Análisis de curvas de fusión de alta resolución para identificar el sexo en papaya (Carica papaya L.)

Fuente: Redalyc
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Main Author: Walter Barrantes-Santamaría
Format: Artículo científico
Language:es
Published: Universidad de Costa Rica 2022
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author Walter Barrantes-Santamaría
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contents Análisis de curvas de fusión de alta resolución para identificar el sexo en papaya (Carica papaya L.) Walter Barrantes-Santamaría Elodia M. Sánchez-Barrantes Agrociencias fitomejoramiento Temperatura de fusión fusión de alta resolución nucleótido de polimorfismo único Introducción. El sexado de las plantas de papaya (Carica papaya L.) en plantaciones comerciales se suele hacer de forma visual una vez que la planta emite la flor. También existen procedimientos biotecnológicos como la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), utilizados para detectar a edades tempranas el sexo de la papaya, sin embargo, ambos métodos mencionados presentan una serie de inconvenientes entre ellos los falsos positivos. Objetivo. Identificar el sexo en plántulas de papaya con marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) de alto grado de precisión. Materiales y métodos. La investigación se realizó en la Estación Experimental Agrícola Fabio Baudrit Moreno de la Universidad de Costa Rica, durante los meses de febrero a octubre del año 2020. Se evaluaron ocho marcadores SNP en plantas de papaya de sexo conocido mediante la técnica HRMA (siglas en inglés: High Resolution Melting Analysis), se escogió el mejor y se reevaluó en dos poblaciones del programa de mejora genética de este cultivo, las plantas sexadas se sembraron en campo para comparar el sexado molecular con el real en campo. Resultados. Varios de los marcadores SNP evaluados fueron polimórficos y podrían ser usados para identificar el sexo en la papaya, sin embargo, el marcador CpSERK_HRM_34704 fue el que se ajustó más a los criterios de selección. Conclusión. Para el caso del híbrido de papaya Pococí y poblaciones de mejora emparentadas con el mismo, el marcador CpSERK_HRM_34704 mostró un 100 % de precisión entre le sexado molecular de las plántulas en el almácigo con la técnica HRM y el sexo real de las mismas plantas sembradas en el campo. 2022 artículo científico 2215-3608 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=43771129001 https://www.redalyc.org/journal/437/43771129001/ https://www.redalyc.org/journal/437/43771129001/html/ https://www.redalyc.org/journal/437/43771129001/43771129001.epub https://www.redalyc.org/journal/437/43771129001/movil https://doi.org/10.15517/am.v33i3.48750 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=437 Agronomía Mesoamericana application/pdf Universidad de Costa Rica Agronomía Mesoamericana (Costa Rica) Num.3 Vol.33
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Análisis de curvas de fusión de alta resolución para identificar el sexo en papaya (Carica papaya L.) Walter Barrantes-Santamaría Elodia M. Sánchez-Barrantes Agrociencias fitomejoramiento Temperatura de fusión fusión de alta resolución nucleótido de polimorfismo único Introducción. El sexado de las plantas de papaya (Carica papaya L.) en plantaciones comerciales se suele hacer de forma visual una vez que la planta emite la flor. También existen procedimientos biotecnológicos como la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), utilizados para detectar a edades tempranas el sexo de la papaya, sin embargo, ambos métodos mencionados presentan una serie de inconvenientes entre ellos los falsos positivos. Objetivo. Identificar el sexo en plántulas de papaya con marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) de alto grado de precisión. Materiales y métodos. La investigación se realizó en la Estación Experimental Agrícola Fabio Baudrit Moreno de la Universidad de Costa Rica, durante los meses de febrero a octubre del año 2020. Se evaluaron ocho marcadores SNP en plantas de papaya de sexo conocido mediante la técnica HRMA (siglas en inglés: High Resolution Melting Analysis), se escogió el mejor y se reevaluó en dos poblaciones del programa de mejora genética de este cultivo, las plantas sexadas se sembraron en campo para comparar el sexado molecular con el real en campo. Resultados. Varios de los marcadores SNP evaluados fueron polimórficos y podrían ser usados para identificar el sexo en la papaya, sin embargo, el marcador CpSERK_HRM_34704 fue el que se ajustó más a los criterios de selección. Conclusión. Para el caso del híbrido de papaya Pococí y poblaciones de mejora emparentadas con el mismo, el marcador CpSERK_HRM_34704 mostró un 100 % de precisión entre le sexado molecular de las plántulas en el almácigo con la técnica HRM y el sexo real de las mismas plantas sembradas en el campo. 2022 artículo científico 2215-3608 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=43771129001 https://www.redalyc.org/journal/437/43771129001/ https://www.redalyc.org/journal/437/43771129001/html/ https://www.redalyc.org/journal/437/43771129001/43771129001.epub https://www.redalyc.org/journal/437/43771129001/movil https://doi.org/10.15517/am.v33i3.48750 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=437 Agronomía Mesoamericana application/pdf Universidad de Costa Rica Agronomía Mesoamericana (Costa Rica) Num.3 Vol.33
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