Identificación de genes relacionados a sequía en papas nativas empleando RNA-Seq

Fuente: Redalyc
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Main Author: Yerisf Torres
Format: Artículo científico
Language:es
Published: Universidad Nacional Mayor de San Marcos 2013
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author Yerisf Torres
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contents Identificación de genes relacionados a sequía en papas nativas empleando RNA-Seq Yerisf Torres Roberto Lozano Carlos Merino Gisella Orjeda Biología RNA Seq papa mRNA sequía El reciente desarrollo del RNA-Seq, un método de secuenciamiento masivo en paralelo para el análisis de transcriptomas permite conocer el perfil de expresión de las plantas en respuesta a estrés de tipo abiótico y biótico. En este estudio, se secuenció el mRNA proveniente de hojas y raíces de dos variedades de papas nativas expuestas a diferentes niveles de sequía. Lecturas o reads de 50 pares de bases provenientes de mRNA se mapearon al genoma de papa: 75 – 82% mapearon a posiciones únicas, 6 – 14% mapearon a múltiples posiciones y 9 – 12% no mapearon a posición alguna del genoma. Comparando los perfiles de expresión, se encontraron entre 887 – 1925 genes inducidos/reprimidos por sequía en la variedad sensible y 998 – 1995 en la tolerante. Este estudio generó información de gran valor que podrá ser utilizada en futuros estudios para comprender mejor los mecanismos moleculares de resistencia a sequía en papa y especies cercanas. 2013 artículo científico 1561-0837 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=195030135002 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=1950 Revista Peruana de Biología application/pdf Universidad Nacional Mayor de San Marcos Revista Peruana de Biología (Perú) Num.3 Vol.20
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Identificación de genes relacionados a sequía en papas nativas empleando RNA-Seq Yerisf Torres Roberto Lozano Carlos Merino Gisella Orjeda Biología RNA Seq papa mRNA sequía El reciente desarrollo del RNA-Seq, un método de secuenciamiento masivo en paralelo para el análisis de transcriptomas permite conocer el perfil de expresión de las plantas en respuesta a estrés de tipo abiótico y biótico. En este estudio, se secuenció el mRNA proveniente de hojas y raíces de dos variedades de papas nativas expuestas a diferentes niveles de sequía. Lecturas o reads de 50 pares de bases provenientes de mRNA se mapearon al genoma de papa: 75 – 82% mapearon a posiciones únicas, 6 – 14% mapearon a múltiples posiciones y 9 – 12% no mapearon a posición alguna del genoma. Comparando los perfiles de expresión, se encontraron entre 887 – 1925 genes inducidos/reprimidos por sequía en la variedad sensible y 998 – 1995 en la tolerante. Este estudio generó información de gran valor que podrá ser utilizada en futuros estudios para comprender mejor los mecanismos moleculares de resistencia a sequía en papa y especies cercanas. 2013 artículo científico 1561-0837 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=195030135002 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=1950 Revista Peruana de Biología application/pdf Universidad Nacional Mayor de San Marcos Revista Peruana de Biología (Perú) Num.3 Vol.20
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