Adapting a Pre-trained Single-Cell Foundation Model to Spatial Gene Expression Generation from Histology Images
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Fang, Donghai, Li, Yongheng, Wang, Zhen, Zeng, Yuansong, Min, Wenwen |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
CHRep: Cross-modal Histology Representation and Post-hoc Calibration for Spatial Gene Expression Prediction
di: Wang, Changfan, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wang, Changfan, et al.
Pubblicazione: (2026)
GeneQuery: A General QA-based Framework for Spatial Gene Expression Predictions from Histology Images
di: Xiong, Ying, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Xiong, Ying, et al.
Pubblicazione: (2024)
Multi-Slice Spatial Transcriptomics Data Integration Analysis with STG3Net
di: Fang, Donghai, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Fang, Donghai, et al.
Pubblicazione: (2024)
From Spots to Pixels: Dense Spatial Gene Expression Prediction from Histology Images
di: Zhang, Ruikun, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Ruikun, et al.
Pubblicazione: (2025)
Diffusion Generative Modeling for Spatially Resolved Gene Expression Inference from Histology Images
di: Zhu, Sichen, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhu, Sichen, et al.
Pubblicazione: (2025)
SpaRED benchmark: Enhancing Gene Expression Prediction from Histology Images with Spatial Transcriptomics Completion
di: Mejia, Gabriel, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Mejia, Gabriel, et al.
Pubblicazione: (2024)
Cross-Slice Knowledge Transfer via Masked Multi-Modal Heterogeneous Graph Contrastive Learning for Spatial Gene Expression Inference
di: Shi, Zhiceng, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Shi, Zhiceng, et al.
Pubblicazione: (2026)
Beyond Single Prompts: Synergistic Fusion and Arrangement for VICL
di: Liao, Wenwen, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Liao, Wenwen, et al.
Pubblicazione: (2026)
SpaCRD: Multimodal Deep Fusion of Histology and Spatial Transcriptomics for Cancer Region Detection
di: Xue, Shuailin, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Xue, Shuailin, et al.
Pubblicazione: (2026)
PH2ST:ST-Prompt Guided Histological Hypergraph Learning for Spatial Gene Expression Prediction
di: Niu, Yi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Niu, Yi, et al.
Pubblicazione: (2025)
ASteISR: Adapting Single Image Super-resolution Pre-trained Model for Efficient Stereo Image Super-resolution
di: Zhou, Yuanbo, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zhou, Yuanbo, et al.
Pubblicazione: (2024)
High-Resolution Spatial Transcriptomics from Histology Images using HisToSGE
di: Shi, Zhiceng, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Shi, Zhiceng, et al.
Pubblicazione: (2024)
RAW-Adapter: Adapting Pre-trained Visual Model to Camera RAW Images
di: Cui, Ziteng, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Cui, Ziteng, et al.
Pubblicazione: (2024)
Integrating Pathology Foundation Models and Spatial Transcriptomics for Cellular Decomposition from Histology Images
di: Sun, Yutong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sun, Yutong, et al.
Pubblicazione: (2025)
RAW-Adapter: Adapting Pre-trained Visual Model to Camera RAW Images and A Benchmark
di: Cui, Ziteng, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Cui, Ziteng, et al.
Pubblicazione: (2025)
Towards Data-Efficient Video Pre-training with Frozen Image Foundation Models
di: Orlova, Svetlana, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Orlova, Svetlana, et al.
Pubblicazione: (2026)
InfoSculpt: Sculpting the Latent Space for Generalized Category Discovery
di: Liao, Wenwen, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Liao, Wenwen, et al.
Pubblicazione: (2026)
GeneAvatar: Generic Expression-Aware Volumetric Head Avatar Editing from a Single Image
di: Bao, Chong, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Bao, Chong, et al.
Pubblicazione: (2024)
PROMPT-IML: Image Manipulation Localization with Pre-trained Foundation Models Through Prompt Tuning
di: Liu, Xuntao, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Xuntao, et al.
Pubblicazione: (2024)
RET-CLIP: A Retinal Image Foundation Model Pre-trained with Clinical Diagnostic Reports
di: Du, Jiawei, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Du, Jiawei, et al.
Pubblicazione: (2024)
Learning Relative Gene Expression Trends from Pathology Images in Spatial Transcriptomics
di: Nishimura, Kazuya, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Nishimura, Kazuya, et al.
