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Resistant starch from plantain (Macho Musa paradisiaca L.) and banana (Roatan Musa sapientum L.) varieties crosslinked with epichlorohydrin
Pubblicazione 2024Fuente: Universidad del PapaloapanTipo de material: ArtículoDescripción: Resistant starch from plantain (Macho Musa paradisiaca L.) and banana (Roatan Musa sapientum L.) varieties was chemically modified by crosslinking using epichlorohydrin (EPI). These modified starches were subjected to in vitro digestibility studies using the Englyst method to determine the content of rapidly digestible starch (RDS), slowly digestible starch (SDS) and resistant starch (RS). The thermal stability of these crosslinked starches was evaluated by gelatinization and retrogradation analyses, and their enthalpies were determined using differential scanning calorimetry (DSC). Additionally, their functional properties were evaluated. Chemical modification with EPI significantly increased the RS content in both starch varieties compared to that in native starch. The enthalpy and gelatinization temperature decreased in the EPI-modified starches of both varieties, indicating lower thermal stability during the gelatinization process compared to that of native starch. In general, both varieties of crosslinked plantain starch had lower viscosity (0.43 Pa*s) than did native starch (0.58 Pa*s). The results indicates that this starch crosslinked with EPI constitutes an alternative for use in food for people with health problems such as high cholesterol levels or postprandial insulin concentrations.Acceso al recurso -
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Identificación molecular del primer lobo fino de Galápagos (Arctocephalus galapagoensis) registrado en la costa central de Oaxaca
Pubblicato in Ciencias Marinas (2021)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: Several sightings of different pinniped species have been recorded outside their typical areas of distribution. In May 2019, pinniped yearlings were sighted on 4 occasions on the central coast of Oaxaca, Mexico. One of them was found injured in La Escobilla (Oaxaca, Mexico) and was transported immediately to the Centro Mexicano de la Tortuga for rehabilitation. Visual identification of the species was inconclusive, as young individuals of several fur seal species can be very similar. A molecular analysis was thus performed to confirm the species. DNA was extracted from the individual, and a fragment of the mitochondrial DNA control region was sequenced and aligned with several sequences of other fur seal species. A parsimony analysis was performed, and the tree revealed that the individual was a Galapagos fur seal, Arctocephalus galapagoensis. This is the first record of this species on the central coast of Oaxaca. The atypical presence of this species in the country could be related to high sea surface temperatures associated with events such as El Niño. Diversos avistamientos de diferentes especies de pinnípedos han sido registrados fuera de sus habituales áreas de distribución. En mayo de 2019, se avistaron, en 4 ocasiones, pinnípedos de aproximadamente un año de edad en la costa central de Oaxaca, México. Uno de los individuos se encontró herido en la localidad de La Escobilla (Oaxaca, México) y fue trasladado inmediatamente al Centro Mexicano de la Tortuga para su rehabilitación. La identificación visual de la especie fue inconclusa debido a que los individuos juveniles de diversas especies de lobo fino pueden ser muy parecidos. Por lo tanto, se realizó un análisis molecular para confirmar la especie. Se extrajo ADN del individuo y se secuenció un fragmento de la región control del ADN mitocondrial. La secuencia del ADN se alineó junto con secuencias de otras especies de lobo fino. Se realizó un análisis de parsimonia, y el árbol confirmó que el individuo era un lobo fino de Galápagos, Arctocephalus galapagoensis. Este es el primer registro de la especie en la costa central de Oaxaca. La presencia atípica de esta especie en el país podría estar relacionada con altas temperaturas superficiales del mar causadas por eventos como El Niño.Acceso al recurso -
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Estimación de las frecuencias alélicas y genotípicas de los genes CAPN1 Y CAST asociados a la calidad de la carne en bovinos de la Cuenca del Papaloapan
Pubblicazione 2017Fuente: Universidad del PapaloapanTipo de material: ArtículoDescripción: El ganado de doble propósito es aquel utilizado para producir carne y leche. Generalmente es el producto del cruce de razas de origen Cebú x europeas y/o Criollo. Este grupo genético se ha adaptado a las condiciones climáticas de temperatura, humedad, baja calidad de pastos y clases de parásitos que prevalecen en las regiones tropicales. En este trabajo, se realizó un escrutinio molecular para observar la frecuencia de dos polimorfismos del gen de la μ-calpaína (CAPN1-316, CAPN1-530) y uno del gen de la calpastatina (CAST), asociados a la suavidad de la carne en ganado bovino de doble propósito de la Cuenca del Papaloapan. Las pruebas se basaron en Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) y Polimorfismos de la Longitud de Fragmentos de Restricción (RFLPs) con las enzimas de restricción Btg I, Ava II y Rsa I para los alelos C-G, A-G y C-G, respectivamente (n=331). Para CAPN1-316 las frecuencias genotípicas obtenidas fueron de 0.03 (AA), 0.86 (GG) y 0.11 (GA) y las frecuencias alélicas fueron 0.86 (G) y 0.14 (A). Para el marcador CAPN1-530 las frecuencias genotípicas fueron de 0.02 (CC), 0.85 (GG) y 0.13 (GC), con una frecuencia alélica de 0.85 para G y 0.15 para C. Las frecuencias genotípicas para el marcador CAST fueron de 0.32 (CC), 0.28 (GG) y 0.4 (GC), con una frecuencia alélica de 0.68 para el alelo G y 0.32 para el alelo C. La población en estudio no se encontró en equilibrio Hardy Weinberg y los valores de χ2P con dos grados de libertad fueron de 0.964, 0.985 y 0.9803 para CAPN1-316, CAPN1-530 y CAST, respectivamente. De acuerdo con el porcentaje de la genotipificación de los marcadores en los genes CAPN1 y CAST se concluye que la población analizada tiene bajos índices de marcadores para la suavidad o terneza de la carne, probablemente por las cruzas no dirigidas que se realizan habitualmente, de esta forma se propone, mejorar la calidad de la carne en base a programas de mejoramiento genético dirigido utilizando los animales genéticamente superiores resultantes de este estudio.Acceso al recurso -
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Evaluacion de la calidad de la cepa de Artemia Las Cumaraguas, Paraguana, Venezuela
