreme Gradient Boosting Beats In‐Silico Identification of Proteins Potentially Associated With Alzheimer’s
von: Sadia Khalil, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Sadia Khalil, et al.
Veröffentlicht: (2024)
From Static to Dynamic Structures: Improving Binding Affinity Prediction with Graph-Based Deep Learning
von: Min, Yaosen, et al.
Veröffentlicht: (2022)
von: Min, Yaosen, et al.
Veröffentlicht: (2022)
Leveraging Machine Learning Models for Peptide-Protein Interaction Prediction
von: Yin, Song, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Yin, Song, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Predicting Protein-Nucleic Acid Flexibility Using Persistent Sheaf Laplacians
von: Hayes, Nicole, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Hayes, Nicole, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Reading the Cell, Designing the Cure: Perturbation-Conditioned Molecular Diffusion for Function-Oriented Drug Design
von: Xu, Ziyu, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Xu, Ziyu, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Infer metabolic velocities from moment differences of molecular weight distributions
von: Tuobang, Li
Veröffentlicht: (2024)
von: Tuobang, Li
Veröffentlicht: (2024)
Frequency-Space Mechanics: A Sequence and Coordinate-Free Representation for Protein Function Prediction
von: Reilly, Charles B
Veröffentlicht: (2026)
von: Reilly, Charles B
Veröffentlicht: (2026)
Interpretable Multimodal Learning for Tumor Protein-Metal Binding: Progress, Challenges, and Perspectives
von: Liu, Xiaokun, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Liu, Xiaokun, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Protein-Mamba: Biological Mamba Models for Protein Function Prediction
von: Xu, Bohao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Xu, Bohao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Endowing Protein Language Models with Structural Knowledge
von: Chen, Dexiong, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Chen, Dexiong, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Persistent Sheaf Laplacian Analysis of Protein Flexibility
von: Hayes, Nicole, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Hayes, Nicole, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Impact of Force Field Polarization on Correlated Motions of Proteins
von: Milinski, Ana, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Milinski, Ana, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Scoring-Assisted Generative Exploration for Proteins (SAGE-Prot): A Framework for Multi-Objective Protein Optimization via Iterative Sequence Generation and Evaluation
von: Lim, Hocheol, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Lim, Hocheol, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Towards a Unified Framework for Determining Conformational Ensembles of Disordered Proteins
von: Ghafouri, Hamidreza, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Ghafouri, Hamidreza, et al.
Veröffentlicht: (2025)
VARIANT: Web Server for Decoding and Analyzing Viral Mutations at Genome and Protein Levels
von: Wang, Rui, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Wang, Rui, et al.
Veröffentlicht: (2026)
LAFA: A Framework for Reproducible Longitudinal Assessment of Protein Function Annotation Models
von: Phan, An, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Phan, An, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Characterizing the Conformational States of G Protein Coupled Receptors Generated with AlphaFold
von: Chib, Garima, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Chib, Garima, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Co-Evolution-Based Metal-Binding Residue Prediction with Graph Neural Networks
von: Rastegari, Sayedmohammadreza, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Rastegari, Sayedmohammadreza, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Protein folding classes -- High-dimensional geometry of amino acid composition space revisited
von: Mao, Boryeu
Veröffentlicht: (2025)
von: Mao, Boryeu
Veröffentlicht: (2025)
ProLLM: Protein Chain-of-Thoughts Enhanced LLM for Protein-Protein Interaction Prediction
von: Jin, Mingyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Jin, Mingyu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Fusing Neural and Physical: Augment Protein Conformation Sampling with Tractable Simulations
von: Lu, Jiarui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lu, Jiarui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Protriever: End-to-End Differentiable Protein Homology Search for Fitness Prediction
von: Weitzman, Ruben, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Weitzman, Ruben, et al.
Veröffentlicht: (2025)
TriFit: Trimodal Fusion with Protein Dynamics for Mutation Fitness Prediction
von: Cho, Seungik
Veröffentlicht: (2026)
von: Cho, Seungik
Veröffentlicht: (2026)
DeepRetro: Retrosynthetic Pathway Discovery using Iterative LLM Reasoning
von: Sathyanarayana, Shreyas Vinaya, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Sathyanarayana, Shreyas Vinaya, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Substrate Prediction for RiPP Biosynthetic Enzymes via Masked Language Modeling and Transfer Learning
von: Clark, Joseph D., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Clark, Joseph D., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Explainable Machine Learning and Deep Learning Models for Predicting TAS2R-Bitter Molecule Interactions
von: Ferri, Francesco, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Ferri, Francesco, et al.
Veröffentlicht: (2024)
A Multi-Grained Symmetric Differential Equation Model for Learning Protein-Ligand Binding Dynamics
von: Liu, Shengchao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Liu, Shengchao, et al.
Veröffentlicht: (2024)
DDoS: A Graph Neural Network based Drug Synergy Prediction Algorithm
von: Schwarz, Kyriakos, et al.
Veröffentlicht: (2022)
von: Schwarz, Kyriakos, et al.
Veröffentlicht: (2022)
Evolutionary Profiles for Protein Fitness Prediction
von: Fan, Jigang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Fan, Jigang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Protein Fold Classification at Scale: Benchmarking and Pretraining
von: Chen, Dexiong, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Chen, Dexiong, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Improving Protein Optimization with Smoothed Fitness Landscapes
von: Kirjner, Andrew, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Kirjner, Andrew, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Conditioning Protein Generation via Hopfield Pattern Multiplicity
von: Varner, Jeffrey D.
Veröffentlicht: (2026)
von: Varner, Jeffrey D.
Veröffentlicht: (2026)
Enhancing Protein Predictive Models via Proteins Data Augmentation: A Benchmark and New Directions
von: Sun, Rui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Sun, Rui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
AbBiBench: A Benchmark for Antibody Binding Affinity Maturation and Design
von: Zhao, Xinyan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zhao, Xinyan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
ODBO: Bayesian Optimization with Search Space Prescreening for Directed Protein Evolution
von: Cheng, Lixue, et al.
Veröffentlicht: (2022)
von: Cheng, Lixue, et al.
Veröffentlicht: (2022)
Mapping Differential Protein-Protein Interaction Networks using Affinity Purification Mass Spectrometry
von: Kaushal, Prashant, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Kaushal, Prashant, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Robust Optimization in Protein Fitness Landscapes Using Reinforcement Learning in Latent Space
von: Lee, Minji, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Lee, Minji, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Ähnliche Einträge
-
Single-Cell Proteomic Technologies: Tools in the quest for principles
von: Slavov, Nikolai
Veröffentlicht: (2025) -
Examining the Link Between Peroxiredoxin Proteins and Mutually Exclusive Transcription Factor Activation With a Mathematical Model
von: Schlamowitz, Zachary, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
On Machine Learning Approaches for Protein-Ligand Binding Affinity Prediction
von: Schapin, Nikolai, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
Extreme Gradient Boosting Beats In‐Silico Identification of Proteins Potentially Associated With Alzheimer’s
von: Sadia Khalil, et al.
Veröffentlicht: (2024) -
From Static to Dynamic Structures: Improving Binding Affinity Prediction with Graph-Based Deep Learning
von: Min, Yaosen, et al.
Veröffentlicht: (2022)