Buchumschlag

Donor-Aware scRNA-seq Benchmarks for IBD Classification

Fuente: arXiv

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
1. Verfasser:	Muhire, Jonathan
Format:	Preprint
Veröffentlicht:	2026
Schlagworte:	Quantitative Methods Machine Learning
Online-Zugang:	Acceder al recurso
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge

Hypergraph Representations of scRNA-seq Data for Improved Clustering with Random Walks
von: He, Wan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Integrating Dynamical Systems Modeling with Spatiotemporal scRNA-seq Data Analysis
von: Zhang, Zhenyi, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Learning collective multi-cellular dynamics from temporal scRNA-seq via a transformer-enhanced Neural SDE
von: Jiang, Qi, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Simultaneously Infer Cell Pseudotime,Velocity Field and Gene Interaction from Multi-Branch scRNA-seq Data with scPN
von: Zhou, Zhen, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scSSL-Bench: Benchmarking Self-Supervised Learning for Single-Cell Data
von: Ovcharenko, Olga, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scDrugMap: Benchmarking Large Foundation Models for Drug Response Prediction
von: Wang, Qing, et al.
Veröffentlicht: (2025)

scPPDM: A Diffusion Model for Single-Cell Drug-Response Prediction
von: Liang, Zhaokang, et al.
Veröffentlicht: (2025)

BEACON: Benchmark for Comprehensive RNA Tasks and Language Models
von: Ren, Yuchen, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Random Matrix Theory-guided sparse PCA for single-cell RNA-seq data
von: Chardès, Victor
Veröffentlicht: (2025)

Precision Cancer Classification and Biomarker Identification from mRNA Gene Expression via Dimensionality Reduction and Explainable AI
von: Tabassum, Farzana, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scDiffusion: conditional generation of high-quality single-cell data using diffusion model
von: Luo, Erpai, et al.
Veröffentlicht: (2024)

scMRDR: A scalable and flexible framework for unpaired single-cell multi-omics data integration
von: Sun, Jianle, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Protein Fold Classification at Scale: Benchmarking and Pretraining
von: Chen, Dexiong, et al.
Veröffentlicht: (2026)

SGAC: A Graph Neural Network Framework for Imbalanced and Structure-Aware AMP Classification
von: Wang, Yingxu, et al.
Veröffentlicht: (2024)

FlowCyt: A Comparative Study of Deep Learning Approaches for Multi-Class Classification in Flow Cytometry Benchmarking
von: Bini, Lorenzo, et al.
Veröffentlicht: (2024)

BeeTLe: An Imbalance-Aware Deep Sequence Model for Linear B-Cell Epitope Prediction and Classification with Logit-Adjusted Losses
von: Yuan, Xiao
Veröffentlicht: (2023)

Curriculum-Augmented GFlowNets For mRNA Sequence Generation
von: Laajil, Aya, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Deep Learning Framework for RNA Inverse Folding with Geometric Structure Potentials
von: Yao, Annabelle
Veröffentlicht: (2025)

scBIT: Integrating Single-cell Transcriptomic Data into fMRI-based Prediction for Alzheimer's Disease Diagnosis
von: Huang, Yu-An, et al.
Veröffentlicht: (2025)

DPASyn: Mechanism-Aware Drug Synergy Prediction via Dual Attention and Precision-Aware Quantization
von: Nie, Yuxuan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Data Leakage and Redundancy in the LIT-PCBA Benchmark
von: Huang, Amber, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Efficient and Robust Continual Graph Learning for Graph Classification in Biology
von: Zhang, Ding, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Masked Autoencoder Joint Learning for Robust Spitzoid Tumor Classification
von: Carretero, Ilán, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Knowledge from Large-Scale Protein Contact Prediction Models Can Be Transferred to the Data-Scarce RNA Contact Prediction Task
von: Jian, Yiren, et al.
Veröffentlicht: (2023)

GBDTSVM: Combined Support Vector Machine and Gradient Boosting Decision Tree Framework for efficient snoRNA-disease association prediction
von: Muna, Ummay Maria, et al.
Veröffentlicht: (2025)

Sub-Clustering for Class Distance Recalculation in Long-Tailed Drug Classification
von: Su, Yujia, et al.
Veröffentlicht: (2025)

FARM: Enhancing Molecular Representations with Functional Group Awareness
von: Nguyen, Thao, et al.
Veröffentlicht: (2024)

ViroBench: Benchmarking Nucleotide Foundation Models on Viral Genomics Tasks
von: Ye, Dongxin, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Molecular Topological Profile (MOLTOP) -- Simple and Strong Baseline for Molecular Graph Classification
von: Adamczyk, Jakub, et al.
Veröffentlicht: (2024)

A Robust Support Vector Machine Approach for Raman COVID-19 Data Classification
von: Piazza, Marco, et al.
Veröffentlicht: (2025)

EEG-GPT: Exploring Capabilities of Large Language Models for EEG Classification and Interpretation
von: Kim, Jonathan W., et al.
Veröffentlicht: (2024)

The Catechol Benchmark: Time-series Solvent Selection Data for Few-shot Machine Learning
von: Boyne, Toby, et al.
Veröffentlicht: (2025)

An Open-Source, Open Data Approach to Activity Classification from Triaxial Accelerometry in an Ambulatory Setting
von: Nikookar, Sepideh, et al.
Veröffentlicht: (2026)

Semi-Supervised Hierarchical Multi-Label Classifier Based on Local Information
von: Serrano-Pérez, Jonathan, et al.
Veröffentlicht: (2024)

An Uncertainty-Aware Dynamic Decision Framework for Progressive Multi-Omics Integration in Classification Tasks
von: Mu, Nan, et al.
Veröffentlicht: (2025)

mRNA2vec: mRNA Embedding with Language Model in the 5'UTR-CDS for mRNA Design
von: Zhang, Honggen, et al.
Veröffentlicht: (2024)

Limitations of Sequence-Based Protein Representations for Parkinson's Disease Classification: A Leakage-Free Benchmark
von: Núñez-Prado, César Jesús, et al.
Veröffentlicht: (2026)

MM-DADM: Multimodal Drug-Aware Diffusion Model for Virtual Clinical Trials
von: Shao, Qian, et al.
Veröffentlicht: (2025)

A Stage-Aware Mixture of Experts Framework for Neurodegenerative Disease Progression Modelling
von: He, Tiantian, et al.
Veröffentlicht: (2025)

CAGenMol: Condition-Aware Diffusion Language Model for Goal-Directed Molecular Generation
von: Li, Yanting, et al.
Veröffentlicht: (2026)