Protein Language Model Embeddings Improve Generalization of Implicit Transfer Operators
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Antoniadis, Panagiotis, Pavesi, Beatrice, Olsson, Simon, Winther, Ole |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
P2DFlow: A Protein Ensemble Generative Model with SE(3) Flow Matching
di: Jin, Yaowei, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Jin, Yaowei, et al.
Pubblicazione: (2024)
AMARO: All Heavy-Atom Transferable Neural Network Potentials of Protein Thermodynamics
di: Mirarchi, Antonio, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Mirarchi, Antonio, et al.
Pubblicazione: (2024)
SynLlama: Generating Synthesizable Molecules and Their Analogs with Large Language Models
di: Sun, Kunyang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sun, Kunyang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Mass Balance Approximation of Unfolding Improves Potential-Like Methods for Protein Stability Predictions
di: Rossi, Ivan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Rossi, Ivan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Decoding Neuronal Networks: A Reservoir Computing Approach for Predicting Connectivity and Functionality
di: Auslender, Ilya, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Auslender, Ilya, et al.
Pubblicazione: (2023)
AI-based Methods for Simulating, Sampling, and Predicting Protein Ensembles
di: Jing, Bowen, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jing, Bowen, et al.
Pubblicazione: (2025)
Transferable Generative Models Bridge Femtosecond to Nanosecond Time-Step Molecular Dynamics
di: Diez, Juan Viguera, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Diez, Juan Viguera, et al.
Pubblicazione: (2025)
MoDyGAN: Combining Molecular Dynamics With GANs to Investigate Protein Conformational Space
di: Liang, Jingbo, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Liang, Jingbo, et al.
Pubblicazione: (2025)
Protein generation with embedding learning for motif diversification
di: Michalewicz, Kevin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Michalewicz, Kevin, et al.
Pubblicazione: (2025)
BoltzNCE: Learning Likelihoods for Boltzmann Generation with Stochastic Interpolants and Noise Contrastive Estimation
di: Aggarwal, Rishal, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Aggarwal, Rishal, et al.
Pubblicazione: (2025)
Generative Diffusion Models for Sequential Recommendations
di: Zolghadr, Sharare, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zolghadr, Sharare, et al.
Pubblicazione: (2024)
Temporal Variational Implicit Neural Representations
di: Koyuncu, Batuhan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Koyuncu, Batuhan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Generalized Flow Matching for Transition Dynamics Modeling
di: Wang, Haibo, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Wang, Haibo, et al.
Pubblicazione: (2024)
Enhancing Swarms Durability to Threats via Graph Signal Processing and GNN-based Generative Modeling
di: Karin, Jonathan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Karin, Jonathan, et al.
Pubblicazione: (2025)
ConfRover: Simultaneous Modeling of Protein Conformation and Dynamics via Autoregression
di: Shen, Yuning, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Shen, Yuning, et al.
Pubblicazione: (2025)
Integrating Chemical Language and Molecular Graph in Multimodal Fused Deep Learning for Drug Property Prediction
di: Lu, Xiaohua, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Lu, Xiaohua, et al.
Pubblicazione: (2023)
Knowledge Distillation of a Protein Language Model Yields a Foundational Implicit Solvent Model
di: Airas, Justin, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Airas, Justin, et al.
Pubblicazione: (2026)
Label-free SERS Discrimination of Proline from Hydroxylated Proline at Single-molecule Level Assisted by a Deep Learning Model
di: Zhao, Yingqi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zhao, Yingqi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Physics-Informed Machine Learning for Microscale Drying of Plant-Based Foods: A Systematic Review of Computational Models and Experimental Insights
di: Batuwatta-Gamage, C. P., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Batuwatta-Gamage, C. P., et al.
Pubblicazione: (2025)
BInD: Bond and Interaction-generating Diffusion Model for Multi-objective Structure-based Drug Design
di: Lee, Joongwon, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lee, Joongwon, et al.
Pubblicazione: (2024)
A Solid-State Nanopore Signal Generator for Training Machine Learning Models
di: Johnson, Jaise, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Johnson, Jaise, et al.
Pubblicazione: (2025)
Latent Thermodynamic Flows: Unified Representation Learning and Generative Modeling of Temperature-Dependent Behaviors from Limited Data
di: Qiu, Yunrui, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Qiu, Yunrui, et al.
