Detección por PCR de Colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en Antioquia, Colombia

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1. Verfasser: Leonardo Martínez Pacheco
Format: Artículo científico
Sprache:es
Veröffentlicht: Universidad Nacional de Colombia 2014
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author Leonardo Martínez Pacheco
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contents Detección por PCR de Colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en Antioquia, Colombia Leonardo Martínez Pacheco Katherin Vanegas Berrouet Mauricio Salazar Yepes Pablo Gutiérrez Sánchez Mauricio Marín Montoya Agrociencias RFLPs antracnosis DNA ribosomal permeasa de hierro Phaseolus vulgaris Colletotrichum lindemuthianum , agente causal d e la antracnosis del frijol, es uno de los patógenos más limitantes en la producción de este cultivo. La detección y correcta identificación de este hongo resulta fundamental para el manejo de la enfermedad, siendo las pruebas moleculares alternativas rápidas y sensibles para este fin. Mediante la técnica de PCR se evaluaron cuatro juegos de cebadores (CY1/CY2, CD1/CD2, ClF4/ITS4 y ClF432/ClR533) para la detección de C. lindemuthianum a partir de tejidos foliares, de vainas y de semillas procedentes de cultivos de frijol de Antioquia, Colombia. Los resultados indicaron que el par CD1/CD2, dirigido al pseudogen de permeasa de hierro Ftr1 , fue el más efectivo para detectar el hongo en tejidos y semillas de frijol, así como para identificar aislamientos en cultivos microbiológicos. Para los cebadores CY1/CY2, dirigidos a los ITS del rDNA, se recomienda un esquema de PCR-RFLPs con Mse I (= Tru 1I) para la diferenciación con las especies C. orbiculare y C. trifolii . Estos cebadores generaron resultados consistentes cuando se utilizaron en combinación con ITS1 (ITS1/CY2) e ITS4 (CY1/ITS4). Finalmente, los cebadores ClF4/ITS4 resultaron en amplificaciones inespecíficas y ClF432/ClR533 en fragmentos de difícil resolución en electroforesis de agarosa. Este estudio servirá de apoyo para los programas de certificación de semilla y mejoramiento genético de frijol. 2014 artículo científico 0120-2812 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=169932435010 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=1699 Acta Agronómica application/pdf Universidad Nacional de Colombia Acta Agronómica (Colombia) Num.4 Vol.63
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Detección por PCR de Colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en Antioquia, Colombia Leonardo Martínez Pacheco Katherin Vanegas Berrouet Mauricio Salazar Yepes Pablo Gutiérrez Sánchez Mauricio Marín Montoya Agrociencias RFLPs antracnosis DNA ribosomal permeasa de hierro Phaseolus vulgaris Colletotrichum lindemuthianum , agente causal d e la antracnosis del frijol, es uno de los patógenos más limitantes en la producción de este cultivo. La detección y correcta identificación de este hongo resulta fundamental para el manejo de la enfermedad, siendo las pruebas moleculares alternativas rápidas y sensibles para este fin. Mediante la técnica de PCR se evaluaron cuatro juegos de cebadores (CY1/CY2, CD1/CD2, ClF4/ITS4 y ClF432/ClR533) para la detección de C. lindemuthianum a partir de tejidos foliares, de vainas y de semillas procedentes de cultivos de frijol de Antioquia, Colombia. Los resultados indicaron que el par CD1/CD2, dirigido al pseudogen de permeasa de hierro Ftr1 , fue el más efectivo para detectar el hongo en tejidos y semillas de frijol, así como para identificar aislamientos en cultivos microbiológicos. Para los cebadores CY1/CY2, dirigidos a los ITS del rDNA, se recomienda un esquema de PCR-RFLPs con Mse I (= Tru 1I) para la diferenciación con las especies C. orbiculare y C. trifolii . Estos cebadores generaron resultados consistentes cuando se utilizaron en combinación con ITS1 (ITS1/CY2) e ITS4 (CY1/ITS4). Finalmente, los cebadores ClF4/ITS4 resultaron en amplificaciones inespecíficas y ClF432/ClR533 en fragmentos de difícil resolución en electroforesis de agarosa. Este estudio servirá de apoyo para los programas de certificación de semilla y mejoramiento genético de frijol. 2014 artículo científico 0120-2812 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=169932435010 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=1699 Acta Agronómica application/pdf Universidad Nacional de Colombia Acta Agronómica (Colombia) Num.4 Vol.63
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