HBAT 2: A Python Package to Analyse Hydrogen Bonds and Other Non-covalent Interactions in Macromolecular Structures
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| 1. Verfasser: | Tiwari, Abhishek |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2026
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
QC Lab: A Python Package for Quantum-Classical Dynamics
von: Krotz, Alex, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Krotz, Alex, et al.
Veröffentlicht: (2025)
NeuralTSNE: A Python Package for the Dimensionality Reduction of Molecular Dynamics Data Using Neural Networks
von: Tajs, Patryk, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Tajs, Patryk, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Spin covalent chemistry of carbon
von: Sheka, E. F.
Veröffentlicht: (2025)
von: Sheka, E. F.
Veröffentlicht: (2025)
Chemical Origins of Non-Bonded Interactions Within and Between Solids
von: Robinson, Paul J., et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Robinson, Paul J., et al.
Veröffentlicht: (2026)
Macromolecular tribology at flowing solid/liquid interfaces
von: Velay, Malo, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Velay, Malo, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Monomeric machine learning potential for general covalent molecules: linear alkanes as an example
von: Li, Xinze, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Li, Xinze, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Quantum Signature of Anisotropic Singularities in Hydrogen Bond Breaking of Water Dimer
von: Ali, Md Rejwan
Veröffentlicht: (2025)
von: Ali, Md Rejwan
Veröffentlicht: (2025)
Relative Binding Free Energy Estimation of Congeneric Ligands and Macromolecular Mutants with the Alchemical Transfer with Coordinate Swapping Method
von: Gallicchio, Emilio
Veröffentlicht: (2024)
von: Gallicchio, Emilio
Veröffentlicht: (2024)
Role of Kinetic Exchange and Coulomb Interaction in Bonding of Hydrogen Molecular Systems and Excited States
von: Hendzel, Maciej, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Hendzel, Maciej, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Associative and Segregative Liquid-Liquid Phase Separation in Macromolecular Solutions
von: Tuinier, Remco, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Tuinier, Remco, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Effect of Substitution Group on Intramolecular Hydrogen Bond of Amino Alcohols from Raman spectroscopy
von: Zhao, Honghui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhao, Honghui, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Acid Base Chemistry of Short Hydrogen Bonds: A Tale of Schrödinger's Cat in Glutamine-Derived Crystals
von: Qaisrani, Muhammad Nawaz, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Qaisrani, Muhammad Nawaz, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Benchmarking distinguishable cluster methods to platinum standard CCSDT(Q) non covalent interaction energies in the A24 dataset
von: Lambie, S., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Lambie, S., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Systematic discrepancies between reference methods for non-covalent interactions within the S66 dataset
von: Shi, Benjamin X., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Shi, Benjamin X., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Are Molecules Magical? Non-Stabilizerness in Molecular Bonding
von: Sarkis, Matthieu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Sarkis, Matthieu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Imaging the Photochemistry of the Hydrogen-Bonded Heptazine-Water Complex with Femtosecond Time-Resolved Spectroscopy: A Computational Study
von: Pios, Sebastian V., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Pios, Sebastian V., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Screening in the Heitler-London Model: Revisiting the Bonding and Antibonding States of the Hydrogen Molecule
von: da Silva, Washington P., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: da Silva, Washington P., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Multiple charge transfer driven complex reaction dynamics: covalent bonding meets van der Waals interactions
von: Dong, Ruichao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Dong, Ruichao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Thermodynamic Stability and Hydrogen Bonds in Mixed Halide Perovskites
von: Camayo-Gutierrez, Liz, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Camayo-Gutierrez, Liz, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Kinetic energy density functional based on electron distribution on the energy coordinate to describe covalent bond
von: Takahashi, Hideaki
Veröffentlicht: (2025)
von: Takahashi, Hideaki
Veröffentlicht: (2025)
Synthesis of single-layered fluorographdiyne nanosheets via selective on-surface 2D covalent polymerization
von: Shu, Chen-Hui, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Shu, Chen-Hui, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Can Charge Transfer Across C-H...O Hydrogen Bonds Stabilize Oil Droplets in Water?
von: Zhao, Ruoqi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zhao, Ruoqi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Enhanced Hydrogen Bonding to Water Can Explain the Outstanding Solubility of \b{eta}-D-Glucose in Water
von: Bakó, Imre, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Bakó, Imre, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Basis set incompleteness errors in fixed-node diffusion Monte Carlo calculations on non-covalent interactions
von: Nakano, Kousuke, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Nakano, Kousuke, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Mixtures of Ethane with CO$_2$ and Water Simulated in ZSM-22: The Role of Polarity and Hydrogen Bonding
von: Kummali, Mohammed Musthafa, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Kummali, Mohammed Musthafa, et al.
