Enriching barcoding markers in environmental samples utilizing a phylogenetic probe design: Insights from mock communities
Fuente:
Wiley Open Access
Salvato in:
| Autori principali: | Kevin Nota, Ludovic Orlando, Alexis Marchesini, Matteo Girardi, Stefan Bertilsson, Cristiano Vernesi, Laura Parducci |
|---|---|
| Natura: | Artículo Open Access |
| Pubblicazione: |
Wiley
2024
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Community structure and functional diversity of aquatic fungi are correlated with water quality: Insights from multi‐marker analysis of environmental DNA in a coastal watershed
di: Lauren Cortez French, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lauren Cortez French, et al.
Pubblicazione: (2024)
Molecular evidence for phylogenetic affinities of (Thelazioidea: Rhabdochonidae) with other spiruromorph nematodes.
di: Vainutis, K S, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Vainutis, K S, et al.
Pubblicazione: (2025)
Characterization of Allobodo yubaba sp. nov. and Novijibodo darinka gen. et sp. nov., cultivable free-living species of the phylogenetically enigmatic kinetoplastid taxon Allobodonidae.
di: Packer, Julia A, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Packer, Julia A, et al.
Pubblicazione: (2025)
Validation of an eDNA‐based workflow for monitoring inter‐ and intra‐specific CytB haplotype diversity of alpine amphibians
di: Lucia Zanovello, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lucia Zanovello, et al.
Pubblicazione: (2024)
DNA barcoding for elasmobranch diversity assessment in Thailand: Its advantages and limitations.
di: Khudamrongsawat, Jenjit, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Khudamrongsawat, Jenjit, et al.
Pubblicazione: (2025)
Exploring the potential of the COI gene marker for DNA barcoding of planktonic foraminifera.
di: Gusmao, Ana Carolina Bercini, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Gusmao, Ana Carolina Bercini, et al.
Pubblicazione: (2025)
Figure 2c from: Na S-M, Shin N-R, Bae Y-S (2026) Two species of Atteva Walker, 1854 (Lepidoptera, Attevidae) new to Laos, with DNA barcodes. Biodiversity Data Journal 14: e189183. https://doi.org/10.3897/BDJ.14.e189183
di: Na, Sol-Moon, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Na, Sol-Moon, et al.
Pubblicazione: (2026)
Figure 1c from: Na S-M, Shin N-R, Bae Y-S (2026) Two species of Atteva Walker, 1854 (Lepidoptera, Attevidae) new to Laos, with DNA barcodes. Biodiversity Data Journal 14: e189183. https://doi.org/10.3897/BDJ.14.e189183
di: Na, Sol-Moon, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Na, Sol-Moon, et al.
Pubblicazione: (2026)
Morphological characterization and genetic barcoding of kuttiatoor mango accessions
di: M.R. Dinesh
Pubblicazione: (2018)
di: M.R. Dinesh
Pubblicazione: (2018)
Investigating pelagic biodiversity and gelatinous zooplankton communities in the rapidly changing European Arctic: An eDNA metabarcoding survey
di: Ayla Murray, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Ayla Murray, et al.
Pubblicazione: (2024)
Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colom
di: Laura C. Mazo
Pubblicazione: (2012)
di: Laura C. Mazo
Pubblicazione: (2012)
Differential decay of multiple environmental nucleic acid components.
di: Brandão-Dias, Pedro Fp, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Brandão-Dias, Pedro Fp, et al.
Pubblicazione: (2025)
When DNA Repair Backfires - Trabectedin Induces DNA Breaks in Active Genes.
di: Takhaveev, Vakil, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Takhaveev, Vakil, et al.
Pubblicazione: (2025)
Generic qPCR assays for quality control in environmental DNA research
di: Xiaocheng Zhu, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Xiaocheng Zhu, et al.
Pubblicazione: (2024)
When cryptogenic species are also cryptic: reframing biogeographic uncertainty in the environmental DNA era.
di: Nichols, Patrick K, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Nichols, Patrick K, et al.
Pubblicazione: (2026)
Optimization and application of bacterial environmental DNA and RNA isolation for qualitative and quantitative studies
di: Daniel J. Browne, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Daniel J. Browne, et al.
Pubblicazione: (2024)
Integrating eDNA and Visual Surveys With Ocean Drift Models to Monitor Marine Mammals in Tropical Waters
di: Natacha Nikolic, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Natacha Nikolic, et al.
Pubblicazione: (2025)
Caracterización molecular de rayas simpátricas de los géneros Dipturus y Zearaja en el Mar Argentino por DNA barcode.
di: Izzo, S.A., et al.
Pubblicazione: (2017)
di: Izzo, S.A., et al.
Pubblicazione: (2017)
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis.
di: Zhang, Chengjie, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Zhang, Chengjie, et al.
Pubblicazione: (2026)
Single metabarcoding multiplex captures community‐level freshwater biodiversity and beyond
di: Niamh Eastwood, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Niamh Eastwood, et al.
Pubblicazione: (2024)
Morphology and molecular basis of cell-cell recognition in sp. nov., a phylogenetically early-emerging new species of (Ciliophora, Spirotrichea).
di: Alimenti, Claudio, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Alimenti, Claudio, et al.
Pubblicazione: (2025)
Comparing cost, effort, and performance of environmental DNA sampling and trapping for detecting an elusive freshwater turtle
di: Elizabeth C. Sternhagen, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Elizabeth C. Sternhagen, et al.
