Genoma mitocondrial completo del lenguado de California, Paralichthys californicus

Fuente: Ciencias Marinas

The California halibut, Paralichthys californicus, is a highly priced flatfish because of its size and meat quality. This work presents the complete mitochondrial genome of P. californicus. Total DNA from muscle tissue was extracted and sequenced using the Illumina platform. Reads were cleaned, trim...

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Published in:	Ciencias Marinas
Main Authors:	Vargas-Peralta, Carmen E, Farfán, Claudia, Lafarga-De La Cruz, Fabiola, Barón-Sevilla, Benjamín, Del Río-Portilla, Miguel A
Format:	Artículo científico
Language:	English
Published:	Universidad Autónoma de Baja California, Instituto de Investigaciones Oceanológicas 2020
Subjects:	mitogenoma secuenciación de siguiente generación (NGS) secuenciación masiva lenguado de California Paralichthys californicus mitogenome next-generation sequencing (NGS) mass sequencing California halibut
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Description
Summary:	The California halibut, Paralichthys californicus, is a highly priced flatfish because of its size and meat quality. This work presents the complete mitochondrial genome of P. californicus. Total DNA from muscle tissue was extracted and sequenced using the Illumina platform. Reads were cleaned, trimmed, assembled de novo, and annotated. The California halibut mitogenome is 16,858 bp in length (GenBank accession number: MT859134), containing 13 protein-coding genes, 22 tRNAs, 2 rRNAs, and the control region. P. californicus mitogenome was most similar to Paralichthys olivaceus than to other flatfish mitogenomes, in agreement with their geographic distribution. This information deepens the knowledge of the California halibut, which is not only ecologically important, but also a socioeconomically relevant resource for fishery and aquaculture in California, USA, and Baja California, Mexico. El lenguado de California, Paralichthys californicus, es una especie de pez plano con un alto valor econónico debido a su tamaño y a la calidad de su carne. En este trabajo se presenta el genoma mitocondrial completo de P. californicus. Se extrajo ADN total de tejido muscular y se secuenció utilizando la plataforma Illumina. Las lecturas obtenidas se limpiaron, se recortaron, se ensamblaron de novo y se anotaron. El mitogenoma del lenguado de California tiene una logitud de 16,858 pb (número de acceso del GenBank: MT859134) y contiene 13 genes codificadores de proteínas, 22 ARNt, 2 ARNr y la región control. El mitogenoma de P. californicus fue más similar al de Paralichthys olivaceus que a mitogenomas de otros peces planos, en concordancia con su distribución geográfica. La información aquí presentada incrementa el conocimiento del lenguado de California, el cual no solo es una especie de importancia económica, sino también un recurso socioeconómico relevante para la pesquería y la acuicultura de California, EUA, y de Baja California, México.

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