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| Autore principale: | |
|---|---|
| Natura: | Artículo científico |
| Lingua: | es |
| Pubblicazione: |
Universidad de Oriente
2005
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| Soggetti: | |
| Accesso online: | https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=443543686052 |
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Sommario:
- DEFINICIÓN DEL ÍNDICE REFRACTOTOPOGRÁFICO DE SUPERFICIE PARA LA EVALUACIÓN DE INTERACCIONES PROTEÍNA-PROTEÍNA Leonardo Mokarzel Falcón Juan Alexander Padrón García Ramón Carrasco Velar Química Se desarrollo un ensayo novedoso para describir la interacción entre macromoléculasde interés biológico: el Momento Refractotopográfico de Superficie (RTsm,Refracto-Topographical Surface Momentum).El RTsm describe la complementariedadsuperficial entre dos biopolímeros en contacto (proteína-proteína, proteína-ácido nucleico o proteína-ligando en general), basándose en la contribución de las fuerzas dispersivas de London en la superficie de contacto. Siendo A y B dos biomoléculas, el RTsm se define como el valor modular de la resta entre la perturbación global de la refractividad (∆ARa) de A sobre B y la ∆ARa de B sobre A. Se elaboró un programa para calcular el ensayo,dadas dos moléculas proteicas en interacción,y se aplicó posteriormente a varios modelosde proteínas en contacto, las cuales fueron generadas previamente con el programa dedocking GRAMM. Posteriormente se hizo el análisis de la interacción presente en el sistema Rodopsina-Arrestina que caracteriza la fase final del proceso de fototransducción en los bastones. Se mostró la capacidad del ensayo para identificar falsos positivos en interacciones entre proteínas y su potencial como una prueba rápida y eficiente para complementar el simple análisis geométrico empleado por muchos de los programas de docking para el análisis de sistemasmacromoleculares en interacción. 2005 artículo científico 0258-5995 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=443543686052 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=4435 Revista Cubana de Química application/pdf Universidad de Oriente Revista Cubana de Química (Cuba) Num.2 Vol.XVII