HyperEvoGen: Exploring deep phylogeny using non-Euclidean variational inference
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Lamanna, Jason, Mowlaei, Erfan, Shi, Xinghua, Kumar, Sudhir, Carnevale, Vincenzo |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Impact of phylogeny on structural contact inference from protein sequence data
di: Dietler, Nicola, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Dietler, Nicola, et al.
Pubblicazione: (2022)
R3F: An R package for evolutionary dates, rates, and priors using the relative rate framework
di: Tao, Qiqing, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Tao, Qiqing, et al.
Pubblicazione: (2025)
DeepLINK-T: deep learning inference for time series data using knockoffs and LSTM
di: Zuo, Wenxuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zuo, Wenxuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
Label-free pathological subtyping of non-small cell lung cancer using deep classification and virtual immunohistochemical staining
di: Zang, Zhenya, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zang, Zhenya, et al.
Pubblicazione: (2025)
Benchmarking structure-based three-dimensional molecular generative models using GenBench3D: ligand conformation quality matters
di: Baillif, Benoit, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Baillif, Benoit, et al.
Pubblicazione: (2024)
Exploring accuracy and uncertainty quantification in physics-informed neural networks for inferring microbial community dynamics
di: Fontanarrosa, Pedro, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Fontanarrosa, Pedro, et al.
Pubblicazione: (2025)
Impact of phylogeny on the inference of functional sectors from protein sequence data
di: Dietler, Nicola, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Dietler, Nicola, et al.
Pubblicazione: (2024)
Increasing certainty in systems biology models using Bayesian multimodel inference
di: Linden-Santangeli, Nathaniel, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Linden-Santangeli, Nathaniel, et al.
Pubblicazione: (2024)
Riemannian vs. Euclidean Representation of Gait Kinematics: A Comparative Analysis
di: Bůžek, Tomáš
Pubblicazione: (2025)
di: Bůžek, Tomáš
Pubblicazione: (2025)
HyperADRs: A Hierarchical Hypergraph Framework for Drug-Gene-ADR Prediction
di: Cai, Ze, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Cai, Ze, et al.
Pubblicazione: (2025)
Individualized prescriptive inference in ischaemic stroke
di: Giles, Dominic, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Giles, Dominic, et al.
Pubblicazione: (2023)
Analyzing animal movement using deep learning
di: Fronville, Thibault, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Fronville, Thibault, et al.
Pubblicazione: (2026)
Efficient design of rna sequences with desired properties, structure, and motifs using a grammar variational autoencoder
di: Zarnaghinaghsh, Narges, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zarnaghinaghsh, Narges, et al.
Pubblicazione: (2025)
NORI: Fast probabilistic inference for ambiguous observation-entity mappings
di: Van de Vyver, Simon, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Van de Vyver, Simon, et al.
Pubblicazione: (2026)
Collective inference of the truth of propositions from crowd probability judgments
di: Stinson, Patrick, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Stinson, Patrick, et al.
Pubblicazione: (2025)
Parameter inference in a computational model of hemodynamics in pulmonary hypertension
di: Colunga, Amanda L., et al.
Pubblicazione: (2021)
di: Colunga, Amanda L., et al.
Pubblicazione: (2021)
Compositional amortized inference for large-scale hierarchical Bayesian models
di: Arruda, Jonas, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Arruda, Jonas, et al.
Pubblicazione: (2025)
Learning virulence-transmission relationships using causal inference
di: Surasinghe, Sudam, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Surasinghe, Sudam, et al.
Pubblicazione: (2026)
Extended molt phenology models improve inferences about molt duration and timing
di: Boersch-Supan, Philipp H., et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Boersch-Supan, Philipp H., et al.
Pubblicazione: (2022)
Structured methods for parameter inference and uncertainty quantification for mechanistic models in the life sciences
di: Plank, Michael J., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Plank, Michael J., et al.
Pubblicazione: (2024)
Geometric deep learning assists protein engineering. Opportunities and Challenges
di: García-Vinuesa, Julián, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: García-Vinuesa, Julián, et al.
Pubblicazione: (2025)
HeMiTo-dynamics: a characterisation of mammalian prion toxicity using non-dimensionalisation, linear stability and perturbation analyses
di: Borgqvist, Johannes G., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Borgqvist, Johannes G., et al.