Pubblicato in Ciencias Marinas (1994)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: Quality evaluation tests were done on the strain of Artemia Las Cumaraguas, Paraguaná, Venezuela, in terms of cyst and naupliar (Instar 1) biometrics, as well as percentage, efficiency, rate and productivity of hatching. Bi-monthly sampling of cysts was carried out from January to September 1991. Simultaneously. temperature and salinity were measured. Average hydrated cyst diameter was 238.14 µm (s.d. ± 0.012). Average length of the nauplii (Instar 1) was 438.69 µm (s.d. ± 0.028) and average chorion thickness 1 1.36 µm (s.d. ± 0.012). Average hatching percentage and efficiency were 81.25% (s.d. ± 3.27) and 203.505 naupliiig (s.d. ± 20.95), respectively. As to hatching rate, T90 was observed at 24.14 hours and the hatching synchrony was obtained at 10.7 hours. Hatching productivity ranged from 184.3 to 354.53 mg/g of cysts. Results reveal the potentiality of Artemia from Las Cumaraguas and its possible use in aquaculture. Se caracterizaron biológicamente poblaciones de Artemia de Las Cumaraguas, Paraguaná, Venezuela, en términos de biometría de quistes y nauplios, porcentaje, eficiencia, tasa y producción de la eclosión. Los quistes de Artemia se recolectaron quincenalmente, entre los meses de enero a septiembre de 1991, y se determinaron simultáneamente los factores ambientales de salinidad y temperatura. El diámetro promedio de los quistes hidratados fue 238.14 µm (d.e. ± 0.012). El tamaño promedio del nauplio (Instar 1) fue 438.69 µm (d.e. ± 0.028) y cl espesor promedio del corión 1 1.36 µm (d.e. ± 0.012). Los promedios de porcentaje y eficiencia de eclosión fueron 81.25% (d.e. ± 3.27) y 203.505 nauplios/g (d.e.± 20.95). En cuanto a la tasa de eclosion, el T90) se produjo a las 24.14 horas y el tiempo de sincronización se logró a las 10.7 horas. La producción dc la eclosión oscilo entre 184.3 y 354.53 mg/g de quistes. Los resultados revelan que el aprovechamiento de Artemia de Las Cumaraguas ofrece buenas perspectivas para la acuicultura.Acceso al recurso -
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Evidence of sexual reproduction in the hermatypic corals Pocillopora damicornis, Porites panamensis, and Pavona gigantea in Banderas Bay, Mexican Pacific
Pubblicato in Ciencias Marinas (2011)Fuente: Redalyc · Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: The reproductive capacity of coral communities in the Mexican Pacific is still poorly documented. One of the most abundant coral communities in this region is found in Banderas Bay, yet the reproductive patterns of the coral species have not been analyzed. In order to document the annual reproductive cycle of the three most common species of corals in the bay, samples of Pocillopora damicornis, Porites panamensis, and Pavona gigantea were collected monthly from Redonda Island from December 2001 to November 2002. Colony fragments were processed by histological techniques and analyzed under a microscope. The three species showed the presence of gametes, which was associated with an increase in sea surface temperature. Gametogenesis was first observed in P. damicornis, classified as hermaphrodite. In P. panamensis, reproductive cells were observed in May 2002, and embryos and planulae in September 2002; this species was classified as gonochoric, showing internal fertilization and a distinct reproductive behavior compared with that reported for other areas of the eastern tropical Pacific. In P. gigantea, gametogenesis started later and occurred over a short period of time; this species was classified as gonochoric and no mature gametes were evident. All three species showed reproductive potential during the summer, confirming the reproductive capacity documented for these species in adjoining areas of the Mexican Pacific. The intensity and duration of the reproductive cycle in Banderas Bay are likely regulated by periodic events like El Niño and microscale climate oscillations that modulate temperature and light patterns in the area. La capacidad reproductiva de las comunidades coralinas en el Pacífico mexicano está poco documentada. Una de las comunidades de coral más abundantes de esta región se encuentra en Bahía de Banderas; sin embargo, los patrones reproductivos de las especies de corales no han sido analizados. Con el objetivo de documentar el ciclo reproductivo anual de las tres especies de corales más abundantes en la bahía, se recolectaron muestras mensuales de Pocillopora damicornis, Porites panamensis y Pavona gigantea frente a Isla Redonda, de diciembre de 2001 a noviembre de 2002. Los fragmentos de las colonias se procesaron mediante técnicas histológicas y se analizaron con ayuda del microscopio. Las tres especies mostraron presencia de gametos, la cual se asoció con el incremento de la temperatura superficial del mar. La primer especie en presentar gametos fue P. damicornis, clasificada como hermafrodita. Porites panamensis presentó gametos a partir de mayo de 2002, y embriones y plánulas en septiembre del mismo año; esta especie se consideró como gonocórica, con fecundación interna y con comportamiento reproductivo diferente a lo reportado en otras localidades del Pacífico oriental tropical. Pavona gigantea fue la última especie en presentar gametos y por un periodo corto; se clasificó como gonocórica y no se observaron gametos maduros. Las tres especies mostraron un potencial reproductivo que se circunscribió al periodo de verano, lo que confirma la capacidad reproductiva documentada para estas especies en regiones aledañas del Pacífico mexicano. La intensidad y duración de los periodos reproductivos en Bahía de Banderas podrían estar en función de la presencia de fenómenos periódicos, como El Niño, y oscilaciones climáticas a nivel de microescala que afecten los patrones de temperatura e intensidad de luz en la bahía.Acceso al recurso -
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Variación oceanográfica temporal según datos de imágenes satelitales de la zona de convergencia del Pacífico central mexicano
Pubblicato in Ciencias Marinas (2023)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: The oceanographic variation of the central Mexican Pacific (CMP) is mainly driven by the California Current and the Mexican Coastal Current, which generate a convergence zone. Little information is available regarding changes in oceanographic variables at the mesoscale level in the CMP. Therefore, this study characterized 6 oceanographic variables (sea surface temperature, chlorophyll concentration [Chl], primary productivity [PP], diffuse attenuation coefficient [K490], and particulate inorganic/organic carbon concentration [PIC, POC]) in the CMP from 2010 to 2017 and their relationships with El Niño/Southern Oscillation (ENSO). The variables were standardized to monthly pixel values of 0.08 latitude degrees, and the study area covered 48,846.48 km2. Friedman tests were used to compare the temporal variation in the variables, while Spearman correlations were used to evaluate the relationship between each variable and the Multivariate ENSO