From Enhanced Sampling to Human-Readable Representations of Protein Dynamics
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Mondal, Souvik, Sauer, Michael A., Heyden, Matthias |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Fast Sampling of Protein Conformational Dynamics
di: Sauer, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Sauer, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2024)
Exploring Conformational Landscapes Along Anharmonic Low-Frequency Vibrations
di: Mondal, Souvik, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Mondal, Souvik, et al.
Pubblicazione: (2024)
High-Throughput Computation of Anharmonic Low-Frequency Protein Vibrations
di: Sauer, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sauer, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2025)
Protein-Water Energy Transfer via Anharmonic Low-Frequency Vibrations
di: Neff, Brandon, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Neff, Brandon, et al.
Pubblicazione: (2026)
Streaming Molecular Dynamics Simulation Data for On-the-fly Processing and Analysis
di: Thirumalaiswamy, Amruthesh, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Thirumalaiswamy, Amruthesh, et al.
Pubblicazione: (2026)
Flux fractionalization transition in anisotropic $S=1$ antiferromagnets and dimer-loop models
di: Kundu, Souvik, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Kundu, Souvik, et al.
Pubblicazione: (2023)
Flux confinement-deconfinement transition of dimer-loop models on three-dimensional bipartite lattices
di: Kundu, Souvik, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Kundu, Souvik, et al.
Pubblicazione: (2025)
Signatures of quantum phases in a dissipative system
di: Joshi, Rohan, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Joshi, Rohan, et al.
Pubblicazione: (2023)
From Static Pathways to Dynamic Mechanisms: A Committor-Based Data-Driven Approach to Chemical Reactions
di: Talmazan, Radu A., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Talmazan, Radu A., et al.
Pubblicazione: (2025)
Geometric Brownian information engine with finite cycle time: Optimisation of output work, power and efficiency
di: Ali, Syed Yunus, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ali, Syed Yunus, et al.
Pubblicazione: (2025)
Sharp detection of the onset of Floquet heating using eigenstate sensitivity
di: Bhattacharjee, Sourav, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Bhattacharjee, Sourav, et al.
Pubblicazione: (2024)
Slow relaxation of quasi-periodically driven integrable quantum many-body systems
di: Ghosh, Souradeep, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ghosh, Souradeep, et al.
Pubblicazione: (2024)
Effect of an electromagnetic field on the barrier crossing rate
di: Biswas, L. R. Rahul, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Biswas, L. R. Rahul, et al.
Pubblicazione: (2025)
Improving Convergence of Generalised Rosenbluth Sampling for Branched Polymer Models by Uniform Sampling
di: Roberts, Tom, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Roberts, Tom, et al.
Pubblicazione: (2024)
From Particle Currents to Tracer Diffusion: Universal Correlation Profiles in Single-File Dynamics
di: Grabsch, Aurélien, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Grabsch, Aurélien, et al.
Pubblicazione: (2023)
From Three-Particle Dynamics to the Structural Origin of the Arrow of Time in Classical and Quantum Mechanics
di: Kobayashi, Shuhei
Pubblicazione: (2025)
di: Kobayashi, Shuhei
Pubblicazione: (2025)
Representation of the Short-Range Interactions in Liquid Helium via Modified Hard Sphere Potentials
di: Vakarchuk, I. O., et al.
Pubblicazione: (2001)
di: Vakarchuk, I. O., et al.
Pubblicazione: (2001)
Accelerating Multicanonical Sampling with Irreversibility
di: Vogel, Thomas, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Vogel, Thomas, et al.
Pubblicazione: (2026)
Sampling algorithms in statistical physics: a guide for statistics and machine learning
di: Faulkner, Michael F., et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Faulkner, Michael F., et al.
Pubblicazione: (2022)
Sample shape dependence of magnetic noise
di: Bramwell, Steven T.
Pubblicazione: (2025)
di: Bramwell, Steven T.