Pubblicazione: (2024)
Environmental DNA metabarcoding on aquatic insects: Comparing the primer sets of MtInsects‐16S based on the mtDNA 16S and general marker based on the mtDNA COI region
di: Masaki Takenaka, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Masaki Takenaka, et al.
Pubblicazione: (2024)
Relative gene expression analysis of catalase in environmental RNA from Japanese medaka exposed to toxic chemicals
di: Kyoshiro Hiki, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Kyoshiro Hiki, et al.
Pubblicazione: (2024)
Correction to “Single metabarcoding multiplex captures community‐level freshwater biodiversity and beyond”
Pubblicazione: (2024)
Pubblicazione: (2024)
Molecular and phylogenetic investigation of Chiromantes boulengeri (Decapoda, Brachyura, Sesarmidae) species from Arvand River
di: Nozarpour, N., et al.
Pubblicazione: (2018)
di: Nozarpour, N., et al.
Pubblicazione: (2018)
Testing multiple environmental DNA substrates for detection of the cryptic and Critically Endangered burrowing freshwater crayfish Engaewa pseudoreducta
di: Kathryn L. Dawkins, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Kathryn L. Dawkins, et al.
Pubblicazione: (2024)
Monitoring and predicting the presence and abundance of juvenile Atlantic salmon in tributaries according to habitat characteristics using environmental DNA
di: Chloé Suzanne Berger, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Chloé Suzanne Berger, et al.
Pubblicazione: (2024)
Environmental DNA for monitoring the impact of offshore wind farms on fish and invertebrate community structures
di: Isolde Cornelis, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Isolde Cornelis, et al.
Pubblicazione: (2024)
Systematic evaluation of the influence of Taq enzyme choice and amplification conditions on targeted environmental DNA assay performance and detection in field samples
di: Neha Acharya‐Patel, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Neha Acharya‐Patel, et al.
Pubblicazione: (2024)
Correction to “ eDNA metabarcoding reveals riverine fish community structure and climate associations in northeastern Canada”
Pubblicazione: (2024)
Pubblicazione: (2024)
Development and optimization of a novel environmental DNA‐based method for moor frog (Rana arvalis) monitoring and comparison with a commercial detection kit
di: Suvi Olli, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Suvi Olli, et al.
Pubblicazione: (2024)
Field collections and environmental DNA surveys reveal topographic complexity of coral reefs as a predictor of cryptobenthic biodiversity across small spatial scales
di: O. B. Brodnicke, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: O. B. Brodnicke, et al.
Pubblicazione: (2024)
Developing an eDNA approach for wetland biomonitoring: Insights on technical and conventional approaches
di: Starsha Bird, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Starsha Bird, et al.
Pubblicazione: (2024)
The Seasonal Rhythms of Coastal eDNA : Insights Into Biodiversity and Regional Detection Patterns
di: Melissa K. Morrison, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Melissa K. Morrison, et al.
Pubblicazione: (2026)
Molecular phylogenetic relationships among four species of the mangrove tree genus Bruguiera (Rhisophoraceae), as revealed by chromosome and RAPD markers
di: Sahoo, Pragnya; Jena, Satyanarayan; Mohanty, Suprava & Bandhu Das, Anath
Pubblicazione: (2007)
di: Sahoo, Pragnya; Jena, Satyanarayan; Mohanty, Suprava & Bandhu Das, Anath
Pubblicazione: (2007)
Investigation of genetic population of Neogobius gorlap in southern Caspian Sea using microsatellite markers
di: Pourgholam, H., et al.
Pubblicazione: (2010)
di: Pourgholam, H., et al.
Pubblicazione: (2010)
Enhancing environmental DNA metabarcoding from marine ecosystems: Impact of filter type, storage method, and storage time on the assessment of fish alpha and beta diversity
di: Manuela R. Bizzozzero, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Manuela R. Bizzozzero, et al.
Pubblicazione: (2024)
DNA Retention in Sea Lamprey Digestive Tracts: Insights From Controlled Feeding Experiments
di: Conor O'Kane, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Conor O'Kane, et al.
Pubblicazione: (2026)
A comparison of eDNA sampling methods in an estuarine environment on presence of longfin smelt (Spirinchus thaleichthys) and fish community composition
di: Lizabeth Bowen, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Lizabeth Bowen, et al.
Pubblicazione: (2024)
Documenti analoghi
-
Community structure and functional diversity of aquatic fungi are correlated with water quality: Insights from multi‐marker analysis of environmental DNA in a coastal watershed
di: Lauren Cortez French, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Molecular evidence for phylogenetic affinities of (Thelazioidea: Rhabdochonidae) with other spiruromorph nematodes.
di: Vainutis, K S, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Characterization of Allobodo yubaba sp. nov. and Novijibodo darinka gen. et sp. nov., cultivable free-living species of the phylogenetically enigmatic kinetoplastid taxon Allobodonidae.
di: Packer, Julia A, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Validation of an eDNA‐based workflow for monitoring inter‐ and intra‐specific CytB haplotype diversity of alpine amphibians
di: Lucia Zanovello, et al.
Pubblicazione: (2024) -
DNA barcoding for elasmobranch diversity assessment in Thailand: Its advantages and limitations.
di: Khudamrongsawat, Jenjit, et al.
Pubblicazione: (2025)