Index (MEI). A cross-correlation analysis was performed to determine the temporal lag between the oceanographic variables and the MEI. The cyclicity of the variation in the CMP was determined by spectral analysis. All variables showed significant differences between months and years. Two seasons defined by temperature were also detected: a cold season (December–June), in which high values of these variables were observed, and a warm season (July–November), in which low values of these variables were observed. No variables were correlated with the MEI; however, a 4-month time lag was identified between the variables and the MEI. The cyclicity of the variables corresponded to the cold and warm seasons. The cold phase of ENSO increased the values of PP, Chl, and K490 up to 4 times compared to those of other years. Taken together, the observed variation in oceanographic conditions makes the CMP one of the most dynamic coastal regions of the Mexican Pacific. La variación oceanográfica del Pacífico central mexicano (PCM) está influenciada por la corriente de California y la corriente costera Mexicana, que generan una zona de convergencia. Existe poca información acerca de los cambios en las variables oceanográficas a nivel de mesoescala en el PCM. Por lo tanto, este estudio caracterizó 6 variables oceanográficas (temperatura superficial del mar, concentración de clorofila [Cl], productividad primaria [PP], coeficiente de atenuación difusa [K490] y concentración de carbono inorgánico/orgánico particulado [CIP, COP]) en el PCM de 2010 a 2017 y su relación con El Niño/Oscilación del Sur (ENOS). Las variables se estandarizaron a valores mensuales en píxeles de 0.08 grados latitudinales, y el área de estudio cubrió 48,846.48 km2. Para comparar la variación temporal en las variables, se utilizó la prueba de Friedman, y la relación entre cada variable y el Índice Multivariado de ENOS (IME) se obtuvo con una correlación de Spearman. Para establecer el desfase temporal entre las variables y el IME, se realizó una correlación cruzada. La ciclicidad de la variación en el PCM se determinó mediante un análisis espectral. Todas las variables mostraron diferencias significativas entre meses y años. Se detectaron 2 temporadas definidas por la temperatura, una temporada fría (diciembre-junio), con valores de las variables altos, y una temporada cálida (julio-noviembre), con valores de las variables bajos. Ninguna variable mostró correlación con el IME; sin embargo, se determinó un lapso de respuesta de 4 meses entre estas y el IME. La ciclicidad de las variables corresponde a la estación fría y la estación cálida. La fase fría del ENOS incrementó los valores de PP, Cl y K490 hasta 4 veces más en comparación con aquellos observados en otros años. La variación observada en las condiciones oceanográficas convierte al PCM en una de las regiones costeras más dinámicas del Pacífico mexicano.Acceso al recurso -
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Improvement in flounder Paralichthys orbignyanus controlled spawning in Argentina
Pubblicato in Ciencias Marinas (2007)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: Se evaluó el efecto de la temperatura sobre la maduración gonadal, la liberación de huevos y el comportamiento reproductivo del lenguado Paralichthys orbignyanus (Valenciennes 1839) en cautiverio. La relación de sexos fue de 1:2.2 y 1:2.5 (hembra:macho) en los grupos de reproductores B1 y B2, respectivamente. La talla promedio de las hembras en B1 fue de 3461 ± 861 g y en B2 fue de 1416 ± 435 g. La maduración gonadal se logró con la aplicación de un esquema de fotoperiodo y temperatura simulando las condiciones del medio natural en un periodo de 10 meses, alcanzando en febrero y marzo 19|00E2|??20ºC y 16 h L:08 h O. Las condiciones fototermales usadas en este estudio indujeron la liberación de huevos en P. orbignyanus. La producción de huevos se extendió por un periodo mayor a 4 meses con una frecuencia de 1 a 3 días. El grupo B1 desovó durante 133 días, produciendo 31.9% de huevos viables con diámetro de 882.5 ± 76.4 ?m, una tasa de eclosión de 76.9 ± 17.0%, una supervivencia al tercer día posterior a la eclosión (S-3dpe) de 38.3 ± 25.7%, y un índice de actividad larval (IAE) de 6.1 ± 6.6. El grupo B2 desovó durante 90 días con una producción de huevos viables de 67.1%, diámetro de 866.4 ± 37.9 ?m, tasa de eclosión de 66.4 ± 30%, una S-3dpe de 67.8 ± 26.9% y un IAE de 10.5 ± 7.5. No se hallaron diferencias significativas en la producción total de huevos, tasa de fecundación, fecundidad, diámetro del huevo, tasa de eclosión, S-3dpe y IAE (test no paramétrico de Kruskal-Wallis, P > 0.05) entre B1 y B2, sin embargo, el porcentaje de huevos viables fue significativamente diferente (P 0.05) in total egg production, fertilization rate, fecundity, egg diameter, hatching rate, survival at 3dph and SAI were found between B1 and B2; however, there were significant differences (P < 0.01) in the percentage of buoyant eggs, which was higher for B2. Egg diameter, hatching rate and larval length are good criteria for determining the egg and larval quality of P. orbignyanus.Acceso al recurso -
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Utilización del hábitat vertical del atún aleta amarilla (Thunnus albacares) marcado y liberado en la Reserva de la Biosfera Archipiélago de Revillagigedo, México
Pubblicato in Ciencias Marinas (2018)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: A description of vertical habitat use by yellowfin tuna, Thunnus albacares, captured and released with archival tags in the Revillagigedo Archipelago Biosphere Reserve, Mexico, during the 2006–2011 period is given. An analysis was made of internal and ambient temperatures, depth, and time of day registered in 68 archival tags recovered from tuna caught mostly in sets associated with dolphins by Mexican purse-seine vessels. Tuna were classified into 3 age groups (I, II, and III) for analyses. Vertical movements were analyzed by dividing the water column into 10 depth strata. The 3 age groups remained the longest in the uppermost stratum (0–25 m), and their presence began to diminish in subsequent strata, with some occasional visits at >500-m depths. In the >500 m stratum, age group III was the one with the longest time investment with 45 min on average. Presence at different depths throughout the day showed significant differences among age groups (Wald’s test expressed as χ2, P < 0.05). The physiological adaptation of yellowfin tuna to maintain minimal changes in its internal temperature at different depths gives it the advantage to expand its food search to deep zones where temperature oscillates around 5 ºC. Se describe el uso del hábitat vertical del atún aleta amarilla, Thunnus albacares, capturado y liberado con marca archivadora en la Reserva de la Biosfera Archipiélago de Revillagigedo, México, durante