Diferencias en los genes 16SrRNA y citocromo c oxidasa subunidad I de las lisas Mugil cephalus y Mugil curema y los robalos Centropomus viridis y Centropomus robalito
Fuente:
Redalyc · Ciencias Marinas
The mitochondrial genes coding for 16SrRNA and cytochrome c oxidase subunit I (COI) in four commercially important fish species from the Gulf of California were studied. These fish species were the striped mullet Mugil cephalus and white mullet Mugil curema, and the white snook Centropomus viridis a...
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| Publicado en: | Ciencias Marinas |
|---|---|
| Autor principal: | |
| Formato: | Artículo científico |
| Lenguaje: | es |
| Publicado: |
Universidad Autónoma de Baja California
2007
|
| Materias: | |
| Acceso en línea: | |
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| contents | Diferencias en los genes 16SrRNA y citocromo c oxidasa subunidad I de las lisas Mugil cephalus y Mugil curema y los robalos Centropomus viridis y Centropomus robalito R Pacheco-Aguilar AB Peregrino-Uriarte G Yepiz-Plascencia A Varela-Romero Ciencias de la Tierra COI peces 16SrRNA genes mitocondriales patrones de restricción Se estudiaron los genes mitocondriales codificantes del 16SrRNA y citocromo c oxidasa, subunidad I (COI), de cuatroespecies de peces comercialmente importantes del Golfo de California. Los peces incluyen dos lisas y dos robalos: la lisa rayadaMugil cephalus y la lisa blanca Mugil curema; y el robalo plateado Centropomus viridis y el robalo aleta amarilla Centropomusrobalito. Los fragmentos de los genes 16SrRNA y COI fueron obtenidos mediante amplificación por PCR. Las digestiones derestricción de los amplicones resultaron en patrones de bandeo diferentes entre las cuatro especies. Las distancias genéticasobtenidas con base en la secuencia del 16SrRNA fue menor que con COI para ambos grupos de especies. La inferenciafilogenética para ambos genes muestra monofilia para las cuatro especies en dos diferentes grupos, uno para las lisas y otro paralos robalos. La monofilia de estos grupos fue evidente a pesar de las politomías con el resto de las especies incluidas en losanálisis de remuestreo para máxima parsimonia y máxima verosimilitud. 2007 artículo científico 0185-3880 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=48033109 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=480 Ciencias Marinas application/pdf Universidad Autónoma de Baja California Ciencias Marinas (México) Num.1 Vol.33 |
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| description | The mitochondrial genes coding for 16SrRNA and cytochrome c oxidase subunit I (COI) in four commercially important fish species from the Gulf of California were studied. These fish species were the striped mullet Mugil cephalus and white mullet Mugil curema, and the white snook Centropomus viridis and yellowfin snook Centropomus robalito. Fragments of the 16SrRNA and COI genes were obtained by PCR amplification. Restriction digest of the amplicons for both genes revealed different banding patterns among the four species. The genetic distance based on the 16SrRNA gene sequence was smaller than for COI for both groups of species. Phylogenetic inference for both genes showed monophyly of the four species in two separate groups, one comprising the mullets and the other the snooks. Monophyly of the groups was observed despite the polytomies with the rest of the species included in the bootstrap analysis of maximum parsimony and maximum likelihood analyses.
Se estudiaron los genes mitocondriales codificantes del 16SrRNA y citocromo c oxidasa, subunidad I (COI), de cuatro especies de peces comercialmente importantes del Golfo de California. Los peces incluyen dos lisas y dos robalos: la lisa rayada Mugil cephalus y la lisa blanca Mugil curema; y el robalo plateado Centropomus viridis y el robalo aleta amarilla Centropomus robalito. Los fragmentos de los genes 16SrRNA y COI fueron obtenidos mediante amplificación por PCR. Las digestiones de restricción de los amplicones resultaron en patrones de bandeo diferentes entre las cuatro especies. Las distancias genéticas obtenidas con base en la secuencia del 16SrRNA fue menor que con COI para ambos grupos de especies. La inferencia filogenética para ambos genes muestra monofilia para las cuatro especies en dos diferentes grupos, uno para las lisas y otro para los robalos. La monofilia de estos grupos fue evidente a pesar de las politomías con el resto de las especies incluidas en los análisis de remuestreo para máxima parsimonia y máxima verosimilitud. |
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| institution | Redalyc Ciencias Marinas |
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| publishDate | 2007 |
| publisher | Universidad Autónoma de Baja California |