Pubblicazione: (2024)
Enforcing Latent Euclidean Geometry in Single-Cell VAEs for Manifold Interpolation
di: Palma, Alessandro, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Palma, Alessandro, et al.
Pubblicazione: (2025)
Explainable deep learning framework for cancer therapeutic target prioritization leveraging PPI centrality and node embeddings
di: Alkhadrawi, Adham M., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Alkhadrawi, Adham M., et al.
Pubblicazione: (2025)
Mechanistic inference of stochastic gene expression from structured single-cell data
di: Miles, Christopher E.
Pubblicazione: (2025)
di: Miles, Christopher E.
Pubblicazione: (2025)
Simulation-based inference of yeast centromeres
di: Touron, Eloïse, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Touron, Eloïse, et al.
Pubblicazione: (2025)
A technical review of multi-omics data integration methods: from classical statistical to deep generative approaches
di: Baião, Ana R., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Baião, Ana R., et al.
Pubblicazione: (2025)
Integrating protein sequence embeddings with structure via graph-based deep learning for single-residue property prediction
di: Michalewicz, Kevin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Michalewicz, Kevin, et al.
Pubblicazione: (2025)
Exploring proteomic signatures in sepsis and non-infectious systemic inflammatory response syndrome
di: Ruiz-Sanmartín, Adolfo, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ruiz-Sanmartín, Adolfo, et al.
Pubblicazione: (2025)
Modeling the impact of control zone restrictions on pig placement in simulated African swine fever in the United States
di: Yi, Chunlin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yi, Chunlin, et al.
Pubblicazione: (2025)
Disentangling coincident cell events using deep transfer learning and compressive sensing
di: Leuthner, Moritz, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Leuthner, Moritz, et al.
Pubblicazione: (2025)
Equivariant amortized inference of poses for cryo-EM
di: de Ruijter, Larissa, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: de Ruijter, Larissa, et al.
Pubblicazione: (2024)
Simulation of snakes using vertical body bending to traverse terrain with large height variation
di: Zhang, Yifeng, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Zhang, Yifeng, et al.
Pubblicazione: (2022)
Fast, accurate measurement of the worker populations of honey bee colonies using deep learning
di: Zhong, Junmin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhong, Junmin, et al.
Pubblicazione: (2025)
Antibody Consumption-Driven Dynamic Competition: A Systems Hypothesis for the Transition from Acute Immune Response to Post-Infection Sequelae
di: Qiru, Shi
Pubblicazione: (2025)
di: Qiru, Shi
Pubblicazione: (2025)
bursty_dynamics: A Python Package for Exploring the Temporal Properties of Longitudinal Data
di: Angdembe, Alisha, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Angdembe, Alisha, et al.
Pubblicazione: (2024)
A likelihood-based Bayesian inference framework for the calibration of and selection between stochastic velocity-jump models
di: Ceccarelli, Arianna, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ceccarelli, Arianna, et al.
Pubblicazione: (2025)
An affordable, wearable, fiber-free pulsed-mode diffuse speckle contrast flowmetry (PM-DSCF) sensor for noninvasive measurements of deep cerebral blood flow
di: Yeo, Chaebeom, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yeo, Chaebeom, et al.
Pubblicazione: (2025)
Likelihood-free inference of phylogenetic tree posterior distributions
di: Blassel, Luc, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Blassel, Luc, et al.
Pubblicazione: (2025)
Characterizing the non-monotonic behavior of mutual information along biochemical reaction cascades
di: Fan, Raymond, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Fan, Raymond, et al.
Pubblicazione: (2023)
Documenti analoghi
-
Impact of phylogeny on structural contact inference from protein sequence data
di: Dietler, Nicola, et al.
Pubblicazione: (2022) -
R3F: An R package for evolutionary dates, rates, and priors using the relative rate framework
di: Tao, Qiqing, et al.
Pubblicazione: (2025) -
DeepLINK-T: deep learning inference for time series data using knockoffs and LSTM
di: Zuo, Wenxuan, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Label-free pathological subtyping of non-small cell lung cancer using deep classification and virtual immunohistochemical staining
di: Zang, Zhenya, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Benchmarking structure-based three-dimensional molecular generative models using GenBench3D: ligand conformation quality matters
di: Baillif, Benoit, et al.
Pubblicazione: (2024)