el periodo 2006–2011. Se analizó la serie de datos de temperatura interna, temperatura del ambiente, profundidad y hora del día almacenados en 68 marcas archivadoras recuperadas de los atunes capturados, en su mayoría, en lances pesqueros asociados a delfines por barcos cerqueros atuneros de bandera Mexicana. Los atunes fueron clasificados para su análisis en 3 grupos de edad (I, II y III). Los movimientos verticales se analizaron dividiendo la columna de agua en 10 estratos de profundidad. Los 3 grupos de edad invirtieron más tiempo en el estrato superficial (0–25 m) y su presencia fue disminuyendo a medida que fue aumentando la profundidad, con visitas ocasionales a profundidades mayores que 500 m. En el estrato de >500 m, el grupo de edad III, fue el que más tiempo invirtió con un promedio de 45 min. La presencia a diferentes profundidades a lo largo del día mostró diferencias significativas entre los grupos de edad (prueba χ2 de Wald, P < 0.05). La adaptación fisiológica del AAA para mantener cambios mínimos en su temperatura interna a diferentes profundidades es una ventaja para ampliar la búsqueda de alimento en zonas profundas donde la temperatura del ambiente osciló alrededor de los 5 ºC.Acceso al recurso -
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Effect of cross-linking on the physicochemical, functional and digestibility properties of starch from Macho (Musa paradisiaca L.) and Roatan (Musa sapientum L.) banana varieties
Pubblicazione 2015Fuente: Universidad del PapaloapanTipo de material: ArtículoDescripción: Starches from the Macho (Musa paradisiaca L.) and Roatan (Musa sapientum L.) banana varieties were chemically modified by sodium trimetaphosphate (STMP) cross-linking. Cross-linking affected the pasting properties of the modified starch, with more pronounced changes observed in the Macho variety than in the Roatan starch. In turn, this result indicated that the former starch source is more susceptible to STMP cross-linking. The swelling and solubility profiles exhibited an important decrease with cross-linking, which was caused by increased ordering of the internal granule structure induced by cross-linking modifications. The gelatinization temperature and enthalpy increased due to cross-linking, indicating an improvement in the starch granule stability. Englyst's in vitro digestibility studies of the modified starch were performed to estimate the content of rapidly digestible (RDS), slowly digestible (SDS) and resistant (RS) starch fractions. It was shown that STMP cross-linking increased the RS content of the two banana varieties. However, the SDS content increased only for the Macho variety. In general, the viscosity was lower for the modified starches than for their native counterparts. The results of the current work indicate that the chemical modification process via STMP cross-linking offers an interesting alternative for obtaining RS from banana starches.Acceso al recurso -
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Rasgos de la vida temprana de la dorada común de dos bandas, Diplodus vulgaris (Perciformes: Sparidae), que habita en las aguas poco profundas de la isla de Gökçeada, Turquía
Pubblicato in Ciencias Marinas (2023)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: Daily growth rates and pelagic larval duration were investigated in the common two-banded seabream (Diplodus vulgaris). Fish were sampled using a beach seine from the shallow waters of Gökçeada Island, Turkey, between June 2013 and June 2014. The minimum and maximum daily age estimates were 41 and 339 d, respectively. The mean daily growth rate of young-of-the-year D. vulgaris was 0.330 mm·d–1. Our results showed that D. vulgaris exhibits a Type Ia settlement-mark with a pelagic larval duration of 29 d. The hatching period occurred from November to April. The maximum hatching frequencies were observed in winter, when the water temperature was relatively low. The natural logarithm of young-of-the-year abundance data was plotted against age, and the instant mortality coefficients were estimated. The relationships between total length and otolith morphometric measurements (otolith length [OL], width [OW], and radius [OR]) were defined by linear equations. Furthermore, it was observed that this ratio exhibited a linear relationship with OL, OW, and OR and total length and daily age. Se investigó la duración y el crecimiento de las larvas pelágicas de la dorada común de dos bandas, Diplodus vulgaris. Los ejemplares fueron recolectados con un chinchorro playero en aguas poco profundas de la isla de Gökçeada, Turquía. La edad mínima diaria estimada fue de 41 d, y la máxima de 339 d. La tasa media de crecimiento diario de las crías del año de D. vulgaris fue de 0.330 mm·d–1. Los individuos de D. vulgaris exhibieron una marca de asentamiento Tipo Ia con duración larvaria pelágica de 29 d. El periodo de eclosión ocurrió entre noviembre y abril. Las frecuencias máximas de eclosión se observaron en el invierno, cuando la temperatura del agua era relativamente baja. Los datos del logaritmo natural de la abundancia de las crías del año se graficaron contra la edad, y se estimaron los coeficientes de mortalidad. Las relaciones entre la longitud total y las medidas morfométricas de otolitos (longitud [LO], ancho [AO] y radio [RO] de otolitos) se describieron mediante ecuaciones lineales. Además, se observó que esta relación exhibió una relación lineal entre la LO, el AO y el RO y la longitud total y la edad diaria.Acceso al recurso -
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Diversity of copepods in Atlantic Patagonian coastal waters throughout an annual cycle
Pubblicato in Ciencias Marinas (2016)Fuente: Redalyc · Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: The aim of this study is to analyze the annual zooplankton succession at a coastal station in Patagonia (Argentina), with special emphasis on copepods and their potential preys, using solar radiation and temperature as environmental factors. The annual plankton cycle exhibited autumn/winter and spring/summer phases. During the autumn/winter phase, low temperature and radiation were correlated with higher diatom abundance and copepod diversity. This period was characterized by a dominant classical herbivorous food web in which the large copepod Calanoides carinatus dominated the community. On the contrary, during the spring/summer period, with high radiation and temperature levels, flagellates were the dominant food available for zooplankton and correlated with smaller species of copepods such as the harpacticoid Euterpina acutifrons. Also, intensive reproduction of the small copepods E. acutifrons and Paracalanus parvus occurred mainly in summer. On the other hand, high species diversity was found in winter when the ultraviolet radiation was low. The temporal pattern of the copepods observed in our