Comparative Analysis of Deep Learning‐Based Algorithms for Peptide Structure Prediction
Fuente:
Wiley Open Access
Salvato in:
| Autori principali: | Clément Sauvestre, Jean‐François Zagury, Florent Langenfeld |
|---|---|
| Natura: | Artículo Open Access |
| Pubblicazione: |
Wiley
2025
|
| Soggetti: | |
| Accesso online: | |
| Tags: |
Aggiungi Tag
Nessun Tag, puoi essere il primo ad aggiungerne!!
|
Documenti analoghi
Protein–Protein Interaction Prediction via Structure‐Based Deep Learning
di: Yucong Liu, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Yucong Liu, et al.
Pubblicazione: (2024)
Structural Classification Insights Into the Plant Defensive Peptides
di: Inda Setyawati, et al.
Pubblicazione: (2024)
di: Inda Setyawati, et al.
Pubblicazione: (2024)
Correction to Structural Classification Insights Into the Plant Defensive Peptides
Pubblicazione: (2026)
Pubblicazione: (2026)
Assessing Structural Classification Using AlphaFold2 Models Through ECOD ‐Based Comparative Analysis
di: Takeshi Kawabata, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Takeshi Kawabata, et al.
Pubblicazione: (2025)
Protein‐Ligand Structure and Affinity Prediction in CASP16 Using a Geometric Deep Learning Ensemble and Flow Matching
di: Alex Morehead, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Alex Morehead, et al.
Pubblicazione: (2025)
DeepUSPS : Deep Learning‐Empowered Unconstrained‐Structural Protein Sequence Design
di: Zhichong Ma, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Zhichong Ma, et al.
Pubblicazione: (2025)
Enhancing RNA 3D Structure Prediction in CASP16 : Integrating Physics‐Based Modeling With Machine Learning for Improved Predictions
di: Sicheng Zhang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sicheng Zhang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Exploring the Effect of Hydrocarbon Cross‐Linkers on the Structure and Binding of Stapled p53 Peptides
di: Asha Rani Choudhury, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Asha Rani Choudhury, et al.
Pubblicazione: (2025)
In Silico Structure‐Guided Design of Peptide Candidates Targeting γ‐Secretase Subunit Assembly
di: Selcen Arı Yuka, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Selcen Arı Yuka, et al.
Pubblicazione: (2026)
Structural Variability of Pfam Domains Based on Alphafold2 Predictions
di: Elly Poretsky, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Elly Poretsky, et al.
Pubblicazione: (2025)
Progress and Bottlenecks for Deep Learning in Computational Structure Biology: CASP Round XVI
di: Andriy Kryshtafovych, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Andriy Kryshtafovych, et al.
Pubblicazione: (2025)
Comparative Binding Dynamics of Minibinder 8.6 and HBD3 With TLR3 as Adjuvants for Developing a Peptide‐Based Multi‐Epitope Subunit Vaccine Against mCRPC : A Molecular Dynamics Study
di: Ishani Paul, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Ishani Paul, et al.
Pubblicazione: (2026)
Binding Differences of the Peptide‐Substrate–Binding Domain of Collagen Prolyl 4‐Hydroxylases I and II for Proline‐ and Hydroxyproline‐Rich Peptides
di: M. Mubinur Rahman, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: M. Mubinur Rahman, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structural Analysis of the SARS ‐ CoV ‐2 Spike N‐Terminal Domain Across Wild‐Type and Recent Variants: A Comparative Study
di: Miriana Quaranta, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Miriana Quaranta, et al.
Pubblicazione: (2025)
PCANN Program for Structure‐Based Prediction of Protein–Protein Binding Affinity: Comparison With Other Neural‐Network Predictors
di: Olga O. Lebedenko, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Olga O. Lebedenko, et al.
Pubblicazione: (2025)
Kinetic Characterization of Inhibition of Cathepsins L and S by Peptides With Anticancer Potential
di: Olga E. Chepikova, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Olga E. Chepikova, et al.
Pubblicazione: (2025)
Assessment of Nucleic Acid Structure Prediction in CASP16
di: Rachael C. Kretsch, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Rachael C. Kretsch, et al.
Pubblicazione: (2025)
Improving AlphaFold2 ‐ and AlphaFold3 ‐Based Protein Complex Structure Prediction With MULTICOM4 in CASP16
di: Jian Liu, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jian Liu, et al.
Pubblicazione: (2025)
Protein–Ligand Structure Prediction by Template‐Guided Ensemble Docking Strategy
di: Keqiong Zhang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Keqiong Zhang, et al.
Pubblicazione: (2025)
pH ‐Dependent β‐Strand Alignment of the Alzheimer's Amyloid‐β (16–22) Peptide
di: Junfeng Wan, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Junfeng Wan, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structural and Comparative Stability of a Truncated N‐Terminal Domain of DNA Gyrase A From Salmonella Typhi
di: Mohd Salman, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Mohd Salman, et al.
