Sparse regression, classification, and microbial network estimation in QIIME2 with q2-classo and q2-gglasso
Fuente:
arXiv
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Vlasovets, Oleg, Schaipp, Fabian, Simpson, Leo, Bolyen, Evan, Caporaso, J. Gregory, Mueller, Christian L. |
|---|---|
| Format: | Preprint |
| Veröffentlicht: |
2026
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| Schlagworte: | |
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