Microorganismos asociados a la rizosfera de jitomate en un agroecosistema del valle de Guasave, Sinaloa, México

Fuente: Redalyc
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1. Verfasser: Jesús Damián Cordero-Ramírez
Format: Artículo científico
Sprache:es
Veröffentlicht: Universidad Nacional Autónoma de México 2012
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author Jesús Damián Cordero-Ramírez
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contents Microorganismos asociados a la rizosfera de jitomate en un agroecosistema del valle de Guasave, Sinaloa, México Jesús Damián Cordero-Ramírez Raquel López-Rivera Carlos Ligne Calderón-Vázquez Alejandro Miguel Figueroa-López Juan Carlos Martínez-Álvarez Karla Yeriana Leyva-Madrigal Rocío Guadalupe Cervantes-Gámez Ignacio Eduardo Maldonado-Mendoza Biología ITS Rizosfera ADN ribosomal jitomate cultivado La diversidad de los microorganismos asociados a la rizosfera de diferentes especies vegetales en los suelos, en México se ha estudiado poco y se ha abordado de manera convencional, con técnicas microbiológicas limitadas debido al elevado porcentaje de microorganismos no-cultivables (95-99%). En el presente trabajo se empleó el análisis por secuenciación del ADN ribosomal (ADNr) para evitar esa limitante y explorar mejor la diversidad de los microorganismos cultivables y no-cultivables asociados al jitomate (Solanum lycopersicum L.) en un agroecosistema en Sinaloa. Se empleó ADN genómico extraído del suelo rizosférico para amplificar una región hipervariable en el ADNr empleando oligonucleótidos universales para ADNr procariota y eucariota. El análisis de 194 y 384 secuencias de ADNr de origen procariota y eucariota, respectivamente, mostró que los phyla eucariotes más abundantes fueron Ascomycota (59%), Chlorophyta (21%) y Basidiomycota (12%), y los más abundantes de origen procariote fueron Firmicutes (45%), Proteobacteria (14.7%) y Gemmatimonadetes (13.1%). El presente trabajo representa a la fecha la caracterización más completa de la diversidad de microorganismos de la rizosfera del jitomate. Se discute el papel que especies identificadas en este trabajo, pertenecientes a géneros procariotas (Bacillus y Paenibacillus) y eucariotas (Alternaria), pudieran desempeñar en la rizosfera del jitomate y en el control biológico de fitopatogénos en esta especie. 2012 artículo científico 1870-3453 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=42525103014 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=425 Revista Mexicana de Biodiversidad application/pdf Universidad Nacional Autónoma de México Revista Mexicana de Biodiversidad (México) Num.3 Vol.83
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Biología
ITS
Rizosfera
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jitomate cultivado
Microorganismos asociados a la rizosfera de jitomate en un agroecosistema del valle de Guasave, Sinaloa, México Jesús Damián Cordero-Ramírez Raquel López-Rivera Carlos Ligne Calderón-Vázquez Alejandro Miguel Figueroa-López Juan Carlos Martínez-Álvarez Karla Yeriana Leyva-Madrigal Rocío Guadalupe Cervantes-Gámez Ignacio Eduardo Maldonado-Mendoza Biología ITS Rizosfera ADN ribosomal jitomate cultivado La diversidad de los microorganismos asociados a la rizosfera de diferentes especies vegetales en los suelos, en México se ha estudiado poco y se ha abordado de manera convencional, con técnicas microbiológicas limitadas debido al elevado porcentaje de microorganismos no-cultivables (95-99%). En el presente trabajo se empleó el análisis por secuenciación del ADN ribosomal (ADNr) para evitar esa limitante y explorar mejor la diversidad de los microorganismos cultivables y no-cultivables asociados al jitomate (Solanum lycopersicum L.) en un agroecosistema en Sinaloa. Se empleó ADN genómico extraído del suelo rizosférico para amplificar una región hipervariable en el ADNr empleando oligonucleótidos universales para ADNr procariota y eucariota. El análisis de 194 y 384 secuencias de ADNr de origen procariota y eucariota, respectivamente, mostró que los phyla eucariotes más abundantes fueron Ascomycota (59%), Chlorophyta (21%) y Basidiomycota (12%), y los más abundantes de origen procariote fueron Firmicutes (45%), Proteobacteria (14.7%) y Gemmatimonadetes (13.1%). El presente trabajo representa a la fecha la caracterización más completa de la diversidad de microorganismos de la rizosfera del jitomate. Se discute el papel que especies identificadas en este trabajo, pertenecientes a géneros procariotas (Bacillus y Paenibacillus) y eucariotas (Alternaria), pudieran desempeñar en la rizosfera del jitomate y en el control biológico de fitopatogénos en esta especie. 2012 artículo científico 1870-3453 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=42525103014 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=425 Revista Mexicana de Biodiversidad application/pdf Universidad Nacional Autónoma de México Revista Mexicana de Biodiversidad (México) Num.3 Vol.83
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