Unified Biomolecular Trajectory Generation via Pretrained Variational Bridge
Fuente:
arXiv
Enregistré dans:
| Auteurs principaux: | Yu, Ziyang, Huang, Wenbing, Liu, Yang |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Publié: |
2026
|
| Sujets: | |
| Accès en ligne: | |
| Tags: |
Ajouter un tag
Pas de tags, Soyez le premier à ajouter un tag!
|
Documents similaires
UniSim: A Unified Simulator for Time-Coarsened Dynamics of Biomolecules
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2025)
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2025)
Force-Guided Bridge Matching for Full-Atom Time-Coarsened Dynamics of Peptides
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2024)
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2024)
Rigid Protein-Protein Docking via Equivariant Elliptic-Paraboloid Interface Prediction
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2024)
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2024)
An Equivariant Pretrained Transformer for Unified 3D Molecular Representation Learning
par: Jiao, Rui, et autres
Publié: (2024)
par: Jiao, Rui, et autres
Publié: (2024)
CARD: Coarse-to-fine Autoregressive Modeling with Radix-based Decomposition for Transferable Free Energy Estimation
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2026)
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2026)
Bridging the Gap between Chemical Reaction Pretraining and Conditional Molecule Generation with a Unified Model
par: Qiang, Bo, et autres
Publié: (2023)
par: Qiang, Bo, et autres
Publié: (2023)
Atomic Trajectory Modeling with State Space Models for Biomolecular Dynamics
par: Shi, Liang, et autres
Publié: (2026)
par: Shi, Liang, et autres
Publié: (2026)
Space Group Constrained Crystal Generation
par: Jiao, Rui, et autres
Publié: (2024)
par: Jiao, Rui, et autres
Publié: (2024)
UniMoMo: Unified Generative Modeling of 3D Molecules for De Novo Binder Design
par: Kong, Xiangzhe, et autres
Publié: (2025)
par: Kong, Xiangzhe, et autres
Publié: (2025)
Improved Constrained Generation by Bridging Pretrained Generative Models
par: Liang, Xiaoxuan, et autres
Publié: (2026)
par: Liang, Xiaoxuan, et autres
Publié: (2026)
Latent Retrieval Augmented Generation of Cross-Domain Protein Binders
par: Zhang, Zishen, et autres
Publié: (2025)
par: Zhang, Zishen, et autres
Publié: (2025)
Generalist Equivariant Transformer Towards 3D Molecular Interaction Learning
par: Kong, Xiangzhe, et autres
Publié: (2023)
par: Kong, Xiangzhe, et autres
Publié: (2023)
Unifying Prediction and Explanation in Time-Series Transformers via Shapley-based Pretraining
par: Cheng, Qisen, et autres
Publié: (2025)
par: Cheng, Qisen, et autres
Publié: (2025)
PTrajM: Efficient and Semantic-rich Trajectory Learning with Pretrained Trajectory-Mamba
par: Lin, Yan, et autres
Publié: (2024)
par: Lin, Yan, et autres
Publié: (2024)
Align Your Structures: Generating Trajectories with Structure Pretraining for Molecular Dynamics
par: Iyengar, Aniketh, et autres
Publié: (2026)
par: Iyengar, Aniketh, et autres
Publié: (2026)
Variational Sampling of Temporal Trajectories
par: Nazarovs, Jurijs, et autres
Publié: (2024)
par: Nazarovs, Jurijs, et autres
Publié: (2024)
OmniBridge: Unified Multimodal Understanding, Generation, and Retrieval via Latent Space Alignment
par: Xiao, Teng, et autres
Publié: (2025)
par: Xiao, Teng, et autres
Publié: (2025)
Technical Report of HelixFold3 for Biomolecular Structure Prediction
par: Liu, Lihang, et autres
Publié: (2024)
par: Liu, Lihang, et autres
Publié: (2024)
Lifting Biomolecular Data Acquisition
par: Weinstein, Eli N., et autres
Publié: (2025)
par: Weinstein, Eli N., et autres
Publié: (2025)
BridgeDrive: Diffusion Bridge Policy for Closed-Loop Trajectory Planning in Autonomous Driving
par: Liu, Shu, et autres
Publié: (2025)
par: Liu, Shu, et autres
Publié: (2025)
Generative Pretrained Hierarchical Transformer for Time Series Forecasting
par: Liu, Zhiding, et autres
Publié: (2024)
