Molecular taxonomy and community dynamics of Actinobacteria in marine sediments off central Chile
Fuente:
Redalyc
Guardado en:
| Autor principal: | |
|---|---|
| Formato: | Artículo científico |
| Lenguaje: | en |
| Publicado: |
Universidad de Valparaíso
2016
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| Materias: | |
| Acceso en línea: | |
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| _version_ | 1876483004129345536 |
|---|---|
| author | Selim S. Musleh |
| author_facet | Selim S. Musleh |
| contents | Molecular taxonomy and community dynamics of Actinobacteria in marine sediments off central Chile Selim S. Musleh Daniel Gomez-Uchida Carola Espinoza Nathaly Ruiz-Tagle Alexis Fonseca Víctor A. Gallardo Ciencias de la Tierra Actinobacteria ecología bacteriana Sulfureto de Humboldt Se usó pirosecuenciación de la región V6 del gen 16S del ARNr para caracterizar la diversidad y la dinámica espaciotemporal de unidades taxonómicas operacionales (OTUs) del filo Actinobacteria, los que fueron aislados desde sedimentos provenientes del Sulfureto de Humboldt frente a Chile central. Este substrato es rico en compuestos azufrados y material orgánico lo que mantiene una vasta comunidad microbiana que experimenta cambios estacionales en respuesta a regímenes oceanográficos contrastantes. Se identificaron 498 OTUs distribuidas en 7 órdenes, 47 familias, 122 géneros, (5 de los cuales son ampliamente reconocidos por sus aplicaciones biotecnológicas), y 56 especies. El análisis temporal reveló que algunos OTUs presentan diferencias significativas en abundancia, índices de diversidad y riqueza, las que generaron una agrupación de las muestras asociada a la fecha de muestreo (estación del año) y no a la profundidad del sitio de muestreo. Debido a que las Actinobacteria son mayormente aeróbicas, las altas concentraciones de oxígeno disuelto que ocurren en la zona en el otoño-invierno austral, representan condiciones ambientales beneficiosas para este filo, no así las de primavera-verano austral cuando prevalece la hipoxia. El presente trabajo se benefició de la aplicación de métodos cultivo-independientes (métodos moleculares) para evaluar la diversidad taxonómica y examinar la dinámica de uno de los grupos de bacterias presentes en el Sulfureto de Humboldt reportado como una fuente potencial e inexplorada de metabolitos secundarios. 2016 artículo científico 0717-3326 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=47945599009 en http://www.redalyc.org/revista.oa?id=479 Revista de Biología Marina y Oceanografía application/pdf Universidad de Valparaíso Revista de Biología Marina y Oceanografía (Chile) Num.1 Vol.51 |
| format | Artículo científico |
| id | redalyc_47945599009 |
| institution | Redalyc |
| language | en |
| publishDate | 2016 |
| publisher | Universidad de Valparaíso |
| spellingShingle | Molecular taxonomy and community dynamics of Actinobacteria in marine sediments off central Chile Selim S. Musleh Ciencias de la Tierra Actinobacteria ecología bacteriana Sulfureto de Humboldt Molecular taxonomy and community dynamics of Actinobacteria in marine sediments off central Chile Selim S. Musleh Daniel Gomez-Uchida Carola Espinoza Nathaly Ruiz-Tagle Alexis Fonseca Víctor A. Gallardo Ciencias de la Tierra Actinobacteria ecología bacteriana Sulfureto de Humboldt Se usó pirosecuenciación de la región V6 del gen 16S del ARNr para caracterizar la diversidad y la dinámica espaciotemporal de unidades taxonómicas operacionales (OTUs) del filo Actinobacteria, los que fueron aislados desde sedimentos provenientes del Sulfureto de Humboldt frente a Chile central. Este substrato es rico en compuestos azufrados y material orgánico lo que mantiene una vasta comunidad microbiana que experimenta cambios estacionales en respuesta a regímenes oceanográficos contrastantes. Se identificaron 498 OTUs distribuidas en 7 órdenes, 47 familias, 122 géneros, (5 de los cuales son ampliamente reconocidos por sus aplicaciones biotecnológicas), y 56 especies. El análisis temporal reveló que algunos OTUs presentan diferencias significativas en abundancia, índices de diversidad y riqueza, las que generaron una agrupación de las muestras asociada a la fecha de muestreo (estación del año) y no a la profundidad del sitio de muestreo. Debido a que las Actinobacteria son mayormente aeróbicas, las altas concentraciones de oxígeno disuelto que ocurren en la zona en el otoño-invierno austral, representan condiciones ambientales beneficiosas para este filo, no así las de primavera-verano austral cuando prevalece la hipoxia. El presente trabajo se benefició de la aplicación de métodos cultivo-independientes (métodos moleculares) para evaluar la diversidad taxonómica y examinar la dinámica de uno de los grupos de bacterias presentes en el Sulfureto de Humboldt reportado como una fuente potencial e inexplorada de metabolitos secundarios. 2016 artículo científico 0717-3326 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=47945599009 en http://www.redalyc.org/revista.oa?id=479 Revista de Biología Marina y Oceanografía application/pdf Universidad de Valparaíso Revista de Biología Marina y Oceanografía (Chile) Num.1 Vol.51 |
| title | Molecular taxonomy and community dynamics of Actinobacteria in marine sediments off central Chile |
| topic | Ciencias de la Tierra Actinobacteria ecología bacteriana Sulfureto de Humboldt |
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