study was explained by food availability and environmental factors (temperature and solar radiation), although other factors such as predator abundance may also be important in modulating the community. Our results show the importance of copepod abundance dynamics and highlights their key role in the pelagic food web in northern Patagonian coastal waters. El objetivo de este estudio es analizar la sucesión anual del zooplancton en una estación costera en la Patagonia (Argentina), con especial énfasis en copépodos y sus posibles presas, en relación con la radiación solar y la temperatura como factores ambientales. El ciclo anual del plancton mostró dos periodos, otoño/invierno y primavera/verano. Durante el periodo otoño/invierno, la baja temperatura y la radiación se correlacionaron con la mayor abundancia de diatomeas y la mayor diversidad de copépodos. Este periodo se caracterizó por la dominancia de la cadena clásica herbívora, y el copépodo grande Calanoides carinatus dominó la comunidad. Por el contrario, durante el periodo de primavera/verano, con alta radiación y mayores niveles de temperatura, los flagelados fueron el alimento disponible para el zooplancton y se correlacionaron con las especies pequeñas de copépodos como el harpacticoideo Euterpina acutifrons. Además, la reproducción intensiva de los copépodos pequeños E. acutifrons y Paracalanus parvus se llevó a cabo principalmente en verano. Por otro lado, se encontró una alta diversidad de especies en invierno, cuando la radiación ultravioleta fue baja. El patrón temporal de los copépodos observado en nuestro estudio fue explicado por la disponibilidad de alimento y los factores ambientales (temperatura y radiación solar), aunque otros factores tales como la abundancia de los depredadores pueden ser también importantes en la modulación de la comunidad. Nuestros resultados muestran la importancia de la dinámica de la abundancia de copépodos y destaca su papel clave en las cadenas tróficas pelágicas de las aguas costeras de la Patagonia norte.Acceso al recurso -
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El sistema de carbonatos en aguas costeras del norte de la península de Baja California bajo condiciones de La Niña
Pubblicato in Ciencias Marinas (2018)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: In the North Pacific, variations in isopycnal depth influence the biogeochemical characteristics of the water column and the aragonite saturation horizon (ZΩa) during interannual events. The objective of this study was to assess the effect of the 2011 La Niña conditions on ZΩa in Todos Santos Bay (Baja California, Mexico) and surrounding waters. The results showed that ZΩa variability was modulated by the intensity of interannual conditions and by the water masses that were present in the region. Subarctic Water predominated in the upper 200 m with anomalous characteristics, such as low temperature and low salinity. Also, isopycnals shoaled toward the coast and ZΩa was thus ~30 m in the nearshore area, in contrast with the oceanic region, where ZΩa was ~150 m. Prior to this study, there were no records of ZΩa in Todos Santos Bay, nor were there any records of its shallowness. En el Pacífico Norte se presentan variaciones en la profundidad de las isopicnas durante eventos interanuales que influyen en las características biogeoquímicas de la columna de agua y en el horizonte de saturación del aragonita (ZΩa). El objetivo de este trabajo fue evaluar el efecto de las condiciones de La Niña de 2011 sobre el ZΩa en la bahía de Todos Santos (Baja California, México) y aguas adyacentes. Los resultados mostraron que la variabilidad del ZΩa estuvo modulada por la intensidad de las condiciones interanuales y por las masas de agua que se presentaron en la región. En los primeros 200 m superficiales predominó el Agua del Subártico con características anómalas de baja temperatura y baja salinidad. Asimismo, se observó un ascenso de las isopicnas con dirección a la costa y, por tanto, el ZΩa fue de ~30 m en la zona más cercana a la costa, en contraste con la región más oceánica, donde el ZΩa fue de ~150 m. Antes del presente estudio, no se tenían registros del ZΩa para la zona dentro de la bahía de Todos Santos, tampoco de que pudiera ser somero.Acceso al recurso -
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Comparación entre el uso de dos derechos de acceso pesquero, concesiones y permisos, en la pesquería de erizo rojo de mar, Strongylocentrotus franciscanus (Agassiz), en Santo Tomás...
Pubblicato in Ciencias Marinas (2004)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: Various stages of the red sea urchin, Strongylocentrotus franciscanus (Agassiz), fishery were simulated to evaluate the effect of two types of access rights under Mexican law: concessions and licences. The resource biomass was evaluated using the critical depensation and Schaefer models. Each model was evaluated as a static or dynamic system. The parameters required for each model were determined from government data and by generating stochastic numbers using the Monte Carlo method to adjust to a dynamic model. In general, both models predicted catches smaller than those observed. The five-year-period simulation for both models showed a drop in biomass when licences are issued, whereas a similar simulation for concessions resulted in increased biomass, except when high temperatures occurred. Our results suggest that issuing concessions rather than licences is the best option to conserve the fishery. Se simularon diversos escenarios pesqueros con situaciones de riesgo para la pesquería del erizo rojo de mar, Strongylocentrotus franciscanus, y se evaluó el efecto de dos tipos de derechos de uso en la legislación pesquera mexicana: permisos y concesiones. La biomasa del recurso se calculó con dos modelos, el de depensación crítica y el de Schaefer, tanto dinámica como estáticamente. Los parámetros requeridos por cada modelo se determinaron por dos vías: información de oficinas gubernamentales y generando números estocásticos por el Método Monte Carlo ajustándose a un modelo dinámico. El ajuste de los valores de los parámetros de ambos modelos fue por medio de generación de números estocásticos por el méodo de Monte Carlo. En general, ambos modelos pronosticaron capturas menores a las obsevadas. En las simulaciones hechas para cinco años con ambos modelos para el sistema de permisos la biomasa disminuye y con concesiones se mantiene al alza con excepción de los años con temperaturas altas, por lo que la mejor opción para preservar la pesquería es otorgar concesiones en comparación con permisos.Acceso al recurso -
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Producción, purificación, caracterización y determinación del mecanismo hidrolítico de extractos enzimáticos con actividad N-acetilhexosaminidasa de Beauveria bassiana y Penicilliu...