Pubblicazione: (2025)
Clock-state olfactory search in turbulent flows using Q-learning: The geometry of plume recovery
di: Rando, Marco, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Rando, Marco, et al.
Pubblicazione: (2026)
Unraveling the Mechanism of Drug Binding to SARS-CoV-2 RNA Pseudoknot with Thermodynamics-Driven Machine Learning
di: Ivonina, Mariia, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Ivonina, Mariia, et al.
Pubblicazione: (2026)
One scale to rule them all: interpretable multi-scale Deep Learning for predicting cell survival after proton and carbon ion irradiation
di: Bordieri, Giulio, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Bordieri, Giulio, et al.
Pubblicazione: (2026)
Q-learning with temporal memory to navigate turbulence
di: Rando, Marco, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Rando, Marco, et al.
Pubblicazione: (2024)
Flow Matching for Optimal Reaction Coordinates of Biomolecular System
di: Zhang, Mingyuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zhang, Mingyuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
Inferring Optical Tissue Properties from Photoplethysmography using Hybrid Amortized Inference
di: Behrmann, Jens, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Behrmann, Jens, et al.
Pubblicazione: (2025)
General Binding Affinity Guidance for Diffusion Models in Structure-Based Drug Design
di: Jian, Yue, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Jian, Yue, et al.
Pubblicazione: (2024)
Scalable Spatio-Temporal SE(3) Diffusion for Long-Horizon Protein Dynamics
di: Shoghi, Nima, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Shoghi, Nima, et al.
Pubblicazione: (2026)
Modelling Mosquito Population Dynamics using PINN-derived Empirical Parameters
di: Lalic, Branislava, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lalic, Branislava, et al.
Pubblicazione: (2024)
Modeling non-genetic information dynamics in cells using reservoir computing
di: Niraula, Dipesh, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Niraula, Dipesh, et al.
Pubblicazione: (2023)
Integrating Dynamical Systems Modeling with Spatiotemporal scRNA-seq Data Analysis
di: Zhang, Zhenyi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Zhenyi, et al.
Pubblicazione: (2025)
Data-Driven Discovery and Formulation Refines the Quasi-Steady Model of Flapping-Wing Aerodynamics
di: Kamimizu, Yu, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kamimizu, Yu, et al.
Pubblicazione: (2025)
Searching for Quantum Effects in the Brain: A Bell-Type Test for Nonclassical Latent Representations in Autoencoders
di: Kominis, I. K., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Kominis, I. K., et al.
Pubblicazione: (2026)
BioScore: A Foundational Scoring Function For Diverse Biomolecular Complexes
di: Zhu, Yuchen, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhu, Yuchen, et al.
Pubblicazione: (2025)
A Note on Spectral Map
di: Gökdemir, Tuğçe, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Gökdemir, Tuğçe, et al.
Pubblicazione: (2024)
Large Scale Training of Graph Neural Networks for Optimal Markov-Chain Partitioning Using the Kemeny Constant
di: Martino, Sam Alexander, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Martino, Sam Alexander, et al.
Pubblicazione: (2023)
Predictive Free Energy Simulations Through Hierarchical Distillation of Quantum Hamiltonians
di: Li, Chenghan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Li, Chenghan, et al.
Pubblicazione: (2025)
JAMUN: Bridging Smoothed Molecular Dynamics and Score-Based Learning for Conformational Ensembles
di: Daigavane, Ameya, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Daigavane, Ameya, et al.
Pubblicazione: (2024)
Documenti analoghi
-
P2DFlow: A Protein Ensemble Generative Model with SE(3) Flow Matching
di: Jin, Yaowei, et al.
Pubblicazione: (2024) -
AMARO: All Heavy-Atom Transferable Neural Network Potentials of Protein Thermodynamics
di: Mirarchi, Antonio, et al.
Pubblicazione: (2024) -
SynLlama: Generating Synthesizable Molecules and Their Analogs with Large Language Models
di: Sun, Kunyang, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Mass Balance Approximation of Unfolding Improves Potential-Like Methods for Protein Stability Predictions
di: Rossi, Ivan, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Decoding Neuronal Networks: A Reservoir Computing Approach for Predicting Connectivity and Functionality
di: Auslender, Ilya, et al.
Pubblicazione: (2023)