EvoStruct: Bridging Evolutionary and Structural Priors for Antibody CDR Design via Protein Language Model Adaptation
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Ahmed, Mansoor, Lee, Sujin, Khayaz, Umar, Patterson, Murray |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
ConTact: Contact-First Antibody CDR Design via Explicit Interface Reasoning
di: Ahmed, Mansoor, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Ahmed, Mansoor, et al.
Pubblicazione: (2026)
CHIMERA-Bench: A Benchmark Dataset for Epitope-Specific Antibody Design
di: Ahmed, Mansoor, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Ahmed, Mansoor, et al.
Pubblicazione: (2026)
Breaking the Euclidean Barrier: Hyperboloid-Based Biological Sequence Analysis
di: Ali, Sarwan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Ali, Sarwan, et al.
Pubblicazione: (2025)
EvoFlows: Evolutionary Edit-Based Flow-Matching for Protein Engineering
di: Deutschmann, Nicolas, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Deutschmann, Nicolas, et al.
Pubblicazione: (2026)
EvoPress: Accurate Dynamic Model Compression via Evolutionary Search
di: Sieberling, Oliver, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Sieberling, Oliver, et al.
Pubblicazione: (2024)
RevoNAD: Reflective Evolutionary Exploration for Neural Architecture Design
di: Chang, Gyusam, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Chang, Gyusam, et al.
Pubblicazione: (2025)
Position Specific Scoring Is All You Need? Revisiting Protein Sequence Classification Tasks
di: Ali, Sarwan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ali, Sarwan, et al.
Pubblicazione: (2024)
TimeBridge: Better Diffusion Prior Design with Bridge Models for Time Series Generation
di: Park, Jinseong, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Park, Jinseong, et al.
Pubblicazione: (2024)
StructTransform: A Scalable Attack Surface for Safety-Aligned Large Language Models
di: Yoosuf, Shehel, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yoosuf, Shehel, et al.
Pubblicazione: (2025)
StructEval: Deepen and Broaden Large Language Model Assessment via Structured Evaluation
di: Cao, Boxi, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Cao, Boxi, et al.
Pubblicazione: (2024)
EvoLlama: Enhancing LLMs' Understanding of Proteins via Multimodal Structure and Sequence Representations
di: Liu, Nuowei, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Nuowei, et al.
Pubblicazione: (2024)
EvoMU: Evolutionary Machine Unlearning
di: Batorski, Pawel, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Batorski, Pawel, et al.
Pubblicazione: (2026)
Computing Gram Matrix for SMILES Strings using RDKFingerprint and Sinkhorn-Knopp Algorithm
di: Ali, Sarwan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ali, Sarwan, et al.
Pubblicazione: (2024)
EvoJail: Evolutionary Diverse Jailbreak Prompt Generation for Large Language Models
di: Tang, Rui, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Tang, Rui, et al.
Pubblicazione: (2026)
Exploring Protein Language Model Architecture-Induced Biases for Antibody Comprehension
di: Mengren, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Mengren, et al.
Pubblicazione: (2025)
MIK: Modified Isolation Kernel for Biological Sequence Visualization, Classification, and Clustering
di: Ali, Sarwan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ali, Sarwan, et al.
Pubblicazione: (2024)
Antibody DomainBed: Out-of-Distribution Generalization in Therapeutic Protein Design
di: Tagasovska, Nataša, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Tagasovska, Nataša, et al.
Pubblicazione: (2024)
EvoComp: Learning Visual Token Compression for Multimodal Large Language Models via Semantic-Guided Evolutionary Labeling
di: Song, Jiafei, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Song, Jiafei, et al.
Pubblicazione: (2026)
TabStruct: Measuring Structural Fidelity of Tabular Data
di: Jiang, Xiangjian, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jiang, Xiangjian, et al.
Pubblicazione: (2025)
EvoMAS: Evolutionary Generation of Multi-Agent Systems
di: Hu, Yuntong, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Hu, Yuntong, et al.
Pubblicazione: (2026)
Joint Design of Protein Surface and Structure Using a Diffusion Bridge Model
di: Li, Guanlue, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Li, Guanlue, et al.
Pubblicazione: (2025)
Fast and Accurate Antibody Sequence Design via Structure Retrieval
di: Zhang, Xingyi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Xingyi, et al.
