Accurate Biomolecular Structure Prediction in CASP16 With Optimized Inputs to State‐Of‐The‐Art Predictors
Fuente:
Wiley Open Access
Gespeichert in:
| Hauptverfasser: | Wenkai Wang, Yuxian Luo, Zhenling Peng, Jianyi Yang |
|---|---|
| Format: | Artículo Open Access |
| Veröffentlicht: |
Wiley
2025
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Ähnliche Einträge
Predicting the Oligomeric State of Proteins Using Multiple Templates Detected by Complementary Alignment Methods
von: Yuxian Luo, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Yuxian Luo, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Cover Image, Volume 93, Issue 12
von: Yuxian Luo, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Yuxian Luo, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Assessment of Nucleic Acid Structure Prediction in CASP16
von: Rachael C. Kretsch, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Rachael C. Kretsch, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Cryo‐ EM Analysis in CASP16
von: Thomas Mulvaney, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Thomas Mulvaney, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Protein Target Highlights in CASP16 : Insights From the Structure Providers
von: Leila T. Alexander, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Leila T. Alexander, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Blind Prediction of Complex Water and Ion Ensembles Around RNA in CASP16
von: Rachael C. Kretsch, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Rachael C. Kretsch, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Enhancing RNA 3D Structure Prediction in CASP16 : Integrating Physics‐Based Modeling With Machine Learning for Improved Predictions
von: Sicheng Zhang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Sicheng Zhang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Protein‐Ligand Structure and Affinity Prediction in CASP16 Using a Geometric Deep Learning Ensemble and Flow Matching
von: Alex Morehead, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Alex Morehead, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Ligand Binding Prediction on Pharmaceutical and Nucleic Acid Targets by the CoDock Group in CASP16
von: Ren Kong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Ren Kong, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Improving AlphaFold2 ‐ and AlphaFold3 ‐Based Protein Complex Structure Prediction With MULTICOM4 in CASP16
von: Jian Liu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Jian Liu, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Updates to the CASP Infrastructure in 2024
von: Andriy Kryshtafovych, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Andriy Kryshtafovych, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Modeling Protein–Protein and Protein–Ligand Interactions by the ClusPro Team in CASP16
von: Ryota Ashizawa, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Ryota Ashizawa, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Progress and Bottlenecks for Deep Learning in Computational Structure Biology: CASP Round XVI
von: Andriy Kryshtafovych, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Andriy Kryshtafovych, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Graph_RG: Dominating CASP16 's Small Molecule Affinity Prediction Subcategory—A Pose‐Free Framework for Billion‐Scale Virtual Screening
von: Haiping Zhang
Veröffentlicht: (2025)
von: Haiping Zhang
Veröffentlicht: (2025)
Biomolecular Interaction Prediction in the Pre‐ and Post‐ AlphaFold Era: The 8th CAPRI Evaluation
von: Marc F. Lensink, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Marc F. Lensink, et al.
Veröffentlicht: (2025)
PCANN Program for Structure‐Based Prediction of Protein–Protein Binding Affinity: Comparison With Other Neural‐Network Predictors
von: Olga O. Lebedenko, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Olga O. Lebedenko, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Structural Basis for M2 ‐2– MAVS Proteins Interaction in Human Metapneumovirus ( HMPV ): Exploring the Immune Evasion Mechanism Through Biomolecular Modeling, Structural Mutagenesis and Classical Simulations
von: Fahad M. Alshabrmi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Fahad M. Alshabrmi, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Structural Variability of Pfam Domains Based on Alphafold2 Predictions
von: Elly Poretsky, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Elly Poretsky, et al.
Veröffentlicht: (2025)
pH ‐Dependent β‐Strand Alignment of the Alzheimer's Amyloid‐β (16–22) Peptide
von: Junfeng Wan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Junfeng Wan, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Comparative Analysis of Deep Learning‐Based Algorithms for Peptide Structure Prediction
von: Clément Sauvestre, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Clément Sauvestre, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Protein–Ligand Structure Prediction by Template‐Guided Ensemble Docking Strategy
von: Keqiong Zhang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Keqiong Zhang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Protein–Protein Interaction Prediction via Structure‐Based Deep Learning
von: Yucong Liu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Yucong Liu, et al.