Pubblicazione 2017Fuente: Universidad del PapaloapanTipo de material: TesisDescripción: En este estudio se identificó el mecanismo hidrolítico de extractos enzimáticos con actividad Nhasa provenientes de hongos filamentosos como B. bassiana y Penicillium sp utilizando como sustrato dos fuentes quitinosas: camarón y chapulín. Se demostró que B. bassiana y Penicillium sp logran mayor actividad Nhasa utilizando chapulín como inductor. El proceso de purificación inició con la precipitación con sulfato de amonio al 80% de saturación (0.40 mU/g y 0.46 mU/g para Psp-Ch y Bb-Ch respectivamente) seguida de ultrafiltración con membrana de 30 kDa (para Psp-Ch 0.30 mU/g y para Bb-Ch 0.59 mU/g de actividad específica Nhasa), diálisis y diafiltración (0.45 mU/g y 0.40 mU/g para Psp-Ch y 0.27 mU/g y 0.36 mU/g para Bb Ch). En las etapas de purificación, la ultrafiltración tuvo el mayor porcentaje de rendimiento de 24 % purificando 1.2 veces para Psp-Ch y de 69 % purificando 2.6 veces para Bb-Ch. Se evalúo el efecto de pH y temperatura en conjunto en los extractos enzimáticos purificados de ambos microorganismos donde se obtuvieron para Psp-Ch 19 mU/mL de actividad Nhasa en un pH de reacción de 6 y a 20 °C, mientras que con el extracto Bb-Ch la mayor actividad Nhasa (16 mU/mL) se obtuvo a pH 5 y 20 °C, siendo para Psp-Ch 1.2 veces mayor.Acceso al recurso -
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Descripción de los movimientos verticales y horizontales del tiburón cabeza de martillo, Sphyrna lewini, del sur del Golfo de California, México
Pubblicato in Ciencias Marinas (1993)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: Horizontal and vertical movements are described for four scalloped hammerhead sharks (Sphyrna lewini) tagged with ultrasonic transmitters. The trackings were carried out during August 1986, 1988-1989, and July 1989 in the pelagic environment surrounding Espíritu Santo Seamount and Las Animas Island in the southem Gulf of California. The hammerheads generally remained above the seamount and near the island during the day. Fifteen sharks were tracked during homing movements away from and back to the seamount. Of the excursions, 13 were made into the pelagic region during the night and two during the day. The maximum distance moved away from the seamount ranged from 4 to 20 km. Departure and return movements were at times close to and parallel to each other, suggesting that the sharks followed particular routes to preferred feeding sites. The sharks made vertical excursions, ascending and descending in the water column (in yo-yo form). The diving oscillations occurred between 50 to 450 m. These vertical movements were usually below the surface mixed layer and well away from the bottom. The range in water temperatures (2º-6ºC) encountered during these vertical excursions was small in relation to that reported for other species of fishes, suggesting that for this species the function of the excursions may not be thermoregulation. Se proporciona una descripción de los movimientos horizontales y verticales de cuatro tiburones martillo (Sphyma lewini) marcados con transmisores ultrasónicos. El estudio se llevó a cabo en aguas pelágicas que rodean el Bajo Espíritu Santo y la Isla Las Animas, ubicados en el sur del Golfo de California, durante los meses de agosto de 1986, agosto de 1988 y julio y agosto de 1989. Se observó que los tiburones se mantuvieron generalmente sobre el bajo durante el día. Se realizaron quince seguimientos telemétricos de los movimientos de salida y regreso (homing) al bajo. De estos rastreos, trece se llevaron a cabo hacia la región pelágica durante la noche y dos de día. El intervalo de distancia máxima alcanzada fue de 4 a 20 km. Algunos movimientos de salida y regreso fueron próximos y paralelos uno del otro, lo que sugiere que estos tiburones tienen rutas designadas para visitar sus sitios preferenciales de alimento. Los tiburones presentaron movimientos verticales, ascendentes y descendentes (similares a la trayectoria de un yoyo). El intervalo de profundidad de las inmersiones observadas fue de 50 a 450 m. Los movimientos verticales se llevaron a cabo generalmente por debajo de la capa mixta superficial y por encima del fondo marino. Las diferencias de las temperaturas del agua (2º a 6ºC) en que se desplazaron los tiburones durante sus excursiones verticales fueron pequeñas en relación con las observadas en otras especies de peces, lo que sugiere que para el tiburón martillo la función de dichas excursiones no es de termorregulación.Acceso al recurso -
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Estudio de la α-amilasa recombinante AmiJ33r y del gen que la codifica
Pubblicazione 2015Fuente: Universidad del PapaloapanTipo de material: TesisDescripción: En el presente trabajo el gen que codifica para la α-amilasa AmiJ33, de Bacillus amyloliquefaciens JJC33M, se aisló, clonó y expresó heterólogamente en Escherichia coli. El análisis in sílico de la secuencia peptídica de AmiJ33r predijo una proteína de 659 aminoácidos con un peso molecular de 72kDa (22kDa más que AmiJ33 nativa) y mostró una estrecha relación filogenética con α-amilasas de B. amyloliquefaciens sp., plantarum. En comparación con otras enzimas recombinantes AmiJ33r fue exportada al medio extracelular y mostró características bioquímicas distintas a AmiJ33 nativa. AmiJ33r sólo fue capaz de hidrolizar almidón gelatinizado, mientras que AmiJ33 hidroliza tanto almidón nativo como gelatinizado. Se requirió una mayor concentración de (NH4)2SO4 para precipitar AmiJ33r (80%), en comparación con el 60% usado para precipitar AmiJ33 debido a que la región extra del C-terminal es rica en aminoácidos hidrofílicos. Con respecto al efecto del pH en la actividad, AmiJ33r mostró un perfil de actividad distinto al de AmiJ33. AmiJ33r presentó un pH óptimo a 9, mientras que AmiJ33 tiene un pH óptimo a 5. En cuanto a la estabilidad de la actividad con respecto al pH, AmiJ33r mostró su máxima actividad a pH 5 y 7 y mostró ser menos estable que AmiJ33 a pHs ligeramente ácidos (pH 4). Al evaluar el efecto de temperatura en la actividad AmiJ33r mostró un perfil parecido al de AmiJ33, presentando una temperatura óptima a 80°C. Asimismo, AmiJ33r presentó un perfil de termoestabilidad similar a AmiJ33, mostrando una vida media de 23h, 4.4h y 17.4min a 40, 50 y 60ºC respectivamente. La actividad de AmiJ33r se incrementó 22% con Mn2+ (5mM) y 18% con Ca2+ (10mM). Sorprendentemente AmiJ33r mostró el 60% de actividad en presencia de SDS al 1% (v/v) mientras que, en las mismas condiciones, la actividad de AmiJ33 se inhibió. La actividad de ambas enzimas se inhibió en presencia de 1% (v/v) de β-mercaptoetanol. La evidencia sugiere que los aminoácidos de la región extra del C-terminal de AmiJ33r promueven que la enzima presente mayor actividad a pHs alcalinos y eliminan la capacidad de AmiJ33r para hidrolizar almidón nativo.Acceso al recurso -
