Genetic fidelity analysis in pineapple vitroplants obtained from Venezuelan Amazonian ecotype using RAPD markers

Fuente: Zenodo
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Main Authors: Blanco Flores, Héctor A., Vargas Cedeño, Teresa E., García García, Carmen C., García de García, Eva C.
Format: Recurso digital
Language:English
Published: Zenodo 2025
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_version_ 1866901308757245952
author Blanco Flores, Héctor A.
Vargas Cedeño, Teresa E.
García García, Carmen C.
García de García, Eva C.
author_facet Blanco Flores, Héctor A.
Vargas Cedeño, Teresa E.
García García, Carmen C.
García de García, Eva C.
contents <p><strong>Abstract</strong></p> <p><span lang="EN-US">The present study aims to evaluate the genetic variability of vitro plants obtained from a pineapple ecotype (<em>Ananas comosus</em>) from the Venezuelan Amazon, known as Gobernadora through Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPDs markers). Vitroplans were obtained via three different protocols: Bud culture (BC), somatic embryogenesis (ES) and adventitious organogenesis (OA). Genomic DNA was obtained from leaves sections from different groups of vitroplants and the mother plant. Fourteen decameric primers of arbitrary sequence were tested in the analysis. The electrophoresis revealed 77 bands: 70 were common both to the mother plant and to the vitroplants obtained by the three morphogenic processes, (90.9 monomorphic bands) and 7 were not common (9.1% polymorphic bands). The initiators OPA-01, OPB-01, OPF-13, and OPV-19 detected polymorphism in a plant obtained through bud culture, which was named Gob B6. </span><span lang="EN-US">This plant had a different leaf anatomical structure than that of the mother plant and that of the population of in vitro plants obtained through bud culture. The genetic instability presented in the <em>in vitro</em> plants obtained through bud culture leads us to conclude that the processes of somatic embryogenesis and adventitious organogenesis are more reliable systems for the mass clonal propagation of these plants. This study may provide information on how different morphogenic pathways, induced in the <em>in vitro</em> environment, can affect the genetic stability of <em>in vitro</em> pineapple plants.</span></p> <p><strong><span lang="EN-US">Resumen</span></strong></p> <p><span lang="EN-US"><span><span lang="ES">El presente estudio tuvo como objetivo evaluar la variabilidad genética de vitroplantas obtenidas de un ecotipo de piña (<em>Ananas comosus</em>) de la Amazonía venezolana, conocido como Gobernadora a través de marcadores de ADN Polimórfico Amplificado Aleatoriamente (RAPDs).</span></span><span lang="ES"> </span><span>Las vitroplantas se obtuvieron a trav<span>é</span>s de tres diferentes protocolos: cultivo de yemas (CY), embriog<span>é</span>nesis som<span>á</span>tica (SE) y organog<span>é</span>nesis adventicia (OA). El ADN genomico se obtuvo de secciones de hojas de las vitroplantas y de la planta madre. El an<span>á</span>lisis se realiz<span>ó</span> con catorce iniciadores decaméricos de secuencia arbitraria. La electroforesis revel<span>ó</span> 77 bandas: 70 fueron comunes a la planta madre y a las vitroplantas obtenidas mediante los tres procesos morfogen<span>é</span>ticos (99 bandas monomorfas), y 7 bandas que no eran comunes (9,1 % de bandas polimorfas). Los iniciadores OPA-01, OPB-01, OPF-13 and OPV-19 detectaron polimorfismo en una planta obtenida a trav<span>é</span>s del cultivo de yemas, la cual se denomin<span>ó</span> Gob B6. Esta planta tuvo una estructura anatómica de la hoja diferente a la de la planta madre y a la de la población de plantas <em>in vitro</em> obtenidas mediante cultivo de yemas. La inestabilidad genética presentada en las plantas <em>in vitro</em> obtenidas mediante el cultivo de yemas, nos lleva a concluir que los procesos de embriogénesis somática y organogénesis adventicia son sistemas más fiables para la propagación clonal masiva de estas plantas. Este estudio puede proporcionar información sobre cómo las diferentes vías morfogénicas, inducidas en el ambiente <em>in vitro</em>, pueden afectar a la estabilidad genética de las vitro plantas de piña.</span></span></p>
format Recurso digital
id zenodo_https___doi_org_10_5281_zenodo_17506082
institution Zenodo
language eng
publishDate 2025
publisher Zenodo
record_format zenodo
spellingShingle Genetic fidelity analysis in pineapple vitroplants obtained from Venezuelan Amazonian ecotype using RAPD markers
Blanco Flores, Héctor A.