Veröffentlicht: (2024)
3D‐ΔΔG: A Dual‐Channel Prediction Model for Protein–Protein Binding Affinity Changes Following Mutation Based on Protein 3D Structures
von: Yuxiang Wang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Yuxiang Wang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Protein Complex Structure Prediction With AlphaFold‐Enhanced HDOCK in CAPRI Rounds 47–55
von: Hao Li, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Hao Li, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Structural basis for the recognition of α‐1,6‐branched α‐glucan by GH13_47 α‐amylase from Rhodothermus marinus
von: Yuki Miyasaka, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Yuki Miyasaka, et al.
Veröffentlicht: (2024)
DeepUSPS : Deep Learning‐Empowered Unconstrained‐Structural Protein Sequence Design
von: Zhichong Ma, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Zhichong Ma, et al.
Veröffentlicht: (2025)
AlphaFold Kinase Optimizer: Enhancing Virtual Screening Performance Through Automated Refinement of AlphaFold ‐Based Kinase Structures
von: Sergei Evteev, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Sergei Evteev, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Enhancing Enzyme Commission Number Prediction With Contrastive Learning and Agent Attention
von: Wendi Zhao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Wendi Zhao, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Structural Insight Into the Function of DnaB Helicase in Bacterial DNA Replication
von: Zhiming Zhang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Zhiming Zhang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Structural Basis for Monomer–Dimer Transition of Dri1 Upon Heme Binding
von: Xiao‐Ying Wang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Xiao‐Ying Wang, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Prediction and Evaluation of Coronavirus and Human Protein–Protein Interactions Integrating Five Different Computational Methods
von: Binghua Li, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Binghua Li, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Structural Classification Insights Into the Plant Defensive Peptides
von: Inda Setyawati, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Inda Setyawati, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Structure and Dynamics of Cannabinoid Binding to the GABA A Receptor
von: Lautaro Damian Alvarez, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Lautaro Damian Alvarez, et al.
Veröffentlicht: (2025)
On the Variation of Structural Divergence Among Residues in Enzyme Evolution
von: Julian Echave, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Julian Echave, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Correction to Structural Classification Insights Into the Plant Defensive Peptides
Veröffentlicht: (2026)
Veröffentlicht: (2026)
Structural Investigation of the Anti‐ CRISPR Protein AcrIE7
von: Jeehee Kang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Jeehee Kang, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Structural and Enzymological Characterization of Phosphoserine Phosphatase From Brucella melitensis
von: Tanguy Scaillet, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Tanguy Scaillet, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Structure and Mechanism of PhdC , a Prenylated‐Flavin Maturase
von: Dominic R. Whittall, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Dominic R. Whittall, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Sequence‐Similar Protein Domain Pairs With Structural or Topological Dissimilarity
von: Peter Røgen
Veröffentlicht: (2024)
von: Peter Røgen
Veröffentlicht: (2024)
Structural Analysis and Inhibitor Modeling of Bacterioferritin From Brucella abortus
von: Lijun Liu, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Lijun Liu, et al.
Veröffentlicht: (2026)
Ähnliche Einträge
-
Predicting the Oligomeric State of Proteins Using Multiple Templates Detected by Complementary Alignment Methods
von: Yuxian Luo, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Cover Image, Volume 93, Issue 12
von: Yuxian Luo, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Assessment of Nucleic Acid Structure Prediction in CASP16
von: Rachael C. Kretsch, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Cryo‐ EM Analysis in CASP16
von: Thomas Mulvaney, et al.
Veröffentlicht: (2025) -
Protein Target Highlights in CASP16 : Insights From the Structure Providers
von: Leila T. Alexander, et al.
Veröffentlicht: (2025)