Structure-Guided Adaptive Propagation for Protein-Protein Interaction Site Prediction
Fuente:
arXiv
Salvato in:
| Autori principali: | Zhu, Enqiang, Liu, Yizi, Luo, Yilong, Chen, Yao, Zhang, Yu, Ma, Baoshan |
|---|---|
| Natura: | Preprint |
| Pubblicazione: |
2026
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Cohesive Group Discovery in Interaction Graphs under Explicit Density Constraints
di: Zhang, Yu, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Yu, et al.
Pubblicazione: (2025)
Learning the Interaction Prior for Protein-Protein Interaction Prediction: A Model-Agnostic Approach
di: Gao, Ziqi, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Gao, Ziqi, et al.
Pubblicazione: (2026)
Phi-Former: A Pairwise Hierarchical Approach for Compound-Protein Interactions Prediction
di: Wang, Zhe, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wang, Zhe, et al.
Pubblicazione: (2026)
Attending on Multilevel Structure of Proteins enables Accurate Prediction of Cold-Start Drug-Target Interactions
di: Zhang, Ziying, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Ziying, et al.
Pubblicazione: (2025)
PRING: Rethinking Protein-Protein Interaction Prediction from Pairs to Graphs
di: Zheng, Xinzhe, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zheng, Xinzhe, et al.
Pubblicazione: (2025)
Mining Large Independent Sets on Massive Graphs
di: Zhang, Yu, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Zhang, Yu, et al.
Pubblicazione: (2022)
Optimizing Minimum Vertex Cover Solving via a GCN-assisted Heuristic Algorithm
di: Zhu, Enqiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhu, Enqiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
AlphaFolding: 4D Diffusion for Dynamic Protein Structure Prediction with Reference and Motion Guidance
di: Cheng, Kaihui, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Cheng, Kaihui, et al.
Pubblicazione: (2024)
PSC-CPI: Multi-Scale Protein Sequence-Structure Contrasting for Efficient and Generalizable Compound-Protein Interaction Prediction
di: Wu, Lirong, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Wu, Lirong, et al.
Pubblicazione: (2024)
Atom-level Protein Representation Learning Improves Protein Structure Prediction
di: Kim, Taewon, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Kim, Taewon, et al.
Pubblicazione: (2026)
HelixFold-Multimer: Elevating Protein Complex Structure Prediction to New Heights
di: Fang, Xiaomin, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Fang, Xiaomin, et al.
Pubblicazione: (2024)
Protein Secondary Structure Prediction Using Transformers
di: Maxime, Manzi Kevin
Pubblicazione: (2025)
di: Maxime, Manzi Kevin
Pubblicazione: (2025)
Advanced Deep Learning Methods for Protein Structure Prediction and Design
di: Zhang, Yichao, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Yichao, et al.
Pubblicazione: (2025)
Guiding Multi-agent Multi-task Reinforcement Learning by a Hierarchical Framework with Logical Reward Shaping
di: Liu, Chanjuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Liu, Chanjuan, et al.
Pubblicazione: (2024)
MolChord: Structure-Sequence Alignment for Protein-Guided Drug Design
di: Zhang, Wei, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Wei, et al.
Pubblicazione: (2025)
HyboWaveNet: Hyperbolic Graph Neural Networks with Multi-Scale Wavelet Transform for Protein-Protein Interaction Prediction
di: Yu, Qingzhi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yu, Qingzhi, et al.
Pubblicazione: (2025)
Speak to a Protein: An Interactive Multimodal Co-Scientist for Protein Analysis
di: Navarro, Carles, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Navarro, Carles, et al.
Pubblicazione: (2025)
Protein-SE(3): Benchmarking SE(3)-based Generative Models for Protein Structure Design
di: Yu, Lang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yu, Lang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Dynamic Location Search for Identifying Maximum Weighted Independent Sets in Complex Networks
di: Zhu, Enqiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhu, Enqiang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Secondary Structure-Guided Novel Protein Sequence Generation with Latent Graph Diffusion
di: Hu, Yutong, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Hu, Yutong, et al.
Pubblicazione: (2024)
Learning to Predict Mutation Effects of Protein-Protein Interactions by Microenvironment-aware Hierarchical Prompt Learning
di: Wu, Lirong, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Wu, Lirong, et al.
