Cluster-First Labelling: An Automated Pipeline for Segmentation and Morphological Clustering in Histology Whole Slide Images
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Ahmad, Muhammad Haseeb, Rajendran, Sharmila, Young, Damion, Mason, Jon |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
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| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
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