Molecular Dynamics Simulations Reveal PolyQ-Length-Dependent Conformational Changes in Huntingtin Exon-1: Implications for Environmental Co-Solvent Modulation of Aggregation-Prone States
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Geddes-Nelson, Jai, Liu, Xiaochen, Yong, Ken-Tye |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
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