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Diversity of phytase-producing marine yeasts
Pubblicato in Ciencias Marinas (2006)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: Se aislaron cepas de levaduras marinas de diferentes hábitats y se monitorearon las que mostraron ser productoras de fitasa. De las 327 cepas aisladas, 10 mostraron comparativamente mayor actividad fitasa. Se examinaron las características fisiológicas y bioquímicas de las levaduras productoras de fitasas, así como el pH y temperatura óptimos para su producción. También se analizaron secuencias parciales del gen 18S rARN. Con base en las características bioquímicas y fisiológicas y análisis filogenéticos, se encontró que las 10 cepas están estrechamente relacionadas con Hanseniaspora uvarum (cepa WZ1), Yarrowia lipolytica (cepa W2B), Kodamaea ohmeri (cepa BG3), Candida carpophila (cepa N12C), Issatchenkia orientalis (cepa YF04C), Candida tropicalis (cepa MA6), Yarrowia lipolytica (cepa YF08), Candida carpophila (cepa NY4E), Candida tropicalis (cepa YF12C), y Candidad tropicalis (cepa MB2). Estas cepas se obtuvieron de estómagos de peces no identificados, de vísceras de Holothuria scabra, de Hexagrammos otakii, de Hexagrammos otakii, de Synechogobius hasta, así como directamente de agua de mar. Es interesante resaltar que algunas levaduras marinas pueden producir fitasa alcalina. |00C3|?sta es la primera vez que se reportan cepas de levaduras marinas capaces de producir fitasa extracelular o unida a las células. Los resultados también indican que las levaduras marinas productoras de fitasa fueron lo suficientemente diversas como para ser utilizadas en la bioremediación de contaminación marina por fósforo. Marine yeast strains from different habitats were isolated and phytase-producing marine yeasts were screened. Of the 327 yeast strains isolated, 10 showed comparatively higher phytase activity. Physiological and biochemical characters of these 10 strains, and optimum pH and temperature of the crude phytases produced by them were examined. Partial sequences of the 18S rDNA were also analyzed. Based on the physiological and biochemical characters and phylogenetic analyses, the 10 strains were found to be closely related to Hanseniaspora uvarum (strain WZ1), Yarrowia lipolytica (strain W2B), Kodamaea ohmeri (strain BG3), Candida carpophila (strain N12C), Issatchenkia orientalis (strain YF04C), Candida tropicalis (strain MA6), Yarrowia lipolytica (strain YF08), Candida carpophila (strain NY4E), Candida tropicalis (strain YF12C), and Candida tropicalis (strain MB2). They were obtained from gut of unknown fish, gut of Holothuria scabra, gut of Hexagrammos otakii, gut of Hexagrammos otakii, gut of Synechogobius hasta, and seawater. It is interesting to note that some marine yeast strains could produce alkaline phytase. This is the first report of marine yeast strains capable of producing extracellular phytase or cell-bound phytase. The results also indicated that phytase-producing marine yeasts were diverse enough to be used in bioremediation of marine phosphorous pollution. Key words: marine yeasts, phytase.Acceso al recurso -
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Interannual changes in the fish community abundance on the west coast of Campeche, Mexico
Pubblicato in Ciencias Marinas (2012)Fuente: Redalyc · Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: The biodiversity and abundance of commercially important biotic resources on the west coast of Campeche (Mexico) is recognized. The main extraction activity is seabob shrimp fishing. This paper aims to analyze and discuss changes in the abundance of the fish community in two annual cycles by statistical analysis. Between February 2003 and January 2004 (cycle 1) and between February 2006 and January 2007 (cycle 2), 37 sites were visited monthly. Physical and chemical parameters were registered and nekton samples were collected by a trawl net. In cycle 1, 49,177 individuals (631.62 kg total weight) were caught and the fish community was represented by 94 species. In cycle 2, 26,386 individuals (407.07 kg total weight) and 94 species were caught. At spatial scale, the fish community abundance values were 0.01–0.23 ind m–2, 0.08–3.02 g m–2, and 7.12–45.45 g ind–1 in cycle 1, and 0.007–0.11 ind m–2, 0.13–1.71 g m–2, and 5.61–45.64 g ind–1 in cycle 2. Highest abundance was recorded during the dry season in cycle 1, but during the rainy season in cycle 2. There were no significant differences in temperature and salinity between the two cycles, but an analysis of variance revealed significant differences between seasons. Significant differences were founded when the matrix of number of individuals per species and month of both cycles was analyzed by multidimensional scaling. La porción occidental de la costa de Campeche es reconocida por su biodiversidad y abundancia de recursos bióticos de interés comercial. La principal actividad de extracción que se desarrolla es la pesca del camarón siete barbas. En este trabajo se analizan y discuten los cambios en la abundancia de la comunidad de peces en dos ciclos anuales de muestreo con base en análisis estadísticos. Durante el periodo de febrero de 2003 a enero de 2004 (ciclo 1) y el periodo de febrero de 2006 a enero de 2007 (ciclo 2) se visitaron 37 sitios mensualmente. Se registraron parámetros fsicoquímicos y se recolectaron muestras del necton con una red de arrastre de prueba camaronera. En el ciclo 1 se capturaron 49,177 organismos (631.6 kg) que se agruparon en 94 especies de peces. En el ciclo 2 se recolectaron 26,386 organismos (407.07 kg) que se agruparon también en 94 especies. En escala espacial, los vaores de la abundancia de la comunidad de peces en el ciclo 1 fueron 0.01–0.23 ind m–2, 0.08–3.02 g m–2 y 7.12 a 45.45 g ind–1 y en el ciclo 2 fueron de 0.007–0.11 ind m–2, 0.13–1.71 g m–2 y 5.61–45.64 g ind–1. La mayor abundancia se registró en el ciclo 1 durante la época de secas. En el ciclo 2 la mayor abundancia se registró en la época de lluvias. Según el análisis de varianza, no se encontraron diferencias significativas entre la temperatura y la salinidad entre ambos ciclos; sin embargo, se encontraron diferencias entre las épocas climáticas. El análisis de la matriz de número de individuos por especie y por mes mediante el escalamiento multidimensional mostró diferencias significativas.Acceso al recurso -