Pubblicazione: (2024)
The Docking Game: Loop Self-Play for Fast, Dynamic, and Accurate Prediction of Flexible Protein-Ligand Binding
di: Zhang, Youzhi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhang, Youzhi, et al.
Pubblicazione: (2025)
Quantifying the Role of OpenFold Components in Protein Structure Prediction
di: Hayes, Tyler L., et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Hayes, Tyler L., et al.
Pubblicazione: (2025)
An Interpretable Framework Applying Protein Words to Predict Protein-Small Molecule Complementary Pairing Rules
di: Chen, Jingke, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Chen, Jingke, et al.
Pubblicazione: (2026)
ProteinGPT: Multimodal LLM for Protein Property Prediction and Structure Understanding
di: Xiao, Yijia, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Xiao, Yijia, et al.
Pubblicazione: (2024)
ProteinEngine: Empower LLM with Domain Knowledge for Protein Engineering
di: Shen, Yiqing, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Shen, Yiqing, et al.
Pubblicazione: (2024)
Multi-level Interaction Modeling for Protein Mutational Effect Prediction
di: Mo, Yuanle, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Mo, Yuanle, et al.
Pubblicazione: (2024)
Towards Interpretable Protein Structure Prediction with Sparse Autoencoders
di: Parsan, Nithin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Parsan, Nithin, et al.
Pubblicazione: (2025)
S$^2$Drug: Bridging Protein Sequence and 3D Structure in Contrastive Representation Learning for Virtual Screening
di: He, Bowei, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: He, Bowei, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structure-Aligned Protein Language Model
di: Chen, Can, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Chen, Can, et al.
Pubblicazione: (2025)
Ligand-Conditioned Discrete Diffusion for Protein Sequence-Structure Co-Design
di: Wei, Chen, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wei, Chen, et al.
Pubblicazione: (2026)
Effective Protein-Protein Interaction Exploration with PPIretrieval
di: Hua, Chenqing, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Hua, Chenqing, et al.
Pubblicazione: (2024)
Dynamics-inspired Structure Hallucination for Protein-protein Interaction Modeling
di: Wu, Fang, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wu, Fang, et al.
Pubblicazione: (2026)
ProteinOPD: Towards Effective and Efficient Preference Alignment for Protein Design
di: Zhang, Yulin, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Zhang, Yulin, et al.
Pubblicazione: (2026)
TaxDiff: Taxonomic-Guided Diffusion Model for Protein Sequence Generation
di: Zongying, Lin, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Zongying, Lin, et al.
Pubblicazione: (2024)
Group Ligands Docking to Protein Pockets
di: Guan, Jiaqi, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Guan, Jiaqi, et al.
Pubblicazione: (2025)
Orientation-Aware Graph Neural Networks for Protein Structure Representation Learning
di: Li, Jiahan, et al.
Pubblicazione: (2022)
di: Li, Jiahan, et al.
Pubblicazione: (2022)
Protein Design with Dynamic Protein Vocabulary
di: Liu, Nuowei, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Liu, Nuowei, et al.
Pubblicazione: (2025)
Multimodal Mixture-of-Experts with Retrieval Augmentation for Protein Active Site Identification
di: Wu, Jiayang, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Wu, Jiayang, et al.
Pubblicazione: (2026)
Protein Representation Learning by Capturing Protein Sequence-Structure-Function Relationship
di: Ko, Eunji, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ko, Eunji, et al.
Pubblicazione: (2024)
Documenti analoghi
-
Cohesive Group Discovery in Interaction Graphs under Explicit Density Constraints
di: Zhang, Yu, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Learning the Interaction Prior for Protein-Protein Interaction Prediction: A Model-Agnostic Approach
di: Gao, Ziqi, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Phi-Former: A Pairwise Hierarchical Approach for Compound-Protein Interactions Prediction
di: Wang, Zhe, et al.
Pubblicazione: (2026) -
Attending on Multilevel Structure of Proteins enables Accurate Prediction of Cold-Start Drug-Target Interactions
di: Zhang, Ziying, et al.
Pubblicazione: (2025) -
PRING: Rethinking Protein-Protein Interaction Prediction from Pairs to Graphs
di: Zheng, Xinzhe, et al.
Pubblicazione: (2025)