Pubblicazione: (2025)
Enhancing Visual In-Context Learning by Multi-Faceted Fusion
di: Liao, Wenwen, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Liao, Wenwen, et al.
Pubblicazione: (2026)
PEaRL: Pathway-Enhanced Representation Learning for Gene and Pathway Expression Prediction from Histology
di: Majumder, Sejuti, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Majumder, Sejuti, et al.
Pubblicazione: (2025)
Z-Image: An Efficient Image Generation Foundation Model with Single-Stream Diffusion Transformer
di: Image Team, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Image Team, et al.
Pubblicazione: (2025)
Let ViT Speak: Generative Language-Image Pre-training
di: Fang, Yan, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Fang, Yan, et al.
Pubblicazione: (2026)
Adapting a Segmentation Foundation Model for Medical Image Classification
di: Gu, Pengfei, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Gu, Pengfei, et al.
Pubblicazione: (2025)
How Does the Spatial Distribution of Pre-training Data Affect Geospatial Foundation Models?
di: Purohit, Mirali, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Purohit, Mirali, et al.
Pubblicazione: (2025)
VFM-ISRefiner: Towards Better Adapting Vision Foundation Models for Interactive Segmentation of Remote Sensing Images
di: Wang, Deliang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wang, Deliang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Spatial Transcriptomics Analysis of Zero-shot Gene Expression Prediction
di: Yang, Yan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Yang, Yan, et al.
Pubblicazione: (2024)
GenAR: Next-Scale Autoregressive Generation for Spatial Gene Expression Prediction
di: Ouyang, Jiarui, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ouyang, Jiarui, et al.
Pubblicazione: (2025)
Adapting Vision-Language Foundation Model for Next Generation Medical Ultrasound Image Analysis
di: Qu, Jingguo, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Qu, Jingguo, et al.
Pubblicazione: (2025)
Micro-Expression Recognition by Motion Feature Extraction based on Pre-training
di: Li, Ruolin, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Li, Ruolin, et al.
Pubblicazione: (2024)
LapFM: A Laparoscopic Segmentation Foundation Model via Hierarchical Concept Evolving Pre-training
di: Xu, Qing, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Xu, Qing, et al.
Pubblicazione: (2025)
ST-Align: A Multimodal Foundation Model for Image-Gene Alignment in Spatial Transcriptomics
di: Lin, Yuxiang, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lin, Yuxiang, et al.
Pubblicazione: (2024)
Adapting Foundation Models for Few-Shot Medical Image Segmentation: Actively and Sequentially
di: Yang, Jingyun, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yang, Jingyun, et al.
Pubblicazione: (2025)
Adapting Multi-modal Large Language Model to Concept Drift From Pre-training Onwards
di: Yang, Xiaoyu, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Yang, Xiaoyu, et al.
Pubblicazione: (2024)
MIMIC: Mask Image Pre-training with Mix Contrastive Fine-tuning for Facial Expression Recognition
di: Zhang, Fan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zhang, Fan, et al.
Pubblicazione: (2024)
Genome-Anchored Foundation Model Embeddings Improve Molecular Prediction from Histology Images
di: Jin, Cheng, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jin, Cheng, et al.
Pubblicazione: (2025)
CoMP: Continual Multimodal Pre-training for Vision Foundation Models
di: Chen, Yitong, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Chen, Yitong, et al.
Pubblicazione: (2025)
Adapting Vision Foundation Models for Robust Cloud Segmentation in Remote Sensing Images
di: Zou, Xuechao, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zou, Xuechao, et al.
Pubblicazione: (2024)
Documenti analoghi
-
CHRep: Cross-modal Histology Representation and Post-hoc Calibration for Spatial Gene Expression Prediction
di: Wang, Changfan, et al.
Pubblicazione: (2026) -
GeneQuery: A General QA-based Framework for Spatial Gene Expression Predictions from Histology Images
di: Xiong, Ying, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Multi-Slice Spatial Transcriptomics Data Integration Analysis with STG3Net
di: Fang, Donghai, et al.
Pubblicazione: (2024) -
From Spots to Pixels: Dense Spatial Gene Expression Prediction from Histology Images
di: Zhang, Ruikun, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Diffusion Generative Modeling for Spatially Resolved Gene Expression Inference from Histology Images
di: Zhu, Sichen, et al.
Pubblicazione: (2025)