Predicción a escala genómica de componentes de Saccharomyces cerevisiae mediante análisis de balance de flujos
Fuente:
Redalyc
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| Autore principale: | |
|---|---|
| Natura: | Artículo científico |
| Lingua: | es |
| Pubblicazione: |
Universidad Nacional de Colombia
2012
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| Soggetti: | |
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| _version_ | 1876458568890187776 |
|---|---|
| author | César Augusto Vargas García |
| author_facet | César Augusto Vargas García |
| contents | Predicción a escala genómica de componentes de Saccharomyces cerevisiae mediante análisis de balance de flujos César Augusto Vargas García Henry Arguello Fuentes Rodrigo Gonzalo Torres Sáez Biología iMM904 cerevisiae Analisis de balance de flujos reconstrucción a escala genómica El microorganismo Saccharomyces cerevisiae cuenta con gran número de modelos biológicos conocidos como reconstrucciones, las cuales pueden ser a escala genómica. De estas reconstrucciones a escala genómica provienen los modelos matemáticos, también llamados modelos estequiométricos. Una de las técnicas más usadas para estudiar estos modelos es el Análisis de Balance de Flujos (FBA). El proposito del FBA es predecir el crecimiento del microorganismo bajo estudio, y la producción y consumo de componentes como el etanol, CO2, glicerol, sucinato, acetato y piruvato. Para determinar si las predicciones obtenidas mediante FBA son únicas se utiliza la técnica de Análisis de Variabilidad Flujos (FVA). El presente trabajo muestra los resultados de aplicar el FBA a la reconstrucción reciente del microorganismo S. cerevisiae, la denominada iMM904 y los compara con un conjunto de datos experimentales presente en la literatura. Este trabajo también estudia la existencia de múltiples predicciones FBA utilizando la técnica FVA. Los resultados ilustran que es posible predecir el crecimiento del microorganimo S. cerevisiae, con errores entre el 11% y 28%; la producción de CO2, con errores entre el 0.3% y 4.5% y la producción de etanol, con errores entre el 11% y 13%. 2012 artículo científico 0123-3475 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=77624081009 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=776 Revista Colombiana de Biotecnología application/pdf Universidad Nacional de Colombia Revista Colombiana de Biotecnología (Colombia) Num.1 Vol.XIV |
| format | Artículo científico |
| id | redalyc_77624081009 |
| institution | Redalyc |
| language | es |
| publishDate | 2012 |
| publisher | Universidad Nacional de Colombia |
| spellingShingle | Predicción a escala genómica de componentes de Saccharomyces cerevisiae mediante análisis de balance de flujos César Augusto Vargas García Biología iMM904 cerevisiae Analisis de balance de flujos reconstrucción a escala genómica Predicción a escala genómica de componentes de Saccharomyces cerevisiae mediante análisis de balance de flujos César Augusto Vargas García Henry Arguello Fuentes Rodrigo Gonzalo Torres Sáez Biología iMM904 cerevisiae Analisis de balance de flujos reconstrucción a escala genómica El microorganismo Saccharomyces cerevisiae cuenta con gran número de modelos biológicos conocidos como reconstrucciones, las cuales pueden ser a escala genómica. De estas reconstrucciones a escala genómica provienen los modelos matemáticos, también llamados modelos estequiométricos. Una de las técnicas más usadas para estudiar estos modelos es el Análisis de Balance de Flujos (FBA). El proposito del FBA es predecir el crecimiento del microorganismo bajo estudio, y la producción y consumo de componentes como el etanol, CO2, glicerol, sucinato, acetato y piruvato. Para determinar si las predicciones obtenidas mediante FBA son únicas se utiliza la técnica de Análisis de Variabilidad Flujos (FVA). El presente trabajo muestra los resultados de aplicar el FBA a la reconstrucción reciente del microorganismo S. cerevisiae, la denominada iMM904 y los compara con un conjunto de datos experimentales presente en la literatura. Este trabajo también estudia la existencia de múltiples predicciones FBA utilizando la técnica FVA. Los resultados ilustran que es posible predecir el crecimiento del microorganimo S. cerevisiae, con errores entre el 11% y 28%; la producción de CO2, con errores entre el 0.3% y 4.5% y la producción de etanol, con errores entre el 11% y 13%. 2012 artículo científico 0123-3475 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=77624081009 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=776 Revista Colombiana de Biotecnología application/pdf Universidad Nacional de Colombia Revista Colombiana de Biotecnología (Colombia) Num.1 Vol.XIV |
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| topic | Biología iMM904 cerevisiae Analisis de balance de flujos reconstrucción a escala genómica |
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