Vargas Cedeño, Teresa E.
García García, Carmen C.
García de García, Eva C.
Clonal propagation
organogenesis
somatic embryogenesis
buds culture
clonal stability
molecular markers
propagación clonal
embriogénesis somática
cultivo de brotes
estabilidad clonal
marcadores moleculares
<p><strong>Abstract</strong></p> <p><span lang="EN-US">The present study aims to evaluate the genetic variability of vitro plants obtained from a pineapple ecotype (<em>Ananas comosus</em>) from the Venezuelan Amazon, known as Gobernadora through Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPDs markers). Vitroplans were obtained via three different protocols: Bud culture (BC), somatic embryogenesis (ES) and adventitious organogenesis (OA). Genomic DNA was obtained from leaves sections from different groups of vitroplants and the mother plant. Fourteen decameric primers of arbitrary sequence were tested in the analysis. The electrophoresis revealed 77 bands: 70 were common both to the mother plant and to the vitroplants obtained by the three morphogenic processes, (90.9 monomorphic bands) and 7 were not common (9.1% polymorphic bands). The initiators OPA-01, OPB-01, OPF-13, and OPV-19 detected polymorphism in a plant obtained through bud culture, which was named Gob B6. </span><span lang="EN-US">This plant had a different leaf anatomical structure than that of the mother plant and that of the population of in vitro plants obtained through bud culture. The genetic instability presented in the <em>in vitro</em> plants obtained through bud culture leads us to conclude that the processes of somatic embryogenesis and adventitious organogenesis are more reliable systems for the mass clonal propagation of these plants. This study may provide information on how different morphogenic pathways, induced in the <em>in vitro</em> environment, can affect the genetic stability of <em>in vitro</em> pineapple plants.</span></p> <p><strong><span lang="EN-US">Resumen</span></strong></p> <p><span lang="EN-US"><span><span lang="ES">El presente estudio tuvo como objetivo evaluar la variabilidad genética de vitroplantas obtenidas de un ecotipo de piña (<em>Ananas comosus</em>) de la Amazonía venezolana, conocido como Gobernadora a través de marcadores de ADN Polimórfico Amplificado Aleatoriamente (RAPDs).</span></span><span lang="ES"> </span><span>Las vitroplantas se obtuvieron a trav<span>é</span>s de tres diferentes protocolos: cultivo de yemas (CY), embriog<span>é</span>nesis som<span>á</span>tica (SE) y organog<span>é</span>nesis adventicia (OA). El ADN genomico se obtuvo de secciones de hojas de las vitroplantas y de la planta madre. El an<span>á</span>lisis se realiz<span>ó</span> con catorce iniciadores decaméricos de secuencia arbitraria. La electroforesis revel<span>ó</span> 77 bandas: 70 fueron comunes a la planta madre y a las vitroplantas obtenidas mediante los tres procesos morfogen<span>é</span>ticos (99 bandas monomorfas), y 7 bandas que no eran comunes (9,1 % de bandas polimorfas). Los iniciadores OPA-01, OPB-01, OPF-13 and OPV-19 detectaron polimorfismo en una planta obtenida a trav<span>é</span>s del cultivo de yemas, la cual se denomin<span>ó</span> Gob B6. Esta planta tuvo una estructura anatómica de la hoja diferente a la de la planta madre y a la de la población de plantas <em>in vitro</em> obtenidas mediante cultivo de yemas. La inestabilidad genética presentada en las plantas <em>in vitro</em> obtenidas mediante el cultivo de yemas, nos lleva a concluir que los procesos de embriogénesis somática y organogénesis adventicia son sistemas más fiables para la propagación clonal masiva de estas plantas. Este estudio puede proporcionar información sobre cómo las diferentes vías morfogénicas, inducidas en el ambiente <em>in vitro</em>, pueden afectar a la estabilidad genética de las vitro plantas de piña.</span></span></p>
title Genetic fidelity analysis in pineapple vitroplants obtained from Venezuelan Amazonian ecotype using RAPD markers
topic Clonal propagation
organogenesis
somatic embryogenesis
buds culture
clonal stability
molecular markers
propagación clonal
embriogénesis somática
cultivo de brotes
estabilidad clonal
marcadores moleculares
url https://doi.org/10.5281/zenodo.17506082