Análisis de expresión génica durante la respuesta de defensa de la yuca a la bacteriosis vascular (Añublo Bacteriano)

Fuente: Redalyc
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Main Author: Mauricio Soto-Suárez
Format: Artículo científico
Language:es
Published: Universidad Nacional de Colombia 2006
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author Mauricio Soto-Suárez
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contents Análisis de expresión génica durante la respuesta de defensa de la yuca a la bacteriosis vascular (Añublo Bacteriano) Mauricio Soto-Suárez Gloria Mosquera Valérie Verdier Joe Tohme Silvia Restrepo Biología yuca microarreglos añublo bacteriano librerías sustractivas identificación de genes La bacteriosis vascular de la yuca es una destructiva enfermedad en Sur América y África, causada por la bacteriaXanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Produce pérdidas entre el 12% y 100% de los cultivos. Algunos estudios sehan realizado a nivel bioquímico y citoquímico para conocer las respuestas de defensa de la yuca a Xam; sin embargo,las bases moleculares de los mecanismos de defensa no han sido aún caracterizadas. Con el propósito de identificargenes diferencialmente expresados durante la respuesta de la planta al patógeno, se ha construido una libreríasustractiva, usando el método de Sustracción Diferencial en Cadena (DSC), con 1536 clones de dos variedades resistentes(MBRA 685 y SG 107-35). De esta librería fueron seleccionados al azar 110 clones para ser secuenciados yrealizar búsquedas de similitud en bases de datos públicas. El análisis de secuencia mostró 14 clones con similitud agenes previamente reportados como involucrados en procesos de defensa en plantas, 70 clones con similitud a genesde plantas sin función conocida o que no presentaron similitud, representando nuevos genes potencialmenteinvolucrados en las respuestas de defensa de la yuca. Finalmente fueron construidos microarreglos de ADNc, usandolos clones seleccionados de las librerías sustractivas para confirmar su expresión diferencial durante el desarrollo dela infección. 2006 artículo científico 0123-3475 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=77680203 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=776 Revista Colombiana de Biotecnología application/pdf Universidad Nacional de Colombia Revista Colombiana de Biotecnología (Colombia) Num.2 Vol.VIII
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publisher Universidad Nacional de Colombia
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Mauricio Soto-Suárez
Biología
yuca
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librerías sustractivas
identificación de genes
Análisis de expresión génica durante la respuesta de defensa de la yuca a la bacteriosis vascular (Añublo Bacteriano) Mauricio Soto-Suárez Gloria Mosquera Valérie Verdier Joe Tohme Silvia Restrepo Biología yuca microarreglos añublo bacteriano librerías sustractivas identificación de genes La bacteriosis vascular de la yuca es una destructiva enfermedad en Sur América y África, causada por la bacteriaXanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Produce pérdidas entre el 12% y 100% de los cultivos. Algunos estudios sehan realizado a nivel bioquímico y citoquímico para conocer las respuestas de defensa de la yuca a Xam; sin embargo,las bases moleculares de los mecanismos de defensa no han sido aún caracterizadas. Con el propósito de identificargenes diferencialmente expresados durante la respuesta de la planta al patógeno, se ha construido una libreríasustractiva, usando el método de Sustracción Diferencial en Cadena (DSC), con 1536 clones de dos variedades resistentes(MBRA 685 y SG 107-35). De esta librería fueron seleccionados al azar 110 clones para ser secuenciados yrealizar búsquedas de similitud en bases de datos públicas. El análisis de secuencia mostró 14 clones con similitud agenes previamente reportados como involucrados en procesos de defensa en plantas, 70 clones con similitud a genesde plantas sin función conocida o que no presentaron similitud, representando nuevos genes potencialmenteinvolucrados en las respuestas de defensa de la yuca. Finalmente fueron construidos microarreglos de ADNc, usandolos clones seleccionados de las librerías sustractivas para confirmar su expresión diferencial durante el desarrollo dela infección. 2006 artículo científico 0123-3475 https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=77680203 es http://www.redalyc.org/revista.oa?id=776 Revista Colombiana de Biotecnología application/pdf Universidad Nacional de Colombia Revista Colombiana de Biotecnología (Colombia) Num.2 Vol.VIII
title Análisis de expresión génica durante la respuesta de defensa de la yuca a la bacteriosis vascular (Añublo Bacteriano)
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