Pubblicazione: (2025)
Boltzmann Sampling by Diabatic Quantum Annealing
di: Gyhm, Ju-Yeon, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Gyhm, Ju-Yeon, et al.
Pubblicazione: (2024)
Thermodynamically consistent flocking: From discontinuous to continuous transitions
di: Agranov, Tal, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Agranov, Tal, et al.
Pubblicazione: (2024)
Evaluation of the probability current in the stochastic path integral formalism
di: Wilhelm, Valentin, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Wilhelm, Valentin, et al.
Pubblicazione: (2024)
On the Uniform Sampling of the Configuration Model with Centrality Constraints
di: Thibault, François, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Thibault, François, et al.
Pubblicazione: (2024)
Hamiltonian Heat Baths, Coarse-Graining and Irreversibility: A Microscopic Dynamical Entropy from Classical Mechanics
di: Ding, Mingnan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ding, Mingnan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Stochastic Sampling of Operator Growth Dynamics
di: De, Ayush, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: De, Ayush, et al.
Pubblicazione: (2024)
Dynamical Swirl Structures Powered by Microswimmers in Active Nematics
di: Mondal, Partha Sarathi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Mondal, Partha Sarathi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Importance Sampling for counting statistics in one-dimensional systems
di: Burenev, Ivan N., et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Burenev, Ivan N., et al.
Pubblicazione: (2024)
U-Net based particle localization in granular experiments: Accuracy limits and optimization
di: Puthalath, Fahad, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Puthalath, Fahad, et al.
Pubblicazione: (2026)
Quantum statistical mechanics: Gauge invariance, operator shifting, hyperdensity functionals, and nonequilibrium sum rules
di: Müller, Johanna, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Müller, Johanna, et al.
Pubblicazione: (2026)
Exact Volterra series for mean field dynamics
di: Santra, Ion, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Santra, Ion, et al.
Pubblicazione: (2026)
The peculiar response of Kelvin-Voigt chains with a free end
di: Saha, Rupayan, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Saha, Rupayan, et al.
Pubblicazione: (2026)
Identities for nonlinear memory kernels
di: Caspers, Juliana, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Caspers, Juliana, et al.
Pubblicazione: (2025)
Nonlinear Langevin functionals for a driven probe
di: Caspers, Juliana, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Caspers, Juliana, et al.
Pubblicazione: (2024)
Mean Back Relaxation for Position and Densities
di: Knotz, Gabriel, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Knotz, Gabriel, et al.
Pubblicazione: (2023)
Dynamics of phagocytosis through interplay of forces
di: Mondal, Partha Sarathi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Mondal, Partha Sarathi, et al.
Pubblicazione: (2024)
Nonequilibrium dynamics of the Jaynes-Cummings dimer
di: Vivek, G., et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Vivek, G., et al.
Pubblicazione: (2023)
Extending Sample Persistence Variable Reduction for Constrained Combinatorial Optimization Problems
di: Ide, Shunta, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ide, Shunta, et al.
Pubblicazione: (2025)
Scalable Multitemperature Free Energy Sampling of Classical Ising Spin States
di: Tuo, Ping, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Tuo, Ping, et al.
Pubblicazione: (2025)
Fluctuation-induced quadrupole order in magneto-electric materials
di: Tietjen, Finja, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Tietjen, Finja, et al.
Pubblicazione: (2026)
Documenti analoghi
-
Fast Sampling of Protein Conformational Dynamics
di: Sauer, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2024) -
Exploring Conformational Landscapes Along Anharmonic Low-Frequency Vibrations
di: Mondal, Souvik, et al.
Pubblicazione: (2024) -
High-Throughput Computation of Anharmonic Low-Frequency Protein Vibrations
di: Sauer, Michael A., et al.
Pubblicazione: (2025) -
Protein-Water Energy Transfer via Anharmonic Low-Frequency Vibrations
di: Neff, Brandon, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Streaming Molecular Dynamics Simulation Data for On-the-fly Processing and Analysis
di: Thirumalaiswamy, Amruthesh, et al.
Pubblicazione: (2026)