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Cambios temporales en la abundancia y la alimentación de una comunidad de peces marinos en una laguna costera del sureste mexicano
Pubblicato in Ciencias Marinas (2021)Fuente: Ciencias MarinasTipo de material: Artículo científicoDescripción: Coastal lagoons are systems that are dominated by the environmental variability caused by seasonal or diel cycles, with a direct effect on fish community composition. The aim of this study was to evaluate the species composition of the fish communities on 2 seasonal scales and analyze the diet composition of marine fish species that use the lagoon at some stage of their life cycles. The study took place in the Carbonera lagoon on the northern coast of Yucatán. Fishes were collected bimonthly (from December 2010 to October 2011) every 2 h using a beach seine net over 24-h cycles. Hydrologic variables and fish community composition were evaluated at nychthemeral and seasonal scales, and significant changes in temperature and salinity were observed. Species richness and diversity of fishes were higher during the night time, with marine species like pigfish (Orthopristis chrysoptera), silver perch (Bairdiella chrysoura), striped mojarra (Eugerres plumieri), and grunts (Haemulon plumieri). Abundance was highest during the daytime because of the presence of schools of juvenile herrings (Harengula clupeola) and residents species (Floridichthys polyommus and Fundulus persimilis). The diet composition of 10 juvenile marine species were analyzed, and four main trophic guilds (piscivores, detritivores, mollusk feeders, and zoobenthivores) were found. The juvenile marine species of commercial value that use the Carbonera lagoon for feeding purposes are mullets, herrings, and grunts. Thus, this system provides resources for juvenile species that are important in artisanal fisheries, and it is therefore very important to make management plans for its protection and conservation. Las lagunas costeras son sistemas dominados por la variabilidad ambiental ocasionada por ciclos estacionales o nictémeros, lo cual influye directamente en la composición de especies como la de los peces. El objetivo de este estudio fue evaluar la variación en la composición de la comunidad de peces a 2 escalas temporales y analizar la dieta de especies marinas que utilizan la laguna en alguna etapa de su ciclo de vida. El estudio se realizó en la laguna Carbonera en la costa norte de Yucatán, México. Se recolectaron peces cada 2 h con un chinchorro playero durante un ciclo de 24 h, en campañas bimestrales de diciembre de 2010 a octubre de 2011. Las variables hidrológicas registradas y la comunidad de peces se evaluaron a escala nictémera y estacional, y se observaron cambios significativos en la temperatura y la salinidad. La riqueza específica y la diversidad de peces fueron mayores durante la noche, cuando se registraron especies marinas como los armados (Orthopristis chrysoptera), las corvinas (Bairdiella chrysoura), las mojarras (Eugerres plumieri) y los roncos (Haemulon plumierii). La mayor abundancia se obtuvo durante las horas de luz debido a la presencia de cardúmenes de juveniles de sardina (Harengula clupeola) y especies residentes (Floridichthys polyommus y Fundulus persimilis). Se analizó la alimentación de 10 especies de peces marinos en estadio juvenil, y se identificaron 4 principales gremios tróficos (piscívoros, detritívoros, malacófagos y zoobentófagos). Las especies marinas en estadio juvenil de importancia comercial que utilizan la laguna Carbonera para alimentación son las lisas, las sardinas y los roncos. Por lo tanto, este sistema brinda recursos a juveniles de especies de gran importancia para la pesca artesanal, por lo que es de suma importancia elaborar estrategias de manejo para su protección y conservación.Acceso al recurso -
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Estructura termohalina y flujo geostrófico, en el golfo de California, durante 1992
Pubblicato in Ciencias Marinas (1992)Fuente: SIBUMAR · Ciencias MarinasTipo de material: LibroDescripción: Hydrographic data from two cruises, taken in February and August 1992, were used to describe the vertical thermohaline structure, the presence of water masses in the region of the mouth and central part of the Gulf of California, and meridional and zonal flows, respectively. The observations presented here show a marked thermal change between both seasons, with surface temperatures of about 19.00ºC in February and 32.00ºC in August. Thermal maxima (32.75ºC) and salinity minima (33.00) define a significant presence of Tropical water in the interior of the gulf in 1992, which suggests the occurrence of the El Niño phenomenon. This condition increased the intensity of the geostrophic flow and, in the central part of the gulf, velocities of 95 cm s–1 were recorded in February and of ll5 cm s–1 in August. Con datos hidrográficos de dos cruceros, tomados en febrero y agosto de 1992, se describe la estructura vertical termohalina, la presencia de masas de agua en la región de la boca y parte central del golfo de California, y los flujos meridional y zonal, respectivamente. Las observaciones presentadas aquí muestran un cambio térmico muy marcado entre ambas épocas de estudio, con temperaturas superficiales alrededor de 19.00ºC para febrero y 32.00ºC para agosto. Los máximos de temperatura (32.75ºC) y mínimos de salinidad (33.00) definen una presencia significativa de agua tropical en el interior del golfo en 1992, lo que sugiere la ocurrencia del fenómeno El Niño. Esta condición incrementó la intensidad del flujo geostrófico, y en la parte central del golfo se observaron velocidades de 95 cm s–1 en febrero y 115 cm s–1 en agosto.Acceso al recurso