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| Autore principale: | |
|---|---|
| Natura: | Artículo científico |
| Lingua: | es |
| Pubblicazione: |
Asociación Bioquímica Argentina
2021
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| Soggetti: | |
| Accesso online: | https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=65183032004 |
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Sommario:
- Diagnóstico molecular en biopsias de sarcoma de Ewing y rabdomiosarcomas pediátricos: experiencia en el Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez Carla Antonella Massone Sandra Colli Mercedes García Lombardi Elena De Matteo María Victoria Preciado Medicina RT PCR FISH sarcoma de Ewing transcriptos de fusión Introducción: los tumores de partes blandas representan el 6% de los cánceres pediátricos anuales, según el Registro Oncopediátrico Hospitalario Argentino. Para sarcoma de Ewing (SE) y rabdomiosarcoma (RMS) se describieron translocaciones cromosómicas específicas, aplicadas a la clasificación molecular, diagnóstico diferencial y/o pronóstico. Objetivos: realizar la clasificación molecular de casos con sospecha diagnóstica de SE y RMS y evaluar el impacto de conservación de biopsias sobre la integridad de ácidos nucleicos. Materiales y métodos: se enrolaron niños menores de 18 años con sospecha de SE y RMS. Se estudiaron biopsias de tumor primario, algunas conservadas a -70ºC y otras embebidas en parafina (FFEP) y, además, aspirados de médula ósea. Se extrajo el ARN con 1) Trizol y 2) Recover All Total Nucleic Acid Isolation. Se realizaron las técnicas de FISH (fluorescence in situ hybridization), RTPCR-secuenciación para EWS-FLI1[t(11;22)(q24;q12)]/EWS-ERG[t(21;22)(q22;q12)] en SE y PAX3-FOXO1[t(2;13) (q35;q14)]/PAX7-FOXO1[t(1;13)(p36;q14)] en RMS. Resultados: Se incluyeron pacientes con SE (n = 13) y RMS (n = 4). Se estudiaron 17 biopsias de tumor primario: 7 conservadas a -70ºC y 12 FFEP y 2 aspirados de médula ósea. Se detectó por FISH el rearreglo de EWRS1: 9/13 SE y FOXO1: 3/4 RMS. Se amplificó el gen PGK por RT-PCR y se obtuvo positivo en 8/12 biopsias FFEP y 7/7 muestras congeladas (5 biopsias y 2 aspirados medulares); se detectó RT-PCR en SE EWS-FLI1 en 7/8 muestras (2 tipo 1; 3 tipo 2; 1 tipo 4 y 1 translocación EWSexón7/FLI1exón4). En RMS se detectó FOXO1-PAX3 en 1/3 y FOXO1-PAX7, en 0/3. En RMS 1/3 se confirmó subtipo embrionario por RT-PCR, en discordancia con FISH. En SE 2/2 se confirmó ausencia de infiltración en médula ósea (MO). Conclusiones: la biopsia en fresco a -80°C demostró mejor preservación de ARN que la FFEP. La secuenciación permitió identificar los puntos de ruptura y en SE., detectar un rearreglo infrecuente. En RMS la discordancia plantea considerar valores de corte en FISH. 2021 artículo científico 1515-6761 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=65183032004 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=651 Bioquímica y Patología Clínica application/pdf Asociación Bioquímica Argentina Bioquímica y Patología Clínica (Argentina) Num.2 Vol.85