par: Liu, Zhiding, et autres
Publié: (2024)
A Unified Pairwise Framework for RLHF: Bridging Generative Reward Modeling and Policy Optimization
par: Xu, Wenyuan, et autres
Publié: (2025)
par: Xu, Wenyuan, et autres
Publié: (2025)
Bifrost: Steering Strategic Trajectories to Bridge Contextual Gaps for Self-Improving Agents
par: Tran, Quan M., et autres
Publié: (2026)
par: Tran, Quan M., et autres
Publié: (2026)
Trajectory Inference with Smooth Schrödinger Bridges
par: Hong, Wanli, et autres
Publié: (2025)
par: Hong, Wanli, et autres
Publié: (2025)
Geometric Mixture Models for Electrolyte Conductivity Prediction
par: Li, Anyi, et autres
Publié: (2025)
par: Li, Anyi, et autres
Publié: (2025)
Pretrained Approximators for Low-Thrust Trajectory Cost and Reachability
par: Zhang, Zhong, et autres
Publié: (2026)
par: Zhang, Zhong, et autres
Publié: (2026)
UniGen: Unified Modeling of Initial Agent States and Trajectories for Generating Autonomous Driving Scenarios
par: Mahjourian, Reza, et autres
Publié: (2024)
par: Mahjourian, Reza, et autres
Publié: (2024)
Token Statistics Transformer: Linear-Time Attention via Variational Rate Reduction
par: Wu, Ziyang, et autres
Publié: (2024)
par: Wu, Ziyang, et autres
Publié: (2024)
Physically Valid Biomolecular Interaction Modeling with Gauss-Seidel Projection
par: Chen, Siyuan, et autres
Publié: (2025)
par: Chen, Siyuan, et autres
Publié: (2025)
VITA: Variational Pretraining of Transformers for Climate-Robust Crop Yield Forecasting
par: Hasan, Adib, et autres
Publié: (2025)
par: Hasan, Adib, et autres
Publié: (2025)
Constrained Stein Variational Trajectory Optimization
par: Power, Thomas, et autres
Publié: (2023)
par: Power, Thomas, et autres
Publié: (2023)
PACE: Geometry-Aware Bridge Transport for Single-Cell Trajectory Inference
par: Yu, Chenglei, et autres
Publié: (2026)
par: Yu, Chenglei, et autres
Publié: (2026)
Machine Learning Potentials: A Roadmap Toward Next-Generation Biomolecular Simulations
par: De Fabritiis, Gianni
Publié: (2024)
par: De Fabritiis, Gianni
Publié: (2024)
Unified Multimodal Vessel Trajectory Prediction with Explainable Navigation Intention
par: Zhang, Rui, et autres
Publié: (2025)
par: Zhang, Rui, et autres
Publié: (2025)
Learning Generation Orders for Masked Discrete Diffusion Models via Variational Inference
par: Fox, David, et autres
Publié: (2026)
par: Fox, David, et autres
Publié: (2026)
On the Generalization Ability of Unsupervised Pretraining
par: Deng, Yuyang, et autres
Publié: (2024)
par: Deng, Yuyang, et autres
Publié: (2024)
TrajDiff: Diffusion Bridge Network with Semantic Alignment for Trajectory Similarity Computation
par: Zhang, Xiao, et autres
Publié: (2025)
par: Zhang, Xiao, et autres
Publié: (2025)
Variational Inference, Entropy, and Orthogonality: A Unified Theory of Mixture-of-Experts
par: Su, Ye, et autres
Publié: (2026)
par: Su, Ye, et autres
Publié: (2026)
Bridging the inference gap in Mutimodal Variational Autoencoders
par: Senellart, Agathe, et autres
Publié: (2025)
par: Senellart, Agathe, et autres
Publié: (2025)
EquiPocket: an E(3)-Equivariant Geometric Graph Neural Network for Ligand Binding Site Prediction
par: Zhang, Yang, et autres
Publié: (2023)
par: Zhang, Yang, et autres
Publié: (2023)
Documents similaires
-
UniSim: A Unified Simulator for Time-Coarsened Dynamics of Biomolecules
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2025) -
Force-Guided Bridge Matching for Full-Atom Time-Coarsened Dynamics of Peptides
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2024) -
Rigid Protein-Protein Docking via Equivariant Elliptic-Paraboloid Interface Prediction
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2024) -
An Equivariant Pretrained Transformer for Unified 3D Molecular Representation Learning
par: Jiao, Rui, et autres
Publié: (2024) -
CARD: Coarse-to-fine Autoregressive Modeling with Radix-based Decomposition for Transferable Free Energy Estimation
par: Yu, Ziyang, et autres
Publié: (2026)