Pubblicazione: (2025)
PriorZero: Bridging Language Priors and World Models for Decision Making
di: Xiong, Junyu, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Xiong, Junyu, et al.
Pubblicazione: (2026)
Language-Induced Priors for Domain Adaptation
di: Chen, Qiyuan, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Chen, Qiyuan, et al.
Pubblicazione: (2026)
CDR-Agent: Intelligent Selection and Execution of Clinical Decision Rules Using Large Language Model Agents
di: Xiang, Zhen, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Xiang, Zhen, et al.
Pubblicazione: (2025)
Towards A Generative Protein Evolution Machine with DPLM-Evo
di: Wang, Xinyou, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wang, Xinyou, et al.
Pubblicazione: (2026)
When More Parameters Hurt: Foundation Model Priors Amplify Worst-Client Disparity Under Extreme Federated Heterogeneity
di: Naseer, Kiran, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Naseer, Kiran, et al.
Pubblicazione: (2026)
StructCoder: Structure-Aware Transformer for Code Generation
di: Tipirneni, Sindhu, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Tipirneni, Sindhu, et al.
Pubblicazione: (2022)
EvoEGF-Mol: Evolving Exponential Geodesic Flow for Structure-based Drug Design
di: Jin, Yaowei, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Jin, Yaowei, et al.
Pubblicazione: (2026)
EvoGPT-f: An Evolutionary GPT Framework for Benchmarking Formal Math Languages
di: Mercer, Johnathan
Pubblicazione: (2024)
di: Mercer, Johnathan
Pubblicazione: (2024)
EvoSyn: Generalizable Evolutionary Data Synthesis for Verifiable Learning
di: Du, He, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Du, He, et al.
Pubblicazione: (2025)
StructComp: Substituting Propagation with Structural Compression in Training Graph Contrastive Learning
di: Zhang, Shengzhong, et al.
Pubblicazione: (2023)
di: Zhang, Shengzhong, et al.
Pubblicazione: (2023)
BioBridge: Bridging Proteins and Language for Enhanced Biological Reasoning with LLMs
di: Wang, Yujia, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wang, Yujia, et al.
Pubblicazione: (2026)
EvoFA: Evolvable Fast Adaptation for EEG Emotion Recognition
di: Jin, Ming, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Jin, Ming, et al.
Pubblicazione: (2024)
EvoLen: Evolution-Guided Tokenization for DNA Language Model
di: Huang, Nan, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Huang, Nan, et al.
Pubblicazione: (2026)
Structure-Informed Protein Language Model
di: Zhang, Zuobai, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zhang, Zuobai, et al.
Pubblicazione: (2024)
StructSAM: Structure- and Spectrum-Preserving Token Merging for Segment Anything Models
di: Nguyen, Duy M. H., et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Nguyen, Duy M. H., et al.
Pubblicazione: (2026)
Struct-Bench: A Benchmark for Differentially Private Structured Text Generation
di: Wang, Shuaiqi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wang, Shuaiqi, et al.
Pubblicazione: (2025)
SemStruct: Contextualizing Semantic Embeddings with Structural Information for Schema Matching
di: Kang, Inwon, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Kang, Inwon, et al.
Pubblicazione: (2026)
Decoupled Sequence and Structure Generation for Realistic Antibody Design
di: Kim, Nayoung, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Kim, Nayoung, et al.
Pubblicazione: (2024)
Documenti analoghi
-
ConTact: Contact-First Antibody CDR Design via Explicit Interface Reasoning
di: Ahmed, Mansoor, et al.
Pubblicazione: (2026) -
CHIMERA-Bench: A Benchmark Dataset for Epitope-Specific Antibody Design
di: Ahmed, Mansoor, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Breaking the Euclidean Barrier: Hyperboloid-Based Biological Sequence Analysis
di: Ali, Sarwan, et al.
Pubblicazione: (2025) -
EvoFlows: Evolutionary Edit-Based Flow-Matching for Protein Engineering
di: Deutschmann, Nicolas, et al.
Pubblicazione: (2026) -
EvoPress: Accurate Dynamic Model Compression via Evolutionary Search
di: Sieberling, Oliver, et al.
Pubblicazione: (2024)