Validación y adaptación de la técnica de microsatélites para el análisis genético de Vochysia guatemalensis Donn. Sm.
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Redalyc
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| Main Author: | |
|---|---|
| Format: | Artículo científico |
| Language: | es |
| Published: |
Recursos Genéticos Forestales
2007
|
| Subjects: | |
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| _version_ | 1876460892355297280 |
|---|---|
| author | Gabriel Aguilar |
| author_facet | Gabriel Aguilar |
| contents | Validación y adaptación de la técnica de microsatélites para el análisis genético de Vochysia guatemalensis Donn. Sm. Gabriel Aguilar Fabiana Rojas Olman Murillo Emanuel Araya Oscar Rocha Biología SSR PCR Costa Rica microsatélites Vochysia guatemalensis Con los avances hacia la reforestación clonal del sector forestal en Costa Rica y en muchos otros países, surgen nuevas necesidades. Es imprescindible poder verificar la pureza de las colecciones clonales; revisar el nivel de parentesco y el grado de variabilidad en la población de mejoramiento, entre otras aplicaciones. El uso de marcadores genéticos, como los microsatélites (SSR), constituyen una nueva e invaluable herramienta para precisamente poder garantizar y respaldar los programas de mejoramiento y conservación genética forestal. En este trabajo se presenta la adecuación y validación del uso de varios microsatélites en Vochysia guatemalensis, que habían sido previamente desarrollados para Vochysia ferruginea. El método de extracción de ADN utilizado basado en CTAB permitió su obtención en alta calidad, determinada por medio de un gel de agarosa al 1%. La evaluación inicial de la amplificación basada en el protocolo reportado para Vochysia ferruginea, no mostró los resultados esperados, por lo que fue necesario optimizar un nuevo protocolo para Vochysia guatemalensis. La validación de la técnica de microsatélites para la identificación clonal permitió descartar uno de los cinco imprimadores evaluados (A1-26). El tamaño de los alelos encontrados difiere con los reportados para V. ferruginea. El valor promedio del tamaño de los alelos en pb más cercano a lo reportado para V. ferruginea, se obtuvo con el imprimador A1-35. Los cuatro loci estudiados presentan alto grado de polimorfismo (4, 4, 3 y 2 alelos respectivamente), lo cual los hace marcadores apropiados para el aseguramiento de la identidad genética de las colecciones clonales de esta especie. 2007 artículo científico 1405-7247 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=49790101 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=497 Foresta Veracruzana application/pdf Recursos Genéticos Forestales Foresta Veracruzana (México) Num.1 Vol.9 |
| format | Artículo científico |
| id | redalyc_49790101 |
| institution | Redalyc |
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| publishDate | 2007 |
| publisher | Recursos Genéticos Forestales |
| spellingShingle | Validación y adaptación de la técnica de microsatélites para el análisis genético de Vochysia guatemalensis Donn. Sm. Gabriel Aguilar Biología SSR PCR Costa Rica microsatélites Vochysia guatemalensis Validación y adaptación de la técnica de microsatélites para el análisis genético de Vochysia guatemalensis Donn. Sm. Gabriel Aguilar Fabiana Rojas Olman Murillo Emanuel Araya Oscar Rocha Biología SSR PCR Costa Rica microsatélites Vochysia guatemalensis Con los avances hacia la reforestación clonal del sector forestal en Costa Rica y en muchos otros países, surgen nuevas necesidades. Es imprescindible poder verificar la pureza de las colecciones clonales; revisar el nivel de parentesco y el grado de variabilidad en la población de mejoramiento, entre otras aplicaciones. El uso de marcadores genéticos, como los microsatélites (SSR), constituyen una nueva e invaluable herramienta para precisamente poder garantizar y respaldar los programas de mejoramiento y conservación genética forestal. En este trabajo se presenta la adecuación y validación del uso de varios microsatélites en Vochysia guatemalensis, que habían sido previamente desarrollados para Vochysia ferruginea. El método de extracción de ADN utilizado basado en CTAB permitió su obtención en alta calidad, determinada por medio de un gel de agarosa al 1%. La evaluación inicial de la amplificación basada en el protocolo reportado para Vochysia ferruginea, no mostró los resultados esperados, por lo que fue necesario optimizar un nuevo protocolo para Vochysia guatemalensis. La validación de la técnica de microsatélites para la identificación clonal permitió descartar uno de los cinco imprimadores evaluados (A1-26). El tamaño de los alelos encontrados difiere con los reportados para V. ferruginea. El valor promedio del tamaño de los alelos en pb más cercano a lo reportado para V. ferruginea, se obtuvo con el imprimador A1-35. Los cuatro loci estudiados presentan alto grado de polimorfismo (4, 4, 3 y 2 alelos respectivamente), lo cual los hace marcadores apropiados para el aseguramiento de la identidad genética de las colecciones clonales de esta especie. 2007 artículo científico 1405-7247 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=49790101 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=497 Foresta Veracruzana application/pdf Recursos Genéticos Forestales Foresta Veracruzana (México) Num.1 Vol.9 |
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| topic | Biología SSR PCR Costa Rica microsatélites Vochysia guatemalensis |
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