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Restriction digest of the amplicons for both genes revealed different banding patterns among the four species. The genetic distance based on the 16SrRNA gene sequence was smaller than for COI for both groups of species. Phylogenetic inference for both genes showed monophyly of the four species in two separate groups, one comprising the mullets and the other the snooks. Monophyly of the groups was observed despite the polytomies with the rest of the species included in the bootstrap analysis of maximum parsimony and maximum likelihood analyses. Se estudiaron los genes mitocondriales codificantes del 16SrRNA y citocromo c oxidasa, subunidad I (COI), de cuatro especies de peces comercialmente importantes del Golfo de California. Los peces incluyen dos lisas y dos robalos: la lisa rayada Mugil cephalus y la lisa blanca Mugil curema; y el robalo plateado Centropomus viridis y el robalo aleta amarilla Centropomus robalito. Los fragmentos de los genes 16SrRNA y COI fueron obtenidos mediante amplificación por PCR. Las digestiones de restricción de los amplicones resultaron en patrones de bandeo diferentes entre las cuatro especies. Las distancias genéticas obtenidas con base en la secuencia del 16SrRNA fue menor que con COI para ambos grupos de especies. La inferencia filogenética para ambos genes muestra monofilia para las cuatro especies en dos diferentes grupos, uno para las lisas y otro para los robalos. La monofilia de estos grupos fue evidente a pesar de las politomías con el resto de las especies incluidas en los análisis de remuestreo para máxima parsimonia y máxima verosimilitud. Universidad Autónoma de Baja California, Instituto de Investigaciones Oceanológicas 2007-03-07 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Peer-reviewed research note Nota de investigación arbitrada application/pdf https://cienciasmarinas.com.mx/index.php/cmarinas/article/view/1104 10.7773/cm.v33i1.1104 Ciencias Marinas; Vol. 33 No. 1 (2007); 95-104 Ciencias Marinas; Vol. 33 Núm. 1 (2007); 95-104 2395-9053 0185-3880 eng https://cienciasmarinas.com.mx/index.php/cmarinas/article/view/1104/1890 ['Redalyc'] redalyc_48033109 Diferencias en los genes 16SrRNA y citocromo c oxidasa subunidad I de las lisas Mugil cephalus y Mugil curema y los robalos Centropomus viridis y Centropomus robalito ['Diferencias en los genes 16SrRNA y citocromo c oxidasa subunidad I de las lisas Mugil cephalus y Mugil curema y los robalos Centropomus viridis y Centropomus robalito', 'R Pacheco-Aguilar', 'Ciencias de la Tierra', 'COI', 'peces', '16SrRNA', 'genes mitocondriales', 'patrones de restricción', 'Diferencias en los genes 16SrRNA y citocromo c oxidasa subunidad I de las lisas Mugil cephalus y Mugil curema y los robalos Centropomus viridis y Centropomus robalito R Pacheco-Aguilar AB Peregrino-Uriarte G Yepiz-Plascencia A Varela-Romero Ciencias de la Tierra COI peces 16SrRNA genes mitocondriales patrones de restricción Se estudiaron los genes mitocondriales codificantes del 16SrRNA y citocromo c oxidasa, subunidad I (COI), de cuatroespecies de peces comercialmente importantes del Golfo de California. Los peces incluyen dos lisas y dos robalos: la lisa rayadaMugil cephalus y la lisa blanca Mugil curema; y el robalo plateado Centropomus viridis y el robalo aleta amarilla Centropomusrobalito. Los fragmentos de los genes 16SrRNA y COI fueron obtenidos mediante amplificación por PCR. Las digestiones derestricción de los amplicones resultaron en patrones de bandeo diferentes entre las cuatro especies. Las distancias genéticasobtenidas con base en la secuencia del 16SrRNA fue menor que con COI para ambos grupos de especies. La inferenciafilogenética para ambos genes muestra monofilia para las cuatro especies en dos diferentes grupos, uno para las lisas y otro paralos robalos. 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Los peces incluyen dos lisas y dos robalos: la lisa rayadaMugil cephalus y la lisa blanca Mugil curema; y el robalo plateado Centropomus viridis y el robalo aleta amarilla Centropomusrobalito. Los fragmentos de los genes 16SrRNA y COI fueron obtenidos mediante amplificación por PCR. Las digestiones derestricción de los amplicones resultaron en patrones de bandeo diferentes entre las cuatro especies. Las distancias genéticasobtenidas con base en la secuencia del 16SrRNA fue menor que con COI para ambos grupos de especies. La inferenciafilogenética para ambos genes muestra monofilia para las cuatro especies en dos diferentes grupos, uno para las lisas y otro paralos robalos. La monofilia de estos grupos fue evidente a pesar de las politomías con el resto de las especies incluidas en losanálisis de remuestreo para máxima parsimonia y máxima verosimilitud. 2007 artículo científico 0185-3880 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=48033109 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=480 Ciencias Marinas application/pdf Universidad Autónoma de Baja California Ciencias Marinas (México) Num.1 Vol.33'] |
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