Poisoning the Genome: Targeted Backdoor Attacks on DNA Foundation Models
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Koilakos, Charalampos, Mouratidis, Ioannis, Georgakopoulos-Soares, Ilias |
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| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
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