Pubblicazione: (2025)
AlphaFold2 ‐Guided Cyclic Peptide Stabilizer Design to Target Protein–Protein Interactions
di: Niklas Halbwedl, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Niklas Halbwedl, et al.
Pubblicazione: (2026)
3D‐ΔΔG: A Dual‐Channel Prediction Model for Protein–Protein Binding Affinity Changes Following Mutation Based on Protein 3D Structures
di: Yuxiang Wang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yuxiang Wang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structural Analysis and Inhibitor Modeling of Bacterioferritin From Brucella abortus
di: Lijun Liu, et al.
Pubblicazione: (2026)
di: Lijun Liu, et al.
Pubblicazione: (2026)
Accurate Biomolecular Structure Prediction in CASP16 With Optimized Inputs to State‐Of‐The‐Art Predictors
di: Wenkai Wang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wenkai Wang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Protein Complex Structure Prediction With AlphaFold‐Enhanced HDOCK in CAPRI Rounds 47–55
di: Hao Li, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Hao Li, et al.
Pubblicazione: (2025)
Evaluation of the Ability of Wasp Venom Bioinspired Peptides (Fraternine‐10 and Octovespin) in the Disaggregation and Anti‐Aggregation of Amyloid‐ β Fibrils
di: Yuri Alves de Oliveira Só, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Yuri Alves de Oliveira Só, et al.
Pubblicazione: (2025)
A Review on Efficient and Scalable Graph‐Based Clustering Algorithms for Protein Complex Identification in PPI Networks
di: Sabyasachi Patra, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sabyasachi Patra, et al.
Pubblicazione: (2025)
DisDock : A Deep Learning Method for Metal Ion‐Protein Redocking
di: Menghan Lin, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Menghan Lin, et al.
Pubblicazione: (2025)
Enhancing Enzyme Commission Number Prediction With Contrastive Learning and Agent Attention
di: Wendi Zhao, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Wendi Zhao, et al.
Pubblicazione: (2025)
Supervised Learning of Protein Melting Temperature: Cross‐Species vs. Species‐Specific Prediction
di: Sebastián García López, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sebastián García López, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structural and Functional Analysis of Plant Oil‐Body Lipase EgLIP1 From Elaeis guineensis
di: Jia Rong Tey, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jia Rong Tey, et al.
Pubblicazione: (2025)
Development of a Novel Method for Representing 3D Structures of Nucleotides Using the Concept of the TSR Algorithm and Evaluation of the Method Through Studying Specific Interactions Between DNAs and p53
di: Krishna Rauniyar, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Krishna Rauniyar, et al.
Pubblicazione: (2025)
AlphaFold Kinase Optimizer: Enhancing Virtual Screening Performance Through Automated Refinement of AlphaFold ‐Based Kinase Structures
di: Sergei Evteev, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Sergei Evteev, et al.
Pubblicazione: (2025)
Comparative Dynamics Enables Discovery of Embedded Bacterial Ferredoxin Domains in Large Redox Enzymes
di: Jan A. Siess, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jan A. Siess, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structure and Dynamics of Cannabinoid Binding to the GABA A Receptor
di: Lautaro Damian Alvarez, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Lautaro Damian Alvarez, et al.
Pubblicazione: (2025)
On the Variation of Structural Divergence Among Residues in Enzyme Evolution
di: Julian Echave, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Julian Echave, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structural Investigation of the Anti‐ CRISPR Protein AcrIE7
di: Jeehee Kang, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Jeehee Kang, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structural and Enzymological Characterization of Phosphoserine Phosphatase From Brucella melitensis
di: Tanguy Scaillet, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Tanguy Scaillet, et al.
Pubblicazione: (2025)
Structure and Mechanism of PhdC , a Prenylated‐Flavin Maturase
di: Dominic R. Whittall, et al.
Pubblicazione: (2025)
di: Dominic R. Whittall, et al.
Pubblicazione: (2025)
Documenti analoghi
-
Protein–Protein Interaction Prediction via Structure‐Based Deep Learning
di: Yucong Liu, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Structural Classification Insights Into the Plant Defensive Peptides
di: Inda Setyawati, et al.
Pubblicazione: (2024) -
Correction to Structural Classification Insights Into the Plant Defensive Peptides
Pubblicazione: (2026) -
Assessing Structural Classification Using AlphaFold2 Models Through ECOD ‐Based Comparative Analysis
di: Takeshi Kawabata, et al.
Pubblicazione: (2025) -
Protein‐Ligand Structure and Affinity Prediction in CASP16 Using a Geometric Deep Learning Ensemble and Flow Matching
di: Alex Morehead, et al.
Pubblicazione: (2025)