SMAC: identifying DNA N6-methyladenine (6mA) at the single-molecule level using SMRT CCS data.
Fuente:
PubMed
Salvato in:
| Autori principali: | Li, Haicheng, Niu, Junhua, Sheng, Yalan, Liu, Yifan, Gao, Shan |
|---|---|
| Natura: | Artículo científico |
| Lingua: | en |
| Pubblicazione: |
Briefings in bioinformatics
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
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