Análisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de Clostridium sp. IBUN22A
Fuente:
Redalyc
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| Autor principal: | |
|---|---|
| Formato: | Artículo científico |
| Lenguaje: | es |
| Publicado: |
Universidad Nacional de Colombia
2006
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| Materias: | |
| Acceso en línea: | |
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| _version_ | 1876445085434904576 |
|---|---|
| author | José David Montoya Solano |
| author_facet | José David Montoya Solano |
| contents | Análisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de Clostridium sp. IBUN22A José David Montoya Solano Zulma Rocío Suárez Moreno Fabio Ancízar Aristizábal Gutiérrez Dolly Montoya Castaño Biología Clostridium propanodiol librería genómica glicerol deshidratasa análisis de secuencias Este trabajo tuvo como propósito identificar secuencias de genes en clones obtenidos en una librería genómica de lacepa colombiana de Clostridium sp. IBUN 22A. Los insertos de nueve clones con tamaños superiores a 500 pb fueronsecuenciados y analizados por medio de búsquedas de los insertos completos o de sus marcos abiertos de lectura(ORFs) traducidos en GenBank 141.0 y Uniprot 6.6 con BLAST 2.2.8. Se identificaron seis genes con alta similaridad agenes de metabolismo básico (housekeeping) en diferentes especies de Clostridium. En el clon pBsIBUN22A-1 se localizóuna secuencia de 851 pb con una identidad del 99.74% respecto al gen codificante de la enzima glicerol deshidratasa(DhaB1) de Clostridium butyricum (AY968605) involucrada en la producción de 1,3 Propanodiol (1,3-PD). La identificación de genes presentes en la cepa nativa Clostridium IBUN 22A abre la puerta a la investigación básica y a la ingenieríametabólica para hacer más rentable el proceso de producción de 1,3-PD junto al conocimiento de los genes presentesen la cepa nativa. 2006 artículo científico 0123-3475 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=77680106 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=776 Revista Colombiana de Biotecnología application/pdf Universidad Nacional de Colombia Revista Colombiana de Biotecnología (Colombia) Num.1 Vol.VIII |
| format | Artículo científico |
| id | redalyc_77680106 |
| institution | Redalyc |
| language | es |
| publishDate | 2006 |
| publisher | Universidad Nacional de Colombia |
| spellingShingle | Análisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de Clostridium sp. IBUN22A José David Montoya Solano Biología Clostridium propanodiol librería genómica glicerol deshidratasa análisis de secuencias Análisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de Clostridium sp. IBUN22A José David Montoya Solano Zulma Rocío Suárez Moreno Fabio Ancízar Aristizábal Gutiérrez Dolly Montoya Castaño Biología Clostridium propanodiol librería genómica glicerol deshidratasa análisis de secuencias Este trabajo tuvo como propósito identificar secuencias de genes en clones obtenidos en una librería genómica de lacepa colombiana de Clostridium sp. IBUN 22A. Los insertos de nueve clones con tamaños superiores a 500 pb fueronsecuenciados y analizados por medio de búsquedas de los insertos completos o de sus marcos abiertos de lectura(ORFs) traducidos en GenBank 141.0 y Uniprot 6.6 con BLAST 2.2.8. Se identificaron seis genes con alta similaridad agenes de metabolismo básico (housekeeping) en diferentes especies de Clostridium. En el clon pBsIBUN22A-1 se localizóuna secuencia de 851 pb con una identidad del 99.74% respecto al gen codificante de la enzima glicerol deshidratasa(DhaB1) de Clostridium butyricum (AY968605) involucrada en la producción de 1,3 Propanodiol (1,3-PD). La identificación de genes presentes en la cepa nativa Clostridium IBUN 22A abre la puerta a la investigación básica y a la ingenieríametabólica para hacer más rentable el proceso de producción de 1,3-PD junto al conocimiento de los genes presentesen la cepa nativa. 2006 artículo científico 0123-3475 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=77680106 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=776 Revista Colombiana de Biotecnología application/pdf Universidad Nacional de Colombia Revista Colombiana de Biotecnología (Colombia) Num.1 Vol.VIII |
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| topic | Biología Clostridium propanodiol librería genómica glicerol deshidratasa análisis de secuencias |
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