ENKI-DB: sistema de información taxonómica y molecular de especies propias de la biodiversidad colombiana

Fuente: Redalyc
Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Andrés M. Pinzón
Format: Artículo científico
Language:es
Published: Universidad Nacional de Colombia 2006
Subjects:
Online Access:
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
_version_ 1876449967470542848
author Andrés M. Pinzón
author_facet Andrés M. Pinzón
contents ENKI-DB: sistema de información taxonómica y molecular de especies propias de la biodiversidad colombiana Andrés M. Pinzón María Teresa Reguero Emiliano Barreto Biología ENKI molecular taxonomía bioinformática biodiversidad colombiana ENKI-DB, es un sistema de información taxonómica y molecular de especies propias de la biodiversidad colombiana,accesible vía Internet. Mediante ENKI-DB se tiene acceso inmediato a toda la información taxonómica y molecularpresente en las bases de datos SPICA®, SIB, EMBL y UNIPROT para especies propias de la biodiversidad colombianaexclusivamente. Hasta la fecha el sistema ha logrado enlazar 10 808 registros de especies propias de la biodiversidadcolombiana (presentes en las bases de datos SIB y SPICA®), para las que han encontrado 1 976 751 registros moleculares,96 337 provenientes de las bases de datos de información proteica (UniprotKb, Uniref y Uniparc) y 1 880 414 de labase de datos EMBL de DNA. Aunque esta información se encuentra presente también, de manera independiente, encada una de estas bases de datos, a través de ENKI- DB los datos son accesibles desde una sola interfase y de maneraintegrada y depurada. El sistema permite además realizar alineamientos locales utilizando la implementación delalgoritmo BLAST del NCBI.ENKI- DB ha sido desarrollado en su totalidad en PHP y PERL, haciendo uso de las librerías Bio-PHP, Bio-PERL yutilizando la base de datos MySQL como repositorio central de información. ENKI-DB es accesible vía Internet, demanera completamente gratuita y pública en la siguiente dirección: http://bioinf.ibun.unal.edu.co/enkidb/Contacto: cenbio_nal@unal.edu.co 2006 artículo científico 0123-3475 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=77680107 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=776 Revista Colombiana de Biotecnología application/pdf Universidad Nacional de Colombia Revista Colombiana de Biotecnología (Colombia) Num.1 Vol.VIII
format Artículo científico
id redalyc_77680107
institution Redalyc
language es
publishDate 2006
publisher Universidad Nacional de Colombia
spellingShingle ENKI-DB: sistema de información taxonómica y molecular de especies propias de la biodiversidad colombiana
Andrés M. Pinzón
Biología
ENKI
molecular
taxonomía
bioinformática
biodiversidad colombiana
ENKI-DB: sistema de información taxonómica y molecular de especies propias de la biodiversidad colombiana Andrés M. Pinzón María Teresa Reguero Emiliano Barreto Biología ENKI molecular taxonomía bioinformática biodiversidad colombiana ENKI-DB, es un sistema de información taxonómica y molecular de especies propias de la biodiversidad colombiana,accesible vía Internet. Mediante ENKI-DB se tiene acceso inmediato a toda la información taxonómica y molecularpresente en las bases de datos SPICA®, SIB, EMBL y UNIPROT para especies propias de la biodiversidad colombianaexclusivamente. Hasta la fecha el sistema ha logrado enlazar 10 808 registros de especies propias de la biodiversidadcolombiana (presentes en las bases de datos SIB y SPICA®), para las que han encontrado 1 976 751 registros moleculares,96 337 provenientes de las bases de datos de información proteica (UniprotKb, Uniref y Uniparc) y 1 880 414 de labase de datos EMBL de DNA. Aunque esta información se encuentra presente también, de manera independiente, encada una de estas bases de datos, a través de ENKI- DB los datos son accesibles desde una sola interfase y de maneraintegrada y depurada. El sistema permite además realizar alineamientos locales utilizando la implementación delalgoritmo BLAST del NCBI.ENKI- DB ha sido desarrollado en su totalidad en PHP y PERL, haciendo uso de las librerías Bio-PHP, Bio-PERL yutilizando la base de datos MySQL como repositorio central de información. ENKI-DB es accesible vía Internet, demanera completamente gratuita y pública en la siguiente dirección: http://bioinf.ibun.unal.edu.co/enkidb/Contacto: cenbio_nal@unal.edu.co 2006 artículo científico 0123-3475 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=77680107 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=776 Revista Colombiana de Biotecnología application/pdf Universidad Nacional de Colombia Revista Colombiana de Biotecnología (Colombia) Num.1 Vol.VIII
title ENKI-DB: sistema de información taxonómica y molecular de especies propias de la biodiversidad colombiana
topic Biología
ENKI
molecular
taxonomía
bioinformática
biodiversidad colombiana
url https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=77680107