Veröffentlicht: (2024)
TurboGenius: Python suite for high-throughput calculations of ab initio quantum Monte Carlo methods
von: Nakano, Kousuke, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Nakano, Kousuke, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Scalable Machine Learning Force Fields for Macromolecular Systems Through Long-Range Aware Message Passing
von: Wang, Chu, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Wang, Chu, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Attaining high accuracy for charge-transfer excitations in non-covalent complexes at second-order perturbation cost: the importance of state-specific self-consistency
von: Tran, Nhan Tri, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Tran, Nhan Tri, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Computing Hydrogen Tunneling Splittings with Nuclear-Electronic Orbital Multireference Configuration Interaction
von: Stein, Rachel J., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Stein, Rachel J., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Natural Orbital Non-Orthogonal Configuration Interaction
von: Graf, Daniel, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Graf, Daniel, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Rapidly Screening the Correlation Between the Rotational Mobility and the Hydrogen Bonding Strength of Confined Water
von: Beaton, Alec A., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Beaton, Alec A., et al.
Veröffentlicht: (2023)
SpectraMatcher: A Python Program for Interactive Analysis and Peak Assignment of Vibronic Spectra
von: Langner, Johanna, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Langner, Johanna, et al.
Veröffentlicht: (2025)
The Electronic Structure of the Hydrogen Molecule: A Tutorial Exercise in Classical and Quantum Computation
von: Graves, Vincent, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Graves, Vincent, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Generalizing Denoising to Non-Equilibrium Structures Improves Equivariant Force Fields
von: Liao, Yi-Lun, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Liao, Yi-Lun, et al.
Veröffentlicht: (2024)
GMTHRASHpy: Forward Convolutions of Crossed Molecular Beams Experiments in Python
von: Fujioka, Kazuumi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Fujioka, Kazuumi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Mechanistic Insights into Non-Adiabatic Interband Transitions on a Semiconductor Surface Induced by Hydrogen Atom Collisions
von: Zhu, Lingjun, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhu, Lingjun, et al.
Veröffentlicht: (2024)
NENCI-2021 Part I: A Large Benchmark Database of Non-Equilibrium Non-Covalent Interactions Emphasizing Close Intermolecular Contacts
von: Sparrow, Zachary M., et al.
Veröffentlicht: (2021)
von: Sparrow, Zachary M., et al.
Veröffentlicht: (2021)
Near Equivalence of Polarizability and Bond Order Flux Metrics for Describing Covalent Bond Rearrangements
von: Kim, Lukas, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Kim, Lukas, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Automated Quantum Chemistry Code Generation with the p$^\dagger$q Package
von: Liebenthal, Marcus D., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Liebenthal, Marcus D., et al.
Veröffentlicht: (2025)
A Personal Perspective on Metalloprotein Structure and the Future of Macromolecular X‐Ray Crystallography
von: Douglas C. Rees
Veröffentlicht: (2026)
von: Douglas C. Rees
Veröffentlicht: (2026)
Ähnliche Einträge
-
QC Lab: A Python Package for Quantum-Classical Dynamics
von: Krotz, Alex, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
NeuralTSNE: A Python Package for the Dimensionality Reduction of Molecular Dynamics Data Using Neural Networks
von: Tajs, Patryk, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Spin covalent chemistry of carbon
von: Sheka, E. F.
Veröffentlicht: (2025) -
Chemical Origins of Non-Bonded Interactions Within and Between Solids
von: Robinson, Paul J., et al.
Veröffentlicht: (2026) -
Macromolecular tribology at flowing solid/liquid interfaces
von: Velay, Malo, et al.
Veröffentlicht: (2026)