Bifidobacterias como indicadoras de contaminación fecal en aguas tropicales

Fuente: Redalyc
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Detalles Bibliográficos
Autor principal: Luz Adriana Sarmiento-Rubiano
Formato: Artículo científico
Lenguaje:es
Publicado: Universidad de Costa Rica 2019
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author Luz Adriana Sarmiento-Rubiano
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contents Bifidobacterias como indicadoras de contaminación fecal en aguas tropicales Luz Adriana Sarmiento-Rubiano Yina García Marianella Suarez-Marenco Vanesa Inés Hoyos Solana Jimmy E. Becerra Biología heces biomarcadores Bifidobacterium Contaminación del agua reacción en cadena de la polimerasa La contaminación fecal humana en el agua constituye un importante riesgo para la salud pública, sin embargo, los microorganismos indicadores comúnmente utilizados para detectar contaminación fecal no identifican su fuente específica. La detección de ciertas especies del género Bifidobacterium como B. adolescentis y B. dentium ha sido propuesta como un efectivo marcador de contaminación fecal humana, pero esto no ha sido evaluado en las condiciones ambientales tropicales. El objetivo de este trabajo fue determinar el perfil de bifidobacterias, en una muestra de agua de la Ciénaga de Mesolandia en el Caribe Colombiano y en 260 muestras fecales humanas y 94 de animales domésticos de un asentamiento humano periférico a la ciénaga. El ADN extraído de cada una de las muestras fue amplificado por PCR mediante el uso de cebadores específicos de género basados en la secuencia del gen 16S ARNr y separados por DGGE (Electroforesis en Gel con Gradiente Desnaturalizante). Las bandas obtenidas en DGGE, fueron extraídas del gel, re-amplificadas, secuenciadas y las secuencias comparadas con la base de datos del GenBank. El perfil de bifidobacterias en DGGE mostró la presencia de ocho especies de Bifidobacterias en la muestra de agua, las cuales también fueron identificadas en las heces humanas. B. adolescentis y B. dentium propuestas como marcadores de contaminación fecal humana, también fueron encontradas en animales domésticos. En este estudio bajo las condiciones ambientales y experimentales evaluadas no fue posible encontrar una especie de Bifidobacteria específica para ser utilizada como marcador de contaminación fecal humana en ambientes tropicales. Sin embargo, el método aplicado permitió una aproximación más cercana al origen de la contaminación fecal en relación con los métodos culturales tradicionales, ya que fue posible encontrar secuencias de ADN idénticas en el agua y en las muestras fecales. 2019 artículo científico 0034-7744 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=44965786016 https://www.redalyc.org/journal/449/44965786016/ https://www.redalyc.org/journal/449/44965786016/html/ https://www.redalyc.org/journal/449/44965786016/44965786016.epub https://www.redalyc.org/journal/449/44965786016/movil 10.15517/RBT.V67I3.33843 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=449 Revista de Biología Tropical application/pdf Universidad de Costa Rica Revista de Biología Tropical (Costa Rica) Num.3 Vol.67
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reacción en cadena de la polimerasa
Bifidobacterias como indicadoras de contaminación fecal en aguas tropicales Luz Adriana Sarmiento-Rubiano Yina García Marianella Suarez-Marenco Vanesa Inés Hoyos Solana Jimmy E. Becerra Biología heces biomarcadores Bifidobacterium Contaminación del agua reacción en cadena de la polimerasa La contaminación fecal humana en el agua constituye un importante riesgo para la salud pública, sin embargo, los microorganismos indicadores comúnmente utilizados para detectar contaminación fecal no identifican su fuente específica. La detección de ciertas especies del género Bifidobacterium como B. adolescentis y B. dentium ha sido propuesta como un efectivo marcador de contaminación fecal humana, pero esto no ha sido evaluado en las condiciones ambientales tropicales. El objetivo de este trabajo fue determinar el perfil de bifidobacterias, en una muestra de agua de la Ciénaga de Mesolandia en el Caribe Colombiano y en 260 muestras fecales humanas y 94 de animales domésticos de un asentamiento humano periférico a la ciénaga. El ADN extraído de cada una de las muestras fue amplificado por PCR mediante el uso de cebadores específicos de género basados en la secuencia del gen 16S ARNr y separados por DGGE (Electroforesis en Gel con Gradiente Desnaturalizante). Las bandas obtenidas en DGGE, fueron extraídas del gel, re-amplificadas, secuenciadas y las secuencias comparadas con la base de datos del GenBank. El perfil de bifidobacterias en DGGE mostró la presencia de ocho especies de Bifidobacterias en la muestra de agua, las cuales también fueron identificadas en las heces humanas. B. adolescentis y B. dentium propuestas como marcadores de contaminación fecal humana, también fueron encontradas en animales domésticos. En este estudio bajo las condiciones ambientales y experimentales evaluadas no fue posible encontrar una especie de Bifidobacteria específica para ser utilizada como marcador de contaminación fecal humana en ambientes tropicales. Sin embargo, el método aplicado permitió una aproximación más cercana al origen de la contaminación fecal en relación con los métodos culturales tradicionales, ya que fue posible encontrar secuencias de ADN idénticas en el agua y en las muestras fecales. 2019 artículo científico 0034-7744 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=44965786016 https://www.redalyc.org/journal/449/44965786016/ https://www.redalyc.org/journal/449/44965786016/html/ https://www.redalyc.org/journal/449/44965786016/44965786016.epub https://www.redalyc.org/journal/449/44965786016/movil 10.15517/RBT.V67I3.33843 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=449 Revista de Biología Tropical application/pdf Universidad de Costa Rica Revista de Biología Tropical (Costa Rica) Num.3 Vol.67
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