Parsimonious computational inference protocol for Boolean networks: Application to osteogenesis
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Demongeot, Jacques, Rojas, Alonso Espinoza, Goles, Eric, Montalva-Medel, Marco, Sené, Sylvain, Tichit, Laurent |
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| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
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